体内肺纤维化模型建立与ALA治疗
验证ALA对博来霉素诱导的肺纤维化及成纤维细胞活化的影响
使用BLM气管内滴注建立小鼠肺纤维化模型,ALA皮下渗透泵持续输注28天,评估组织学纤维化、胶原I和α-SMA表达。
Alamandine/MrgD axis prevents TGF-β1-mediated fibroblast activation via regulation of aerobic glycolysis and mitophagy.
体外细胞实验、体内小鼠模型和患者转录组数据等多层级验证,包含功能、机制及体内验证。
小鼠原代肺成纤维细胞 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 IPF患者肺成纤维细胞和肺组织的转录组数据
TGF-β1浓度4 ng/mL处理24小时 ALA预处理浓度100 nM,作用1小时 博来霉素单次气管内滴注5 mg/kg ALA持续皮下输注2 μg/kg/h共28天 每组小鼠数量10只
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ALA对博来霉素诱导的肺纤维化及成纤维细胞活化的影响
使用BLM气管内滴注建立小鼠肺纤维化模型,ALA皮下渗透泵持续输注28天,评估组织学纤维化、胶原I和α-SMA表达。
检测TGF-β1诱导的成纤维细胞活化中糖酵解变化及ALA的影响
原代LF用TGF-β1处理,检测OCR、ECAR、乳酸和ATP,检测HK2和PFKFB3表达。
验证抑制糖酵解是否抑制成纤维细胞活化
使用3PO和2DG抑制PFKFB3和HK2,或过表达PFKFB3,检测胶原I和α-SMA表达。
检测TGF-β1和ALA对线粒体自噬的影响
使用透射电镜、mt-Keima、MitoTracker/LysoTracker共定位、Parkin和LC3B共定位等检测线粒体自噬。
验证线粒体自噬是否通过影响HK2和PFKFB3的自噬降解调控糖酵解和成纤维细胞活化
使用Parkin siRNA、Mdivi-1、3MA、巴弗洛霉素A1、雷帕霉素和MG132处理,检测HK2、PFKFB3及胶原I、α-SMA表达,并检测LC3和LAMP1与HK2、PFKFB3的共定位。
在IPF患者样本中验证糖酵解和线粒体自噬相关基因表达变化
分析GEO数据集GSE185492和GSE52463中肺成纤维细胞和肺组织表达谱。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | GIBCO | C11995500BT-1 |
| 胎牛血清 | GIBCO | FSP500 | |
| 青链霉素 | GIBCO | 15140122 | |
| 线粒体分离 | 线粒体分离试剂盒 | Beyotime | C3601 |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | ThermoFisher Scientific | L3000015 |
| 药物处理 | 转化生长因子-β1 | MedChemExpress | HY-P7117 |
| 阿拉曼定 | Biosyntan | -- | |
| β-丙氨酸 | Sangon | -- | |
| D-Pro7-血管紧张素-(1-7) | Sangon | -- | |
| 3PO | MedChemExpress | HY-100558 | |
| 2-脱氧葡萄糖 | MedChemExpress | HY-100558 | |
| 巴弗洛霉素A1 | MedChemExpress | HY-100558 | |
| 3-甲基腺嘌呤 | Selleck | S2767 | |
| Mdivi-1 | Abmole | M2830 | |
| L-乳酸 | Solarbio | IL0540 | |
| MrgD siRNA | Ribobio | -- | |
| Parkin siRNA | Ribobio | -- | |
| 乳酸检测 | 乳酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A019-2-1 |
| 线粒体染色 | 线粒体绿色荧光探针 | Beyotime | C1048 |
| 溶酶体染色 | 溶酶体红色荧光探针 | Beyotime | C1046 |
| 线粒体自噬检测 | mt-Keima质粒 | Genechem | -- |
| 线粒体活性氧检测 | MitoSOX红色荧光探针 | Invitrogen | M36008 |
| 组织学分析 | Masson三色染色 | -- | -- |
| 免疫组织化学 | DAB底物试剂盒 | DAKO | GK500705 |
| 免疫荧光 | DAPI | Sigma Aldrich | F6057 |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 蛋白质印迹检测系统 | BLT GelView 6000 Pro | -- | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Takara | 9109 |
| PrimeScript逆转录预混液 | Takara | RR036A | |
| TB Green预混Ex Taq | Takara | RR420B | |
| 罗氏LightCycler 480实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| Seahorse分析 | Seahorse XFe96细胞外流量分析仪 | Agilent | -- |
| 显微镜 | LSM880共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- |
| LSM980共聚焦显微镜 | ZEISS | -- | |
| IX73显微镜 | Olympus | -- | |
| Imager D2显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| BX63荧光显微镜 | OLYMPUS | -- | |
| 抗体 | 抗PFKFB3抗体 | Bimake | A5593 |
| 抗HK2抗体 | Proteintech | 66974-1-Ig | |
| 抗α平滑肌肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 19245T | |
| 抗Parkin抗体 | Proteintech | 66674-1-Ig | |
| 抗COX IV抗体 | Proteintech | 66110-1-Ig | |
| 抗LC3B抗体 | Bimake | A5202 | |
| 抗LC3B抗体 | Cell Signaling Technology | 83506S | |
| 抗LAMP1抗体 | Signalway Antibody | 32731 | |
| 抗I型胶原抗体 | Abcam | ab260043 | |
| 抗I型胶原抗体 | Proteintech | 67288-1-Ig | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcepta | AM1021B | |
| Western blot | 二抗 | Fdbio Science | FDR007 |
| 二抗 | Fdbio Science | FDM007 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄、BLM剂量、给药方式、ALA给药方式、剂量、持续时间、样本量 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments |
| 细胞培养 | 原代肺成纤维细胞分离方法、培养基成分、FBS浓度、培养条件 阅读提示:Materials and methods: Cell isolation and culture |
| TGF-β1处理 | TGF-β1浓度、处理时间、ALA预处理浓度和时间 阅读提示:Materials and methods: Extracellular lactate analysis; Results |
| 糖酵解检测 | Seahorse实验条件、OCR/ECAR测定试剂浓度、乳酸检测方法 阅读提示:Materials and methods: Measurement of oxygen consumption rate and extracellular acidification rate; Extracellular lactate analysis |
| 线粒体自噬检测 | 透射电镜样本制备、mt-Keima转染、MitoTracker/LysoTracker浓度、MitoSOX浓度、共定位分析 阅读提示:Materials and methods: Mitotracker and lysotracker staining; Measurement of mitophagy using mt-Keima; Mitochondrial superoxide detection |
| 分子表达检测 | 抗体、稀释比例、电泳条件、转膜条件、qRT-PCR引物序列 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis; qRT-PCR; Table 1 |