OSI耐药细胞模型建立与验证
构建并验证对奥希替尼耐药的NSCLC细胞模型,为后续实验提供基础。
将H1975和HCC827亲本细胞暴露于梯度递增浓度的奥希替尼(0.2-10 μM),经过约6个月筛选建立耐药细胞系;通过MTT、克隆形成、迁移实验及EMT标志物检测验证耐药特征。
A novel biguanide-derivative promotes NEDD4-mediated FGFR1 ubiquitination through BMI1 to overcome osimertinib resistance in NSCLC.
包含体外细胞模型、体内移植瘤模型和临床样本分析等多个独立证据层级,并明确机制验证。
H1975P/H1975R细胞系 HCC827P/HCC827R细胞系 H1975R细胞异种移植瘤模型 NSCLC患者组织样本
OSI耐药细胞系建立方法(梯度递增OSI浓度,约6个月) SMK-010剂量(2 μM用于体外,6 mg/kg/天腹腔注射用于体内) OSI剂量(2 μM用于体外,5 mg/kg/天口服灌胃用于体内) BMI1和FGFR1在临床样本中的表达与OSI耐药相关性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建并验证对奥希替尼耐药的NSCLC细胞模型,为后续实验提供基础。
将H1975和HCC827亲本细胞暴露于梯度递增浓度的奥希替尼(0.2-10 μM),经过约6个月筛选建立耐药细胞系;通过MTT、克隆形成、迁移实验及EMT标志物检测验证耐药特征。
从多个双胍衍生物中筛选出与奥希替尼协同效果最佳的化合物。
在H1975R细胞中,将10种双胍衍生物与OSI(2 μM)联合处理,通过MTT检测细胞活力,计算联合指数(CI),确定最佳组合。
验证SMK-010与奥希替尼联合对耐药细胞增殖、克隆形成和迁移的影响。
使用H1975R和HCC827R细胞,进行克隆形成和Transwell迁移实验,比较OSI单药与联合SMK-010的效果。
鉴定SMK-010处理后的差异表达蛋白,并验证FGFR1作为关键靶点。
对H1975R细胞进行SMK-010处理(6 μM,24小时),进行无标记定量蛋白质组学,鉴定差异蛋白;通过Western blot验证FGFR1蛋白水平下降,并检查下游AKT和ERK1/2磷酸化水平。
确定BMI1对FGFR1的调控方式及NEDD4在其中的作用。
通过siRNA敲低BMI1或FGFR1,检测蛋白和mRNA水平;利用放线菌酮跟踪蛋白半衰期;使用MG132和CQ区分蛋白酶体和溶酶体降解途径;siRNA敲低NEDD4或CBL检测对FGFR1降解的影响;Co-IP检测FGFR1泛素化水平。
检测敲低BMI1或FGFR1以及药理学抑制剂对耐药细胞对奥希替尼敏感性的影响。
使用siRNA敲低BMI1或FGFR1,或使用抑制剂PTC-209(BMI1抑制剂)和PD173074(FGFR1抑制剂),进行MTT细胞增殖实验和克隆形成实验,评估对OSI敏感性的影响并计算联合指数。
阐明SMK-010如何抑制BMI1并促进FGFR1降解。
通过Western blot检测BMI1水平;RT-qPCR检测FGFR1 mRNA水平;利用CHX追踪蛋白半衰期;使用CQ和MG132确定降解途径;siRNA敲低NEDD4或CBL检测FGFR1降解变化;Co-IP检测泛素化水平。
验证联合治疗是否抑制同源重组并增加DNA损伤。
进行RNA-seq分析敲低BMI1或FGFR1后差异基因及富集通路;RT-qPCR验证HR相关基因表达;使用同源重组报告质粒(pDRGFP和pCBASce-I)检测HR活性;通过免疫荧光检测p-H2AX表达。
评估SMK-010联合奥希替尼在体内对OSI耐药肿瘤的抑制作用及安全性。
使用H1975R异种移植瘤模型,将荷瘤小鼠随机分组,每日分别给予载体、OSI、SMK-010和联合治疗,测量肿瘤体积和体重;通过HE染色及ALT/AST检测评估毒性;Western blot检测肿瘤组织中FGFR1和BMI1表达。
评估BMI1和FGFR1在NSCLC患者组织中的表达及其与奥希替尼耐药和预后的关系。
收集NSCLC手术样本(21例),通过免疫组化检测BMI1和FGFR1表达;在配对样本(16例)比较耐药前后表达变化;使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析表达与总生存期的关联。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞活性检测 | 甲基噻唑基四唑(MTT) | -- | -- |
| 药物处理 | PTC-209 | Selleck Chemicals | -- |
| PD173074 | Selleck Chemicals | -- | |
| 奥希替尼 | Selleck Chemicals | -- | |
| 蛋白质检测 | PVDF膜 | -- | -- |
| 转染 | Lipofectamine 6,000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 蛋白降解研究 | MG132 | -- | -- |
| 氯喹 | -- | -- | |
| 免疫沉淀 | Protein A/G磁珠 | Santa Cruz | -- |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | Beyotime | -- |
| 同源重组检测 | pDRGFP质粒 | AddGene | -- |
| pCBASce-I质粒 | AddGene | -- | |
| 动物实验 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| BALB/c裸鼠 | Hunan Slack Jingda Experimental Animal Company | -- | |
| 细胞增殖 | CompuSyn软件 | CompuSyn, Inc. | -- |
| 数据处理 | SPSS软件 | IBM | -- |
| GraphPad Prism 9.0软件 | GraphPad, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 培养基成分(RPMI-1640、10% FBS),培养条件(37°C、5% CO2),细胞系来源 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and reagents |
| MTT实验 | 细胞接种密度、药物处理时间、MTT浓度、测量波长(550 nm) 阅读提示:Materials and methods: Cell viability assay; Figure 1 legend |
| 克隆形成实验 | 细胞接种密度(2×10^3细胞/孔) 阅读提示:Materials and methods: Clonogenic growth assay; Figure 1 legend |
| Transwell迁移实验 | 细胞接种数(4×10^4细胞)、上室体积(200 μL)、下室培养基体积(700 μL)、孵育时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: Transwell assay; Figure 1 legend |
| Western blot | 蛋白提取量、抗体信息(Table S2)、显影系统 阅读提示:Materials and methods: Western blotting |
| 蛋白质降解分析 | 放线菌酮浓度、MG132和CQ浓度(文中未明确说明) 阅读提示:Materials and methods: Western blotting; Results sections |
| RNA-seq | RNA质量、文库构建试剂盒、测序平台(G400/T7/T10)、分析软件 阅读提示:Materials and methods: RNA-seq |
| IP-MS | 蛋白量(1000 μg)、抗体(anti-BMI1、anti-FGFR1)、质谱仪(Q Exactive) 阅读提示:Materials and methods: Immunoprecipitation, IP-MS |
| 体内实验 | 动物品系(BALB/c裸鼠)、细胞注射量(0.2 mL Matrigel)、给药剂量(OSI 5 mg/kg;SMK-010 6 mg/kg)、给药方式(口服/腹腔)、频次(每日)、治疗周期(第14-29天) 阅读提示:Materials and methods: Cell line-derived xenograft models; Figure 7 legend |
| 临床样本分析 | 样本来源、伦理审批、IHC评分标准 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry; Figure 8 legend |