验证卵巢癌的“铁成瘾”特征
比较卵巢癌细胞与正常卵巢上皮细胞及患者样本中铁水平和铁代谢基因表达,确认卵巢癌对铁的依赖性。
通过calcein-AM染色和Perl's铁染色检测细胞内铁水平;使用TCGA数据库分析铁代谢基因表达;Western blot检测TFRC、FTH1、FTL蛋白水平。
Iron promotes ovarian cancer malignancy and advances platinum resistance by enhancing DNA repair via FTH1/FTL/POLQ/RAD51 axis.
包含细胞系模型、TCGA数据分析、患者组织IHC、体内小鼠模型及功能验证(增殖、凋亡、周期、迁移、球体形成)和机制验证(POLQ/RAD51互作、DNA损伤)。
卵巢癌细胞系(SKOV3、A2780、COV362、Kuramochi) 永生化正常卵巢上皮细胞系(IOSE80) 小鼠卵巢癌同系腹腔转移模型(ID8细胞) 临床卵巢癌组织样本
铁处理浓度(FeCl3 100μM)及铁螯合剂浓度(DFO 30μM) 铂类药物处理浓度(Carboplatin 30μM) siRNA或shRNA敲除TFRC、FTH1、FTL、POLQ的效率验证 细胞培养条件(DMEM或RPMI1640含10%FBS,37°C,5%CO2) 动物模型建立及药物给药剂量(Carboplatin 10或5mg/kg,DFO 100mg/kg,Triapine 10mg/kg)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较卵巢癌细胞与正常卵巢上皮细胞及患者样本中铁水平和铁代谢基因表达,确认卵巢癌对铁的依赖性。
通过calcein-AM染色和Perl's铁染色检测细胞内铁水平;使用TCGA数据库分析铁代谢基因表达;Western blot检测TFRC、FTH1、FTL蛋白水平。
检测铁补充或螯合对细胞增殖、球体形成、迁移、凋亡和细胞周期的影响。
使用CCK-8、球体形成、划痕愈合、流式细胞术(凋亡、细胞周期)等方法,分别对细胞进行FeCl3、DFO、Triapine处理。
确定铁或铁螯合剂是否改变卵巢癌细胞对卡铂的敏感性。
通过CCK-8、集落形成和凋亡检测评估卡铂单用或联合FeCl3/DFO的效果;用γ-H2AX免疫荧光检测DNA损伤。
验证铁是否通过POLQ和RAD51调节DNA修复通路。
RNA-seq分析差异基因和通路;使用siRNA敲低POLQ或FTH1/FTL;免疫荧光检测POLQ、RAD51表达及共定位、γ-H2AX表达。
在小鼠卵巢癌模型中验证铁螯合剂联合卡铂是否能增强抗肿瘤疗效。
建立ID8腹腔转移模型,给予卡铂、DFO或Triapine单用或联合,通过活体成像监测肿瘤进展,记录体重、腹水量和生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 测序 | Illumina NovaseqTM 6000测序平台 | Illumina | -- |
| 转染 | Opti-MEM®培养基 | -- | -- |
| Lipo8000TM转染试剂 | Beyotime | C0533 | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8(CCK-8) | Absin | ads50003 |
| 细胞周期分析 | 细胞周期分析试剂盒 | Beyotime | C1052 |
| 凋亡分析 | 细胞周期与凋亡分析试剂盒 | Biosharp | BL110A |
| 流式分析 | BD LSRFortessa™ X-20流式细胞仪 | BD Bioscience | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Beyotime | P1045 | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗TFRC抗体 | Proteintech | 66180-1-Ig | |
| 抗FTH1抗体 | Signalway Antibody | 49644 | |
| 抗FTL抗体 | Proteintech | 10727-1-AP | |
| 抗POLQ抗体 | Fenghui Antibody | Fab4305 | |
| 抗RAD51抗体 | Proteintech | 67024-1-lg | |
| 抗磷酸化组蛋白H2AX(Ser139)抗体 | Beyotime | AF5836 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Proteintech | 66031-1-Ig | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 山羊抗兔二抗 | Epizyme | LF102 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Cell Signaling Technology | 7076S | |
| ECL底物 | Beyotime | P0018AM | |
| Tanon5200成像系统 | Tanon | -- | |
| 免疫组织化学 | 山羊抗小鼠/兔IgG聚合物酶标二抗 | ZSGB-BIO | PV-6000 |
| DAB显色液 | ZSGB-BIO | ZLI-9017 | |
| 免疫荧光 | 封闭液 | Beyotime | P0096 |
| 封闭液 | Beyotime | P0102 | |
| Alexa Fluor 555标记抗兔抗体 | Abmart | M213411M | |
| Alexa Fluor 488标记抗小鼠抗体 | Abmart | M21011M | |
| 含DAPI的抗淬灭封片剂 | Beyotime | P0131 | |
| 奥林巴斯FV3000共聚焦显微镜 | Olympus | -- | |
| DNA损伤检测 | γ-H2AX免疫荧光DNA损伤检测试剂盒 | Beyotime | C2035 |
| 莱卡DMI3000B荧光显微镜 | Leica | -- | |
| 铁染色 | 普鲁士蓝铁染色试剂盒 | Solarbio | G1424 |
| 铁定量 | 钙黄绿素乙酰氧基甲酯(calcein-AM) | Beyotime | C2012 |
| 动物实验 | 卡铂 | Macklin | 41575-94-4 |
| 去铁胺 | -- | -- | |
| 三吡啶 | Glpbio | GC13554 | |
| D-荧光素 | -- | -- | |
| In-vivo Xtreme活体成像系统 | Bruker | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件:SKOV3、A2780、COV362、Kuramochi、IOSE80,培养基(DMEM或RPMI1640)含10%FBS和青霉素-链霉素,37°C、5%CO2。 阅读提示:Materials and methods - Cell culture |
| 铁处理 | 铁补充剂FeCl3浓度(100μM)和铁螯合剂DFO浓度(30μM)以及处理时间。 阅读提示:Materials and methods - Cell culture及Figure legends(图1-5,7) |
| 药物处理 | 卡铂浓度(30μM)及处理时间(72h) 阅读提示:Materials and methods - RNA sequencing及Figure legends(图5-7) |
| 基因敲低 | siRNA序列及转染方法(使用Lipo8000,siRNA浓度100pmol),敲低效率验证(Western blot)。 阅读提示:Materials and methods - Cell transfection |
| DNA损伤检测 | γ-H2AX免疫荧光检测试剂盒(C2035)及处理时间(72h)。 阅读提示:Materials and methods - Immunofluorescence assay for DNA damage |
| 动物实验 | 小鼠品系(C57BL/6J)、周龄(5周)、雌性;细胞系(ID8-luciferase)、接种数量(5×10^6,腹腔);药物剂量(卡铂10或5mg/kg口服,DFO 100mg/kg口服,Triapine 10mg/kg腹腔)、给药频率(隔天一次,持续3周)。 阅读提示:Materials and methods - Mouse ovarian cancer model |
| 临床样本 | 人卵巢癌组织样本获取方式(Affiliated Hospital of Guangdong Medical University,知情同意,伦理批准),IHC染色步骤。 阅读提示:Materials and methods - Immunohistochemistry (IHC) |