验证有丝分裂期间α-cat磷酸化水平
确定α-cat P-linker区域磷酸化是否在有丝分裂时增加。
使用HeLa细胞周期同步或nocodazole处理,免疫印迹检测α-cat在S641、S652和S655/T658的磷酸化水平。
α-catenin phosphorylation is elevated during mitosis to resist apical rounding and epithelial barrier leak.
包含α-cat磷酸化检测、CRISPR敲除细胞系重构、形态学定量、屏障渗漏实验和PLA定位等多层级验证。
HeLa细胞 MDCK II细胞 α-cat CRISPR敲除MDCK细胞
细胞周期同步方法:双胸苷阻断或nocodazole处理 α-cat磷酸化位点:S641, S652, S655/T658 GFP-α-cat重构细胞系:WT, 4A, 4E 屏障渗漏检测:生物素化胶原IV和链霉亲和素-Alexa568 定量:细胞面积、渗漏面积和数量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定α-cat P-linker区域磷酸化是否在有丝分裂时增加。
使用HeLa细胞周期同步或nocodazole处理,免疫印迹检测α-cat在S641、S652和S655/T658的磷酸化水平。
评估α-cat P-linker磷酸化对细胞形态的影响。
在α-cat CRISPR KO MDCK细胞中表达GFP标记的α-cat WT、4A和4E突变体,用免疫印迹验证表达。
比较不同α-cat突变体对有丝分裂细胞形状的影响。
新汇合细胞单层固定染色,共聚焦成像测量有丝分裂期细胞面积和顶端变圆程度。
检验α-cat磷酸化对分裂期间细胞间屏障功能的影响。
使用生物素化胶原IV和荧光标记的链霉亲和素检测新生单层的微小渗漏。
确定磷酸化α-cat在分裂细胞中的亚细胞定位。
使用磷酸化特异性抗体和PLA检测MDCK细胞中α-cat磷酸化的分布。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | R&D Systems | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Corning | -- | |
| 病毒包装 | TransIT转染试剂 | Mirus | -- |
| 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| 流式分选 | FACSMelody三激光分选仪 | BD Biosciences | -- |
| Western blot | 抗α-cat抗体(15D9) | Enzo Life Sciences | ALX-804-101 |
| 抗GFP抗体 | Invitrogen | A11122 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠和抗兔抗体 | Abcam | ab139417 | |
| 细胞周期和凋亡Western印迹混合抗体 | Abcam | ab136811 | |
| 免疫荧光 | 抗α-cat pS652抗体 | Cell Signaling Technology | 13061 |
| 抗α-cat pS655/T658抗体 | Cell Signaling Technology | 13231 | |
| 抗α-cat pS641抗体 | Signalway | 11330 | |
| Alexa Fluor 488标记的鬼笔环肽 | Invitrogen | A12379 | |
| Alexa Fluor 568标记的链霉亲和素 | Thermo Fisher Scientific | S11226 | |
| PLA | Duolink原位PLA抗兔PLUS探针 | Sigma-Aldrich | DUO92002 |
| Duolink原位PLA抗小鼠MINUS探针 | Sigma-Aldrich | DUO92004 | |
| Duolink连接酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Duolink红色扩增聚合酶 | Sigma-Aldrich | DUO92008 | |
| 通透性实验 | IV型胶原蛋白 | Sigma-Aldrich | C5533 |
| EZ-Link-NHS-LC-生物素 | Thermo Fisher Scientific | 21336 | |
| 成像设备 | Nikon Ti2宽场显微镜 | Nikon | -- |
| Nikon AXR共聚焦显微镜 | Nikon | -- | |
| 图像捕捉 | DS-Qi2相机 | Nikon | -- |
| 图像分析 | FIJI | -- | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism | -- | -- |
| 细胞培养 | Transwell滤器 | BD Biosciences | 353494 |
| 甲醇 | Sigma-Aldrich | MX0487-6 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞周期同步与磷酸化检测 | HeLa细胞同步方法(双胸苷阻断或nocodazole处理);用于免疫印迹的磷酸化抗体(pS641, pS652, pS655/T658);细胞周期阶段验证(actin, pY15 Cdk2, pS10-histone 3) 阅读提示:参见Results部分“α-cat phosphorylation is increased during mitosis”及图1图注 |
| 细胞系构建与培养 | MDCK II细胞培养条件(DMEM、10% FBS、青霉素/链霉素);细胞系:野生型、α-cat KO、以及表达GFP-α-cat-WT/4A/4E的细胞系;嘌呤霉素筛选浓度和GFP表达匹配 阅读提示:参见Materials and Methods部分“Cell culture and stable cell line selection” |
| 细胞形态定性与定量 | 生长时间(48小时)和细胞密度;固定和染色步骤(Hoechst, phalloidin, GFP信号);图像采集参数(20x物镜,Nikon Ti2或40x物镜,AXR);有丝分裂期判断标准(染色体形态) 阅读提示:参见Results部分“Phospho-mimic α-cat restrains mitotic apical rounding”及Materials and Methods部分“Immunofluorescence and imaging” |
| 屏障渗漏实验 | Collagen IV包被浓度(1 mg/ml)和生物素化条件(1.5 mg/ml, 4°C过夜);细胞接种密度(300,000/孔)和培养时间(48小时);链霉亲和素浓度(25 μg/ml)和处理时间(30 min, 4°C) 阅读提示:参见Materials and Methods部分“Epithelial permeability immunofluorescence assay” |
| 磷酸化α-cat定位检测 | 细胞培养时间(10天);固定方法(甲醇固定,-20°C);PLA试剂盒步骤(阻断、抗体孵育、探针、连接、扩增时间) 阅读提示:参见Materials and Methods部分“PLA” |