临床队列分析发现HPD患者
评估免疫治疗是否与部分患者快速进展相关
分析了密歇根大学的转移性黑色素瘤和非小细胞肺癌患者队列,以及随机对照试验的汇总数据,比较免疫治疗与其他治疗的总生存期和无进展生存期,并识别出快速进展的患者。
Intersection of immune and oncometabolic pathways drives cancer hyperprogression during immunotherapy.
研究包含临床队列分析、患者肿瘤免疫微环境检测、体外细胞实验、多种小鼠肿瘤模型的功能验证和机制验证,并通过基因敲除和药理学干预确认信号通路。
人类黑色素瘤患者队列 人类NSCLC患者队列 YUMM1.7小鼠黑色素瘤模型 PLC2.4小鼠肺癌模型
临床队列中HPD定义标准(Champiat等标准) YUMM1.7细胞接种数量(10^5)和处理时间点 抗PD-L1抗体给药剂量和时间(5 mg/kg,第0,3,6,9,12,15天) IFNγ处理浓度(10 ng/ml)和时间(24或48小时) PKM2激活剂ML-265的给药剂量(50 mg/kg,每隔一天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估免疫治疗是否与部分患者快速进展相关
分析了密歇根大学的转移性黑色素瘤和非小细胞肺癌患者队列,以及随机对照试验的汇总数据,比较免疫治疗与其他治疗的总生存期和无进展生存期,并识别出快速进展的患者。
探索HPD肿瘤中的免疫特征和致癌通路激活状态
对接受免疫治疗并发生CR或HPD的患者肿瘤组织进行RNA测序分析免疫基因签名和致癌信号通路,并用多重免疫荧光染色验证CD8+ T细胞浸润以及FGF2、MYC、CD133表达。
确定ICB是否依赖CD8+ T细胞和IFNγ促进肿瘤进展
测试多个小鼠肿瘤细胞系对PD-L1抗体的反应,选出YUMM1.7和PLC2.4作为HPD模型;通过CD8抗体清除CD8+ T细胞或敲除IFNGR1/STAT1基因,观察对肿瘤生长的影响。
阐明IFNγ是如何激活β-catenin信号通路
用IFNγ处理多种细胞系,检测β-catenin靶基因表达、报告基因活性、β-catenin乙酰化水平,并使用β-catenin抑制剂和NAD+前体恢复实验验证机制。
确定IFNγ调节糖酵解和PKM2活性的分子机制
检测IFNγ对糖酵解率、乳酸产生、PKM2磷酸化和NAD+水平的影响;使用PKM2激活剂DASA-58和ML-265验证其对β-catenin信号的抑制作用;并鉴定FGF2是IFNγ调控PKM2的上游信号。
验证靶向PKM2或FGF2能否逆转ICB诱导的肿瘤进展
在YUMM1.7肿瘤模型中,联合抗PD-L1和ML-265治疗;在PLC2.4-shFgf2和MC38-Fgf2OE模型中,评估抗PD-L1治疗对肿瘤生长的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | #11965 |
| RPMI培养基 | Gibco | #11875 | |
| 免疫荧光 | OPAL四色免疫组化试剂盒 | Akoya Biosciences | NEL810001KT |
| 动物实验 | 抗PD-L1抗体 | Bio X Cell | BE0101 |
| 抗CTLA-4抗体 | Bio X Cell | BE0131 | |
| 抗CD8α抗体 | Bio X Cell | BE0117 | |
| 人IFNγ | R&D Systems | 285-IF | |
| ML-265 | Cayman Chemical | 13942 | |
| 药物处理 | DASA-58 | Cayman Chemical | 13941 |
| Wnt-C59 | Cayman Chemical | 16644 | |
| 烟酰胺核糖苷 | Cayman Chemical | 23132 | |
| β-烟酰胺单核苷酸 | Cayman Chemical | 16411 | |
| 代谢分析 | 乳酸检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK064 |
| NAD/NADH定量试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK037 | |
| 蛋白质分析 | 抗FGF2抗体 | Abcam | ab92337 |
| 抗磷酸化PKM2 (Y105)抗体 | Cell Signaling Technology | 3827 | |
| 抗PKM2抗体 | Proteintech | 15822 | |
| 抗SIRT1抗体 | Cell Signaling Technology | 2028 | |
| 流式细胞术 | 抗CD44抗体 | BD Biosciences | 561860 |
| 抗CD133抗体 | BioLegend | 141207 | |
| 抗MYC抗体 | Cell Signaling Technology | 13987 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床队列分析 | HPD定义标准(Champiat等)、患者队列纳入标准、治疗类型和剂量 阅读提示:STAR Methods - Human Studies, Figure 1 |
| 患者肿瘤组织分析 | 多重免疫荧光染色的抗体信息、染色的条件(抗原修复、抗体稀释度)、CD8+ T细胞定量方法 阅读提示:STAR Methods - Multiplex immunofluorescence staining and analysis, Figure 2 |
| 动物模型建立 | 细胞系来源、细胞接种数量(YUMM1.7, 10^5)、小鼠品系和性别、肿瘤体积计算方法 阅读提示:STAR Methods - Tumor models, Figure 3 |
| 动物实验处理 | 抗体给药剂量和时间(抗PD-L1 5 mg/kg, 第0,3,6,9,12,15天)、给药途径(腹腔注射)、ML-265剂量(50 mg/kg)和频率 阅读提示:STAR Methods - Animal experiments, Figure 5M |
| 体外细胞实验 | 细胞培养条件(培养基、血清、密度)、IFNγ处理浓度(10 ng/ml)和时间、PKM2激活剂和抑制剂浓度 阅读提示:STAR Methods - Cell Culture、Cell lines, Figure 4,5,6 |
| 代谢检测 | Seahorse分析实验条件(细胞数量、底物浓度)、乳酸和NAD+检测试剂盒 阅读提示:STAR Methods - Extracellular acidification (ECAR)、Quantification of lactate, NAD+/NADH and pyruvate |