细胞系筛选与特征评估
评估多种结直肠癌细胞系的球体形成能力、迁移能力及FAK/AKT/干细胞标志物表达,选择后续实验的细胞系。
检测HT29、HCT116、SW480、SW620和RKO五种细胞系的球体形成、迁移能力及FAK、p-FAK、AKT、p-AKT和干细胞标志物表达。
FAK downregulation suppresses stem-like properties and migration of human colorectal cancer cells.
包含细胞功能实验(球体形成、划痕愈合)、蛋白表达检测(Western blot、免疫细胞化学)、机制验证(免疫共沉淀)和抑制剂处理,但缺乏动物模型和患者样本。
HT29人结直肠癌细胞系 RKO人结直肠癌细胞系 HCT116、SW480、SW620人结直肠癌细胞系(初步筛选)
细胞系:HT29和RKO FAK抑制剂PF-562271处理浓度:5 μM,处理时间:24小时 AKT抑制剂MK-2206 2HCl处理浓度:25 μM,处理时间:24小时 FAK敲低:Lenti-FAK-EGFP-miR转染RKO细胞,MOI=30 球体形成实验:1000细胞/孔,非贴壁6孔板,培养7天,计数直径>75 μm的球体
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估多种结直肠癌细胞系的球体形成能力、迁移能力及FAK/AKT/干细胞标志物表达,选择后续实验的细胞系。
检测HT29、HCT116、SW480、SW620和RKO五种细胞系的球体形成、迁移能力及FAK、p-FAK、AKT、p-AKT和干细胞标志物表达。
验证AKT抑制是否通过降低p-AKT影响结直肠癌细胞干性和迁移。
用AKT抑制剂MK-2206 2HCl处理HT29和RKO细胞,检测干细胞标志物表达、球体形成和迁移能力。
验证FAK抑制是否通过FAK/p-FAK/p-AKT轴影响结直肠癌细胞干性和迁移。
用FAK抑制剂PF-562271处理HT29和RKO细胞,检测FAK、p-FAK、p-AKT、干细胞标志物表达、球体形成和迁移能力。
验证FAK下调是否通过降低p-AKT抑制结直肠癌细胞干性和迁移。
用Lenti-FAK-EGFP-miR稳定转染RKO细胞敲低FAK,检测FAK mRNA和蛋白水平、p-AKT、干细胞标志物表达、球体形成和迁移能力。
验证FAK与AKT蛋白是否直接相互作用,支持FAK调控AKT磷酸化的机制。
通过免疫共沉淀(co-IP)检测RKO细胞中FAK与AKT的相互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | -- | |
| 表皮生长因子 | PeproTech | AF 10015 | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | PeproTech | 10018 B | |
| B27添加剂 | Gibco | 17504044 | |
| 球体形成实验 | 非贴壁6孔板 | Corning | 3471 |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | -- | -- | |
| 磷酸酶抑制剂 | -- | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| Odyssey红外成像系统 | LI-COR | -- | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-1g | |
| FAK抗体 | Proteintech | 12636-1-AP | |
| CD133抗体 | Proteintech | 18470-1-AP | |
| CD44抗体 | Proteintech | 15675-1-AP | |
| Nanog抗体 | Proteintech | 14295-1-AP | |
| Sox2抗体 | Proteintech | 66411-1-1g | |
| c-Myc抗体 | Proteintech | 10828-1-AP | |
| 磷酸化AKT (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 磷酸化FAK (Tyr397)抗体 | Signalway Antibody | 11215 | |
| OCT4抗体 | Wanleibio | WL02020 | |
| IRDye 680RD羊抗兔二抗 | LI-COR | 926-68071 | |
| IRDye 680RD羊抗小鼠二抗 | LI-COR | 925-68070 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | 日本同仁 | 5007 |
| 酶标仪 | BioTek | ELX800 | |
| 药物处理 | PF-562271 | Selleck | -- |
| MK-2206 2HCl | Selleck | -- | |
| 免疫组织化学 | 甲醇 | -- | -- |
| 过氧化氢 | -- | -- | |
| 正常山羊血清 | -- | -- | |
| 生物素化二抗 | -- | -- | |
| 亲和素/生物素复合物 | -- | -- | |
| DAB显色液 | -- | -- | |
| Image Pro Plus图像分析软件 | -- | -- | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G琼脂糖珠 | Pierce | 78609 |
| 非免疫血清 | -- | -- | |
| 兔抗IgG | -- | -- | |
| 2x上样缓冲液 | -- | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Pierce | -- | |
| 医用X光胶片 | -- | -- | |
| RT-qPCR | RNA提取试剂盒 | TIANGEN | -- |
| 逆转录试剂盒 | TaKaRa | -- | |
| SYBR Green预混液 | Roche | -- | |
| 实时荧光定量PCR仪 | ABI | -- | |
| GAPDH引物 | TaKaRa | -- | |
| FAK引物 | TaKaRa | -- | |
| 转染 | 慢病毒-FAK-EGFP-miR | 上海R&S生物技术有限公司 | -- |
| 慢病毒-EGFP-miR(对照) | 上海R&S生物技术有限公司 | -- | |
| 划痕愈合实验 | 尼康显微镜软件 | Nikon | -- |
| 统计分析 | SPSS 20.0 | IBM | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系选择 | HT29和RKO细胞系;其他细胞系(HCT116、SW480、SW620)也有检测 阅读提示:见Materials and methods: Cell culture and transfection; Results: 第一部分 |
| 抑制剂处理 | MK-2206 2HCl浓度25 μM,处理24小时;PF-562271浓度5 μM,处理24小时 阅读提示:见Materials and methods: Cell viability; Results: 关于抑制剂的部分 |
| FAK敲低 | Lenti-FAK-EGFP-miR转染RKO细胞,MOI=30;对照Lenti-EGFP-miR 阅读提示:见Materials and methods: Cell culture and transfection |
| 球体形成实验 | 细胞接种密度1×10^3/孔,非贴壁6孔板,培养7天,计数直径>75 μm的球体 阅读提示:见Materials and methods: Spheroid formation assay |
| Western blot | 抗体稀释比例:GAPDH 1:2000, FAK 1:2000, CD133 1:1000, CD44 1:2000, Nanog 1:2000, Sox2 1:2000, c-Myc 1:1000, p-AKT 1:1000, AKT 1:1000, FAK pY397 1:1000, OCT4 1:1000;二抗1:10000 阅读提示:见Materials and methods: Western blotting analysis |
| 划痕愈合实验 | 细胞铺板至80-90%汇合度,划痕,0h和24h观察迁移距离 阅读提示:见Materials and methods: Wound healing assay |
| 免疫共沉淀 | 使用10 μg抗FAK抗体,Protein G Sepharose,IgG对照 阅读提示:见Materials and methods: Co-Immunoprecipitation |