验证PRMT1对结直肠癌细胞糖酵解的影响
探究PRMT1是否调节结直肠癌细胞糖酵解
在HCT116和DLD1细胞中过表达或敲低PRMT1,或用PRMT1抑制剂GSK3368715处理,检测葡萄糖摄取、乳酸产生和细胞外酸化率(ECAR)。
PRMT1-mediated PGK1 arginine methylation promotes colorectal cancer glycolysis and tumorigenesis.
包括体外细胞实验、体内异种移植瘤模型、患者组织样本分析以及分子动力学模拟,涵盖功能验证和机制验证。
HCT116细胞 DLD1细胞 LOVO细胞 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
HCT116和DLD1细胞中PRMT1的过表达或敲低 PRMT1抑制剂GSK3368715处理(3.1 nM,48小时) PGK1 R206K突变体 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型(每组6只) 患者组织样本(96例和207例)的IHC分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究PRMT1是否调节结直肠癌细胞糖酵解
在HCT116和DLD1细胞中过表达或敲低PRMT1,或用PRMT1抑制剂GSK3368715处理,检测葡萄糖摄取、乳酸产生和细胞外酸化率(ECAR)。
确定PRMT1对PGK1的甲基化修饰位点
通过免疫沉淀结合质谱分析鉴定PGK1甲基化位点,构建R206K和R330K突变体,检测ADMA水平变化。
探究meR206-PGK1是否影响ERK介导的S203磷酸化及糖酵解功能
在HCT116和HEK293T细胞中表达野生型或R206K突变体PGK1,检测pS203-PGK1水平、PGK1-ERK相互作用、线粒体定位及糖酵解相关指标。
研究meR206-PGK1对线粒体功能的作用
在PRMT1过表达、敲低或GSK3368715处理的HCT116细胞中,以及稳定表达野生型或R206K突变体PGK1的细胞中,检测OCR和PDHK1/PDHA1磷酸化水平。
评估该通路在体外和体内对肿瘤生长的作用
通过CCK-8和集落形成实验检测细胞增殖,通过裸鼠皮下移植瘤模型评估GSK3368715处理和PGK1-R206K突变体对肿瘤生长的影响。
评估该通路在结直肠癌患者中的临床意义
通过免疫组化检测结直肠癌组织芯片和配对标本中PRMT1、meR206-PGK1和pS203-PGK1的表达,并分析表达相关性和患者生存。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | KeyGEN BioTECH | KGL1207-500 |
| F12培养基 | KeyGEN BioTECH | KGL1304-500 | |
| siRNA转染 | siLenFect转染试剂 | Thermo Fisher Scientific Inc | -- |
| 质粒转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Life Technologies | -- |
| Western blot | 抗PRMT1抗体 | Proteintech | 11279-1-AP |
| 抗PGK1抗体 | Proteintech | 17811-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-AP | |
| 抗ADMA抗体 | Cell Signaling Technology | 13522S | |
| 抗Flag抗体 | Abmart | M29998 | |
| 抗pS203-PGK1抗体 | Signalway Antibody | SAB487P | |
| 抗meR206-PGK1抗体 | Signalway Antibody | SAB487P-1 | |
| 抗PDHA1抗体 | Abclonal | A22081 | |
| 抗p-PDHA1抗体 | Abclonal | AP1022 | |
| 抗PDHK1抗体 | Abclonal | A0834 | |
| 抗p-PDHK1抗体 | Signalway Antibody | 11596 | |
| 抗ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695S | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370S | |
| 药物处理 | SCH772984 | MedChemExpress | HY-50846 |
| GSK3368715 | MedChemExpress | HY-128717A | |
| 抗体生产 | 抗meR206-PGK1抗体 | Gl biochem | -- |
| 免疫组化 | Ki-67抗体 | CST | 12202S |
| 代谢检测 | Seahorse XF96细胞外通量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| 葡萄糖检测试剂盒 | Shanghai Rongsheng Biotech | -- | |
| 乳酸检测试剂盒 | Shanghai Rongsheng Biotech | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | VICMID | VC5001L-500T |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(中国科学院细胞库)、培养基(DMEM或F12)、血清浓度(10% FBS)、培养条件(37°C、5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods, Cell Culture and cell treatment |
| siRNA和质粒转染 | siRNA浓度(50 nM)、转染试剂(siLenFect和Lipofectamine 2000) 阅读提示:Materials and Methods, Cell Culture and cell treatment |
| WB和抗体 | 特异性抗体(PRMT1、PGK1、GAPDH、ADMA、Flag、pS203-PGK1、meR206-PGK1、PDHA1、p-PDHA1、PDHK1、p-PDHK1、ERK1/2、p-ERK1/2)及其稀释比例 阅读提示:Materials and Methods, Western blot analysis and antibodies |
| 代谢检测 | Seahorse分析仪型号(XF96)、葡萄糖摄取/乳酸检测试剂盒、ECAR/OCR检测条件(葡萄糖、寡霉素、2-DG、FCCP、抗霉素A/鱼藤酮浓度) 阅读提示:Materials and Methods, Seahorse assays, glucose uptake, and lactate production |
| 动物实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、周龄(6-8周)、细胞接种量(4×10^6)、GSK3368715剂量(100 mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、给药周期(每天一次,持续两周) 阅读提示:Materials and Methods, Animal work |
| 分子动力学模拟 | PDB ID(2WZB)、水模型(TIP3P)、离子浓度(150 mM KCl)、力场(CHARMM36)、模拟软件(NAMD2.12)、平衡时间(55 ns) 阅读提示:Materials and Methods, Molecular dynamics simulations and structure analysis |