体外STS诱导细胞分化模型建立
确定低浓度STS处理能否促进细胞轴突生长及神经元分化。
以75 nM STS处理661W和ARPE-19细胞6小时,通过免疫荧光和Western blot检测神经元标志物β-III Tubulin、NeuN和MAP2表达。
Promotion of axon regeneration and protection on injured retinal ganglion cells by rCXCL2.
包含体外细胞模型(661W、ARPE-19)STS诱导轴突生长及RNA-seq;体内ONC和NMDA两种损伤模型,进行轴突示踪、免疫染色、TUNEL、ERG及Western blot功能与机制验证,证据层级独立。
661W细胞(视网膜前体神经元) ARPE-19细胞(人视网膜色素上皮) C57BL/6J小鼠视神经挤压伤(ONC)模型 C57BL/6J小鼠NMDA视网膜损伤模型
rCXCL2玻璃体内注射剂量1.0 μg/μl,每次1.5 μl NMDA注射浓度20 mM,注射体积1.5 μl STS处理浓度75 nM,处理时间6小时 rCXCL2处理浓度50 nM,处理时间48小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定低浓度STS处理能否促进细胞轴突生长及神经元分化。
以75 nM STS处理661W和ARPE-19细胞6小时,通过免疫荧光和Western blot检测神经元标志物β-III Tubulin、NeuN和MAP2表达。
筛选STS诱导轴突再生的关键分子靶点。
对STS处理或对照的661W和ARPE-19细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因,并通过qRT-PCR验证CXCL2表达上调。
验证外源性rCXCL2能否模拟STS的促轴突生长作用。
用50 nM rCXCL2处理661W细胞48小时,通过免疫荧光和神经突追踪分析轴突生长。
评估rCXCL2在视神经挤压伤后是否促进RGC轴突再生并保护RGC。
对ONC小鼠进行rCXCL2玻璃体内注射,通过CTB顺行示踪和GAP43免疫染色检测轴突再生,RBPMS/Thy1染色计数RGC存活,TUNEL检测凋亡。
评估rCXCL2在NMDA诱导的RGC兴奋性毒性损伤中的保护作用及其对轴突投射和视觉功能的影响。
对NMDA损伤小鼠进行rCXCL2玻璃体内注射,检测RGC存活、轴突密度、脑内长距离投射以及ERG视觉功能。
探究rCXCL2在两种损伤模型中产生不同效应的信号通路机制。
通过Western blot检测ONC和NMDA损伤视网膜中p-JAK2/p-STAT3、Bax、Bcl-2和Caspase-3蛋白水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 星形孢菌素 | AbMole | M2066 |
| N-甲基-D-天冬氨酸 | AbMole | M2884 | |
| 细胞核染色 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Solarbio | C0065 |
| 封片 | 抗荧光淬灭封片剂 | Solarbio | S2100 |
| RNA提取 | Triquick试剂(Trizol替代品) | Solarbio | R1100 |
| 轴突示踪 | 霍乱毒素B亚单位偶联Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | C34775 |
| 药物处理 | 小鼠重组CXCL2 | PeproTech | 250-15 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 青霉素-链霉素 | HyClone | -- | |
| DMEM/F-12培养基 | HyClone | -- | |
| 细胞传代 | 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- |
| 细胞处理 | 二甲基亚砜 | -- | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 小鼠抗β-III微管蛋白抗体 | Beyotime | AT809 | |
| 兔抗MAP2抗体 | Signalway | 21636 | |
| 兔抗NeuN抗体 | Abcam | ab177487 | |
| Cy3标记抗小鼠IgG | Abbkine | A22210 | |
| Cy3标记抗兔IgG | Abbkine | A22220 | |
| DyLight 488标记抗兔IgG | Abbkine | A23220 | |
| Western blot | 蛋白裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量检测试剂盒 | -- | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 小鼠抗β-肌动蛋白抗体 | Signalway | 21800 | |
| 小鼠抗磷酸化STAT3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8059 | |
| 兔抗磷酸化JAK2抗体 | Beyotime | AF1486 | |
| 兔抗Bax抗体 | Beyotime | AF0057 | |
| 兔抗Bcl-2抗体 | Beyotime | AF0060 | |
| 兔抗Caspase-3抗体 | Beyotime | AC030 | |
| HRP标记抗兔IgG | Signalway | L3012 | |
| HRP标记抗小鼠IgG | Signalway | L3032 | |
| RNA测序 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| Ampure XP磁珠 | -- | -- | |
| BGIseq500测序平台 | BGI-Shenzhen | -- | |
| qRT-PCR | Eastep™ Super总RNA提取试剂盒 | Promega | -- |
| FastQuant逆转录试剂盒 | TIANGEN | -- | |
| 2X SG Fast qPCR预混试剂盒 | Sangon Biotech | -- | |
| 动物实验 | 盐酸奥布卡因滴眼液 | Santen | -- |
| 托吡卡胺 | Santen | -- | |
| Hamilton微量注射器 | Hamilton Company | -- | |
| Histology | OCT包埋剂 | -- | -- |
| TUNEL检测 | 一步法TUNEL检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 免疫荧光 | 兔抗RBPMS抗体 | OmnimAbs | OM165217 |
| 兔抗Thy1抗体 | Beyotime | AF1636 | |
| 兔抗GAP43抗体 | Beyotime | AF0153 | |
| 小鼠抗CXCR2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7304 | |
| DyLight 488标记抗小鼠IgG | Abbkine | A23210 | |
| 电生理检测 | RetiMINER IV系统 | IRC Medical Equipment | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞分化模型 | STS浓度75 nM,处理时间6小时;661W和ARPE-19细胞来源及培养条件(DMEM或DMEM/F-12,10% FBS) 阅读提示:Methods:Cell culture,Cell differentiation with STS |
| RNA测序 | 四组样本设计,每组三个生物学重复;RNA提取方法:TRIzol;测序平台BGIseq500;差异表达筛选标准Q值≤0.05 阅读提示:Methods:RNA-sequencing |
| 体外rCXCL2功能验证 | rCXCL2浓度50 nM,处理时间48小时;661W细胞培养条件 阅读提示:Results:The level of the CXCL2 gene is upregulated in STS-treated cells,图2e-g |
| ONC模型 | 小鼠品系、年龄和体重;ONC手术细节(夹持位置和时长);rCXCL2注射剂量1.0 μg/μl,每次1.5 μl;注射时间点(7天组注射两次,14天组三次);CTB注射;轴突计数方法 阅读提示:Methods:Animals,Optic nerve crush,Intravitreal injection,Histology;Results:图3 |
| NMDA损伤模型 | NMDA浓度20 mM,注射体积1.5 μl;rCXCL2剂量1.0 μg/μl,每次1.5 μl;CTB注射时间(处死前3天);轴突密度和LGN/SC荧光定量方法 阅读提示:Methods:Intravitreal injection,Histology;Results:图5,图6 |
| 视觉功能评估 | ERG记录条件(暗适应时间,刺激强度,OP滤波参数);pSTR和PhNR测量方法 阅读提示:Methods:Flash electroretinogram (ERG);Results:图7 |
| 机制蛋白检测 | 视网膜蛋白提取方法,检测蛋白(p-JAK2, p-STAT3, Bax, Bcl-2, Caspase-3)及抗体信息,样本量,统计方法 阅读提示:Methods:Western blot analysis,Statistical analysis;Results:图8 |