建立IBS小鼠模型及Bifico干预
模拟IBS病理状态并评估Bifico的治疗效果
7周龄雄性C57BL/6小鼠适应性饲养7天后,随机分为对照组、IBS组和IBS+Bifico组。IBS组和IBS+Bifico组通过WRS诱导14天,期间每日一次灌胃PBS或Bifico(0.78 g/kg)。
Bifico relieves irritable bowel syndrome by regulating gut microbiota dysbiosis and inflammatory cytokines.
包含体内模型(WRS诱导IBS小鼠)及多种检测(AWR、16S rDNA、1H-NMR、Western blot),但缺乏体外或临床样本验证,机制探讨以相关性为主。
WRS诱导的IBS小鼠模型 C57BL/6小鼠
WRS诱导IBS模型:每天8-10点束缚应激,持续14天 Bifico给药剂量:0.78 g/kg,每日一次灌胃 AWR评分:结直肠扩张容量0.25、0.35、0.50 mL,每次重复3次,间隔4分钟 蛋白质检测:Western blot检测结肠组织IL-6和TNF-α蛋白水平,以β-actin为内参
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟IBS病理状态并评估Bifico的治疗效果
7周龄雄性C57BL/6小鼠适应性饲养7天后,随机分为对照组、IBS组和IBS+Bifico组。IBS组和IBS+Bifico组通过WRS诱导14天,期间每日一次灌胃PBS或Bifico(0.78 g/kg)。
检测Bifico对IBS小鼠内脏敏感性的影响
在实验结束时,通过AWR评分评估结直肠扩张刺激下的行为反应。
检测Bifico对IBS小鼠肠道菌群多样性和组成的影响
收集粪便样本,提取DNA,扩增16S rRNA V3-V4区,进行高通量测序,分析α多样性和β多样性,并通过LEfSe识别差异菌群。
评估Bifico对IBS小鼠粪便代谢物的影响
采用1H-NMR光谱分析粪便样本的代谢物谱,并通过PCA、PLS-DA筛选差异代谢物。
评估Bifico对结肠组织炎症因子蛋白表达的影响
通过Western blot检测结肠组织中IL-6和TNF-α的蛋白水平,以β-actin为内参。
探索肠道菌群、代谢物和炎症因子之间的关系
使用Spearman相关分析计算差异菌群、代谢物和炎症因子之间的相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | Bifico | Shanghai Sinepharm | -- |
| 磷酸盐缓冲液 | -- | -- | |
| AWR测试 | 一次性硅胶球囊-尿道导管 | Terumo | 6 |
| 16S rDNA测序 | E.Z.N.A.粪便DNA提取试剂盒 | Omega | D4015 |
| AMPure XT磁珠 | Beckman Coulter Genomics | -- | |
| Qubit荧光定量仪 | Invitrogen | -- | |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| Illumina文库定量试剂盒 | Kapa Biosciences | -- | |
| Illumina NovaSeq平台 | Illumina | -- | |
| 1H-NMR分析 | 重水 | SIGMA | -- |
| TMSP | SIGMA | -- | |
| Bruker 600 MHz AVANCE III光谱仪 | Bruker | -- | |
| Western blot | RIPA裂解和提取缓冲液 | Thermo Scientific | 89901 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | 78443 | |
| PVDF膜 | Thermo Scientific | 88520 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970S | |
| IL-6抗体 | Cell Signaling Technology | 4970S | |
| TNF-α抗体 | Signalway Antibody | 41504 | |
| HRP偶联二抗 | EpiZyme | LF102 | |
| Bio-Rad凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、周龄、性别、饲养条件、WRS诱导时长和频率 阅读提示:Materials and methods: Animals 和 Wrap-restraint stress model |
| 药物处理 | Bifico剂量、给药途径、给药频率和持续时间 阅读提示:Materials and methods: Animals |
| AWR评估 | 结直肠扩张容量、重复次数、间隔时间、评分标准 阅读提示:Materials and methods: AWR test |
| 16S rDNA测序 | 样本量、DNA提取试剂盒、PCR引物和条件、测序平台、生物信息学流程(包括α/β多样性计算) 阅读提示:Materials and methods: Fecal samples preparation for 16S rDNA sequencing 和 16S rDNA sequencing and data analysis |
| 代谢物分析 | 粪便样本制备方法、NMR参数、数据处理和统计筛选标准(VIP和P值) 阅读提示:Materials and methods: Fecal samples preparation for 1H-NMR analysis 和 1H-NMR analysis and data processing |
| Western blot | 组织来源、蛋白提取方法、抗体稀释比例、内参基因 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis |