组蛋白乙酰化对FGA表达的调控
探究TSA及HDACs对FGA表达和凋亡相关基因的影响
用TSA处理KGN细胞,检测凋亡基因及FGA表达;敲低HDAC1/2/3后检测FGA及凋亡基因表达。
FGA, a new target of histone acetylation, inhibits apoptosis of granulosa cells in follicles.
包含细胞模型(KGN)功能实验、猪卵泡体外培养、小鼠体内实验及ChIP等机制验证,证据层级多样。
人卵巢颗粒细胞系KGN 猪卵泡(3-5 mm) C57BL/6J小鼠 小鼠卵巢组织
TSA处理浓度0.5 µM si-HDAC2及si-FGA转染序列 LV-FGA和sh-FGA慢病毒体内注射方案(每周一次,共三周) 小鼠分组及样本量(LV-NC n=5, LV-FGA n=8, sh-NC n=5, sh-FGA n=8) FGA启动子P3区域(-1350/-1454 bp)的H3K9ac富集
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究TSA及HDACs对FGA表达和凋亡相关基因的影响
用TSA处理KGN细胞,检测凋亡基因及FGA表达;敲低HDAC1/2/3后检测FGA及凋亡基因表达。
验证HDAC2敲低是否通过改变H3K9ac富集和染色质可及性影响FGA转录
ChIP-qPCR检测FGA启动子P1-P5区H3K9ac富集,染色质可及性实验检测P1-P5区可及性。
探究FGA对GCs增殖和细胞周期的影响
过表达或敲低FGA后,用EdU检测增殖,流式检测周期,RT-qPCR和Western blot检测增殖和周期相关基因。
验证FGA是否抑制凋亡及是否与Caspase3结合
过表达或敲低FGA后,流式检测凋亡,RT-qPCR和Western blot检测凋亡相关基因,Co-IP验证FGA与Caspase3结合,核质分离检测Caspase3分布。
在猪卵泡模型中验证FGA对卵泡发育和凋亡的影响
分离3-5mm猪卵泡,用LV-FGA或sh-FGA慢病毒感染,观察卵泡生长,TUNEL检测凋亡,RT-qPCR和Western blot检测相关基因。
验证FGA对小鼠卵泡发育、排卵和性成熟的影响
给3周龄C57BL/6J小鼠腹腔注射LV-FGA或sh-FGA慢病毒,每周一次共三周,42日龄处死,检测E2水平、HE染色、TUNEL凋亡、RT-qPCR和Western blot。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Hyclone | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Scientific | -- |
| RT-qPCR | RNAfast200总RNA提取试剂盒 | Feijie | -- |
| PrimeScript RT Master Mix | TaKaRa | -- | |
| Hieff qPCR SYBR Green预混液(2x) | YEASEN | -- | |
| CFX96 Touch实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 增殖检测 | Cell-Light EdU Apollo 567体外试剂盒 | RiboBio | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | BioVision | -- |
| 细胞周期 | 细胞周期检测试剂盒 | KeyGEN | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Bestbio | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Biosharp | -- | |
| BCA蛋白测定试剂盒 | Biosharp | -- | |
| FGA抗体 | Proteintech | 20645-1-AP | |
| GSK-3β抗体 | Proteintech | 4198-1-AP | |
| MCL1抗体 | Signalway | 38113 | |
| PCNA抗体 | Proteintech | 60097-1-Ig | |
| STAR抗体 | Bioss | bs-20387R | |
| BIM抗体 | Signalway | 21280-1 | |
| CCNE1抗体 | Affinity | AF4713 | |
| CCND1抗体 | Affinity | AF0931 | |
| Caspase3抗体 | Affinity | AF6311 | |
| Caspase8抗体 | Affinity | AF6442 | |
| Caspase9抗体 | Affinity | AF6348 | |
| α-微管蛋白抗体 | Proteintech | 10068-1-Ap | |
| GAPDH抗体 | Immunoway | YN5585 | |
| P53抗体 | Proteintech | 10442-1-AP | |
| CDK4抗体 | Affinity | DF6102 | |
| P65抗体 | Proteintech | 10745-1-AP | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | abcam | ab205718 | |
| 山羊抗小鼠IgG | Signalway | L3032-1 | |
| HE染色 | HE染色 | Servicebio | -- |
| ELISA | 小鼠E2 ELISA试剂盒 | Jingmei Biotechnology Co | JM-02849 |
| TUNEL检测 | 荧光TUNEL检测 | Servicebio | -- |
| 蛋白酶K | Servicebio | -- | |
| ChIP | MIKX染色质免疫沉淀(ChIP)试剂盒 | MIKX | -- |
| 染色质可及性 | Epigen TEK EpiQuik染色质可及性检测试剂盒 | Epigentek | -- |
| Co-IP | ACE rProtein A/G磁性免疫沉淀/免疫共沉淀试剂盒 | ACE | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | KGN细胞系来源(Pricella)、培养基DMEM+10%FBS、培养条件37℃, 5% CO2 阅读提示:Methods: Cell culture |
| 药物处理 | TSA浓度0.5 µM 阅读提示:Results 第一段 |
| 基因敲低/过表达 | siRNA序列(表1)、质粒浓度(文中未明确说明) 阅读提示:Methods: Transient transfection, Table 1 |
| 表达检测 | 引物序列(表2-4)、内参GAPDH、2^-ΔΔCt法 阅读提示:Methods: RT-qPCR, Tables 2-4 |
| 蛋白检测 | 抗体稀释比例(抗FGA 1:1000等)、蛋白上样量未明确 阅读提示:Methods: Western blot |
| ChIP | ChIP-qPCR引物(表5)、H3K9ac抗体(未列出具体货号) 阅读提示:Methods: ChIP, Table 5 |
| 猪卵泡培养 | 卵泡直径3-5 mm、培养基、培养温度38.5℃、慢病毒处理时间 阅读提示:Methods: Isolation and culture of porcine follicles |
| 小鼠实验 | 小鼠周龄(3周)、分组样本量、慢病毒注射频率及剂量(未明确)、处死时间(42天) 阅读提示:Methods: Animal experiment |