PP2C磷酸酶Ptc1和Ptc2去磷酸化PGK1以调节致病真菌黄曲霉的自噬和黄曲霉毒素合成

PP2C phosphatases Ptc1 and Ptc2 dephosphorylate PGK1 to regulate autophagy and aflatoxin synthesis in the pathogenic fungus Aspergillus flavus.

作者信息Zhuo Zhu, Mingkun Yang, Guang Yang, Bei Zhang, Xiaohong Cao, Jun Yuan, Feng Ge, Shihua Wang
PMID37754565
期刊mBio
发布时间2023-10-31
DOI10.1128/mbio.00977-23

实验完整度

包含基因敲除、点突变、体内外磷酸酶活性、IP-MS、自噬检测、种子侵染等多个独立证据层级,并进行了功能与机制验证。

主要模型

黄曲霉(Aspergillus flavus)野生型和突变株(Δptc1、Δptc2、Δptc1/ptc2、点突变株、PGK1突变株) 花生和玉米种子侵染模型 大肠杆菌(E. coli)蛋白表达系统

重点核对

Ptc1和Ptc2敲除及点突变株的构建与验证 Ptc1和Ptc2的Mg2+依赖性磷酸酶活性及金属配位天冬氨酸残基的功能 PGK1 S203磷酸化状态对线粒体转位和乙酰辅酶A产生的影响 自噬囊泡形成及Atg8、Atg5-Atg12蛋白水平的检测 花生和玉米种子侵染实验中的产孢和黄曲霉毒素产量

摘要

蛋白激酶和磷酸酶的可逆磷酸化在调节细胞过程中起着核心作用。然而,关于蛋白磷酸酶2C(PP2C)丝氨酸/苏氨酸磷酸酶在黄曲霉中的功能,此前一直未见报道。在此,我们在黄曲霉中鉴定了PP2C蛋白磷酸酶家族的七个成员。进化和功能分析表明,两个功能冗余的PP2C磷酸酶Ptc1和Ptc2高度保守,并调节分生孢子发育、黄曲霉毒素合成、种子侵染和自噬囊泡形成。细胞质蛋白Ptc1和Ptc2在DNA损伤诱导的自噬后表现出核浸润。它们的降解与自噬诱导密切相关。与Mg2+配位的天冬氨酸残基对于黄曲霉中磷酸酶Ptc1和Ptc2的活性、热稳定性和生物功能至关重要。免疫沉淀-质谱蛋白质组学研究表明,133种蛋白质与Ptc1和Ptc2共同相互作用。在这些蛋白质中,磷酸甘油酸激酶1(PGK1)与Ptc1和Ptc2相互作用,并在Δptc1、Δptc2和Δptc1/ptc2突变体中显示出高水平的磷酸化。此外,PGK1 S203磷酸化水平与黄曲霉毒素合成和自噬囊泡形成相关。总的来说,这些发现有助于我们理解PP2C家族磷酸酶在黄曲霉中的作用和机制,并强调它们在各种细胞过程中的重要性。此外,它揭示了黄曲霉中的一个新的调控模型,其中Ptc1和Ptc2通过调节PGK1来激活自噬和黄曲霉毒素合成。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
黄曲霉中PP2C磷酸酶Ptc1和Ptc2的功能及其调控黄曲霉毒素合成和自噬的分子机制是什么?
核心机制
Ptc1和Ptc2通过去磷酸化PGK1 S203,阻止PGK1向线粒体转位,从而维持线粒体丙酮酸代谢(产生乙酰辅酶A)和自噬,最终促进黄曲霉毒素合成。
主要证据
IP-MS鉴定Ptc1/Ptc2与PGK1互作;磷酸化检测显示Δptc1等突变体中PGK1 S203磷酸化水平升高;体外磷酸酶实验证实Ptc1/Ptc2直接去磷酸化PGK1;PGK1 S203A/D突变体影响线粒体定位、乙酰辅酶A水平、自噬和黄曲霉毒素产生;敲除或点突变菌株在PDA/YES培养基和种子侵染中表型一致。
研究意义
揭示PP2C磷酸酶在黄曲霉中的作用和机制,为通过抑制Ptc1/Ptc2或相关通路来阻断黄曲霉毒素产生提供潜在靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

PP2C磷酸酶鉴定与敲除

鉴定黄曲霉中PP2C家族成员并确定其功能

通过同源比对鉴定7个PP2C磷酸酶,构建单敲除和双敲除突变体,观察菌落形态、产孢和黄曲霉毒素产生。

2

表型分析

评估Ptc1/Ptc2缺失对生长发育和致病性的影响

测定菌落直径、产孢量、菌核形成、种子侵染能力及黄曲霉毒素产生。

3

自噬检测

验证Ptc1/Ptc2是否参与自噬调控

使用MDC染色、TEM观察自噬囊泡,以及mCherry-GFP-Atg8双荧光系统检测自噬流;分析Ptc1/Ptc2蛋白在自噬诱导下的降解。

4

磷酸酶活性与点突变分析

确定Ptc1/Ptc2的催化关键残基及其功能

表达纯化Ptc1/Ptc2及天冬氨酸点突变蛋白,检测其磷酸酶活性和热稳定性;在体内构建相应点突变菌株并分析表型。

5

互作蛋白鉴定

寻找Ptc1/Ptc2的底物或相互作用蛋白

通过IP-MS鉴定与Ptc1和Ptc2相互作用的蛋白质,并进行生物信息学分析(GO、KEGG、PPI),验证关键互作蛋白。

6

PGK1功能验证

验证PGK1作为Ptc1/Ptc2底物及其磷酸化在黄曲霉毒素合成和自噬中的作用

构建PGK1敲除和S203A/D点突变菌株,检测PGK1磷酸化水平、线粒体定位、乙酰辅酶A和丙酮酸水平、自噬活性及黄曲霉毒素产量。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
血根碱氯盐Aladdin--
雷帕霉素Solarbio--
异丙基β-D-硫代半乳糖苷Biosharp--
TRIzol试剂Biomarker Technologies--
第一链cDNA合成试剂盒TransGen Biotech--
组织线粒体分离试剂盒Beyotime Biotechnology--
细胞核分离提取试剂盒Solarbio--
乙酰辅酶A荧光检测试剂盒Solarbio--
GFP纳米抗体磁珠EverylabIP06M
pBabe-puro-mCherry-eGFP-Atg8质粒Addgene22418
pET-21b载体Novagen--
纳米差示扫描量热仪Calorimetry Sciences Corp.--
尼康Ti-U显微镜Nikon--
蔡司Image A.2显微镜Zeiss--
环氧树脂Electron Microscopy Sciences14120
超薄切片机Leica Biosystems--
HT7700透射电子显微镜HITACHI--
Bio-Rad电转仪Bio-Rad--
Western Bright ECL发光液Advansta--
CLINX ChemiScope 6000 Exp成像系统CLINX--
Q-Exactive质谱仪Thermo Fisher Scientific--
抗GFP抗体Dia-An2057R
抗GAPDH抗体Proteintech60004–1-Ig
抗β-肌动蛋白抗体PTM BiolabsPTM-5018
抗Slt2抗体(p44/42 MAPK)Cell Signaling Technology9102
抗磷酸化Slt2抗体Cell Signaling Technology4377
抗ATG5抗体PTM BiolabsPTM-5868
抗Atg8抗体PTM BiolabsPTM-6384
抗PGK1抗体ABclonalA14039
抗TIMM10抗体ABclonalA4626
抗H3抗体Proteintech68345–1-Ig
抗泛磷酸化丝氨酸抗体ImmuneChemICP9806
抗泛磷酸化苏氨酸抗体ImmuneChemICP9807
抗磷酸化PGK1 S203抗体Signalway AntibodySAB487P
山羊抗兔IgG(H+L)二抗ProteintechSA00001-2
Hoechst 33342染料Beyotime Biotechnology--
MitoTracker Red CMXRos染料Beyotime Biotechnology--
单丹磺酰尸胺(MDC)Beyotime Biotechnology--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
菌株构建
基因敲除、互补和点突变菌株的构建方法与筛选标记(pyrG、prtA),转化方法的具体参数
阅读提示:Materials and Methods 中 'Mutant strain construction' 部分
培养条件
不同实验使用的培养基(PDA、YES、MM、YPD)及温度、时间、光照条件
阅读提示:Materials and Methods 中 'Strains and culture conditions' 部分及图例
抑制剂处理
sanguinarine chloride浓度(1、10、50、100 μM)及溶剂对照;MMS(0.02%)和rapamycin(200 ng/mL)的浓度和处理时间
阅读提示:Materials and Methods 中 'Inhibitor treatments and induction of autophagy' 部分
自噬检测
MDC染色、TEM样本制备、mCherry-GFP-Atg8实验的详细条件(如培养时间、诱导处理时间)
阅读提示:Materials and Methods 中 'Fluorescence analysis'、'Transmission electron microscopy (TEM)' 部分及图例
磷酸酶活性
体外磷酸酶活性检测中的缓冲液成分、金属离子(Mg2+、Mn2+、Ca2+)浓度、底物pNPP浓度、反应时间
阅读提示:Materials and Methods 中 'Phosphatase assays' 部分
互作蛋白鉴定
IP-MS实验中的裂解缓冲液、抗体偶联磁珠、洗涤条件、质谱分析参数
阅读提示:Materials and Methods 中 'Co-immunoprecipitation and mass spectrometry' 部分