检测miR-140-5p在脂肪分化中的表达
验证miR-140-5p是否在脂肪细胞分化过程中表达变化。
采用qRT-PCR检测3T3-L1前脂肪细胞分化过程中不同时间点(24, 48, 72小时及分化前1天至7天)miR-140-5p的表达;油红O染色检测脂滴形成。
microRNA-140 Regulates PDGFRα and Is Involved in Adipocyte Differentiation.
通过细胞模型3T3-L1和HEK293T,采用qRT-PCR、Western blot、油红O染色和荧光素酶报告实验等验证了miR-140-5p对PDGFRα的直接调控作用,但未进行体内实验。
3T3-L1前脂肪细胞 HEK293T细胞
miR-140-5p在脂肪分化过程中的表达变化 miR-140-5p过表达和敲低对脂肪生成相关基因表达和脂滴形成的影响 PDGFRα作为miR-140-5p直接靶点的验证 PDGFRα过表达和敲低对脂肪细胞分化的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证miR-140-5p是否在脂肪细胞分化过程中表达变化。
采用qRT-PCR检测3T3-L1前脂肪细胞分化过程中不同时间点(24, 48, 72小时及分化前1天至7天)miR-140-5p的表达;油红O染色检测脂滴形成。
确定miR-140-5p对脂肪生成相关基因表达和脂滴形成的影响。
在3T3-L1细胞中转染miR-140-5p mimics或抑制剂,采用qRT-PCR和Western blot检测脂肪生成相关转录因子(C/EBPδ、PPARγ、C/EBPα、aP2等)的表达,并采用油红O染色评估脂滴形成。
确认PDGFRα是否为miR-140-5p的直接靶基因。
通过TargetScan数据库预测miR-140-5p在PDGFRα 3'UTR上的结合位点,构建包含PDGFRα 3'UTR的荧光素酶报告载体,共转染miR-140-5p mimics或对照后检测荧光素酶活性;同时检测miR-140-5p过表达或抑制后PDGFRα mRNA和蛋白水平的变化。
确定PDGFRα对脂肪生成相关基因表达和脂滴合成的影响。
在3T3-L1细胞中转染pEGFP-N1-PDGFRα(过表达)或PDGFRα特异性siRNA(敲低),采用qRT-PCR和Western blot检测脂肪生成相关转录因子表达,油红O染色检测脂滴形成。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Life Technologies | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 脂肪分化诱导 | 胰岛素 | Sigma-Aldrich | -- |
| 地塞米松 | Sigma-Aldrich | -- | |
| IBMX | Sigma-Aldrich | -- | |
| RNA提取 | RNAiso Plus试剂 | Takara | -- |
| 反转录 | Prime Script RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara | -- |
| qRT-PCR | SYBR Green qPCR Mix试剂 | Monad | -- |
| 蛋白提取 | 裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | NC或PVDF膜 | Millipore | -- |
| 抗C/EBPα抗体 | Proteintech | 18311-1-AP | |
| 抗PDGFRα抗体 | Bioss | bsm-52829R | |
| 抗C/EBPδ抗体 | Signalway Antibody | 36790 | |
| 抗C/EBPβ抗体 | Proteintech | 23431-1-AP | |
| 增强化学发光试剂 | Bio-Rad | -- | |
| 荧光素酶报告实验 | psiCheck2载体 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告检测系统 | Promega | -- | |
| 油红O染色 | 油红O | Sigma-Aldrich | -- |
| 统计绘图 | GraphPad Prism 6 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和分化 | 3T3-L1细胞培养条件:高糖DMEM含10%FBS、5%CO2、37°C;分化诱导条件:100nM胰岛素、1μM地塞米松、0.5mM IBMX、10%FBS。 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture, Cell Transient Transfection, and Adipocyte Differentiation |
| miR-140-5p过表达/敲低 | miR-140-5p mimics和抑制剂转染条件;转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX或2000)及转染时间。 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture, Cell Transient Transfection, and Adipocyte Differentiation;Figure 2 legend |
| qRT-PCR | RNA提取试剂(RNAiso Plus)、反转录试剂盒(Prime Script RT Reagent Kit with gDNA Eraser)、SYBR Green qPCR Mix(Monad);内参U6;基因相对表达计算采用2-ΔΔCt方法。 阅读提示:Materials and Methods: RNA Extraction and qRT-PCR |
| Western blot | 蛋白提取使用裂解缓冲液(Beyotime),BCA蛋白定量(Beyotime),抗体信息(anti-C/EBPα、anti-PDGFRα、anti-C/EBPδ、anti-C/EBPβ)及稀释比例,二抗孵育时间和温度,ECL检测(Bio-Rad)。 阅读提示:Materials and Methods: Western Blots |
| 荧光素酶报告实验 | 构建psiCheck2-PDGFRα-3'UTR载体,共转染miR-140-5p mimics或对照到HEK293T细胞,48小时后检测荧光素酶活性。 阅读提示:Materials and Methods: Luciferase Reporter Assay;Figure 3 legend |
| 油红O染色 | 固定细胞用10%福尔马林1小时,0.35%油红O染色1小时,水洗后拍照。 阅读提示:Materials and Methods: Oil Red O Staining Assay |
| 统计分析 | 数据以均值±标准差表示,n=3;采用两尾Student's t检验,显著性水平*p<0.05, **p<0.01, ***p<0.001。 阅读提示:Materials and Methods: Statistical Methods |