鉴定TH调控的miRNA
筛选肝脏中响应甲状腺激素(T3)的miRNA。
使用miRNA微阵列比较甲状腺功能减退小鼠在T3注射前后的肝脏miRNA表达谱,选择miR-378进行后续研究。
Hepatic miR-378 modulates serum cholesterol levels by regulating hepatic bile acid synthesis.
包含多种证据层级:体外细胞实验、肝细胞、肝脏特异性转基因和敲除小鼠模型、体内过表达/敲低、人源肝细胞样细胞,以及功能验证(胆汁酸水平)和机制验证(靶基因、下游通路)。
小鼠肝脏(C57BL/6) 肝脏特异性miR-378转基因小鼠(LivKI) miR-378/378*敲除小鼠(KO) 人肝细胞样细胞(hHLCs)
小鼠品系:C57BL/6,年龄2-4个月,雄性为主 hypothyroid诱导:0.1%甲巯咪唑(MMI)和1% NaClO4饮水处理两周 T3注射剂量:5 µg/20 g体重,每日一次,连续5天 高胆固醇饮食:含1.25%胆固醇的高脂饮食(D12108C)喂养3个月 腺病毒注射:尾静脉注射0.1-1x10^9 PFU,两周后分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选肝脏中响应甲状腺激素(T3)的miRNA。
使用miRNA微阵列比较甲状腺功能减退小鼠在T3注射前后的肝脏miRNA表达谱,选择miR-378进行后续研究。
评估肝脏miR-378过表达或敲低对血清胆固醇水平的影响。
通过腺病毒介导的miR-378过表达(Ad-378)或antagomir敲低(Ant-378)处理小鼠,检测血清总胆固醇水平。
确定miR-378对肝脏胆汁酸合成关键酶表达和胆汁酸水平的影响。
通过RNA-seq和KEGG分析筛选miR-378靶基因,qPCR和Western blot检测CYP7B1、CYP8B1、CYP27A1等表达,UFLC-MS测定胆汁酸水平。
确定miR-378是否直接靶向并抑制MAFG。
使用荧光素酶报告基因、Western blot、RIP和ChIP实验验证miR-378与MAFG 3'UTR的结合及对蛋白水平的影响。
证明MAFG是介导miR-378作用的关键下游因子。
在Ad-378处理的背景下恢复MAFG表达,或通过shRNA敲低MAFG,观察对胆汁酸合成和血清胆固醇的影响。
研究适度过表达或缺失miR-378对胆汁酸和胆固醇稳态的长期影响。
使用肝脏特异性miR-378转基因小鼠(LivKI)和miR-378/378*敲除小鼠(KO),检测血清胆固醇、胆汁酸水平及对高脂饮食的反应。
确定miR-378是否参与TH的降胆固醇效应。
在甲状腺功能减退和亢进小鼠(WT和KO)中比较血清胆固醇和胆汁酸代谢,并敲低MAFG观察T3效应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 腺病毒制备 | BLOCK-iT腺病毒RNAi表达系统 | Invitrogen | -- |
| AdEasy腺病毒载体系统 | Stratagene | -- | |
| 细胞培养 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 报告基因实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 |
| KOD-Plus突变试剂盒 | Toyobo | SMK-101 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | PrimeScript RT试剂盒 | TaKaRa | RR037A |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 免疫印迹 | CYP7B1抗体 | Abcam | ab136801 |
| CYP8B1抗体 | Abcam | ab191910 | |
| CYP27A1抗体 | Abcam | ab126785 | |
| CYP7A1抗体 | Santa Cruz | sc-25536 | |
| MAFG抗体 | Novus Biologicals | NBP2-15019 | |
| Tubulin抗体 | Sigma | T5168-2ML | |
| Actin抗体 | Sigma | A5441-100UL | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling | 3683 | |
| HSP90抗体 | Cell Signaling | 4877 | |
| ELISA | CYP7A1 ELISA试剂盒 | Signalway Antibody | EK10945-1 |
| CYP7B1 ELISA试剂盒 | Signalway Antibody | EK10940-1 | |
| CYP8B1 ELISA试剂盒 | Signalway Antibody | EK10937 | |
| 胆汁酸分析 | 超快速液相色谱-三重飞行时间质谱 | -- | -- |
| Waters XBridge Peptide BEH C18色谱柱 | Waters | -- | |
| 血清胆固醇检测 | 胆固醇检测试剂盒 | Wako | 294-65801 |
| ChIP | EZ Magna ChIP G试剂盒 | Millipore | 17-409 |
| RIP | Magna RIP试剂盒 | Millipore | 17-701 |
| AGO2抗体 | anti-AGO2抗体 | Abcam | ab32381 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6),年龄2-4个月,性别(雄性为主),对照匹配 阅读提示:Materials and Methods: Animal study |
| 甲状腺功能调控 | 甲减诱导(0.1% MMI + 1% NaClO4饮水两周),T3剂量(5 µg/20 g体重,每日一次,连续5天) 阅读提示:Materials and Methods: Animal study |
| 腺病毒感染 | 腺病毒滴度(0.1-1x10^9 PFU),注射途径(尾静脉),处理时间(两周) 阅读提示:Materials and Methods: Animal study |
| antagomir处理 | Ant-378剂量(10 nmol/25 g体重),注射途径(腹腔),处理时间(4天) 阅读提示:Materials and Methods: Animal study |
| 饮食诱导高胆固醇血症 | 高胆固醇饮食(1.25%胆固醇,D12108C)喂养时间(3个月) 阅读提示:Materials and Methods: Animal study |
| 细胞培养和处理 | 原代肝细胞、Hepa1-6、HEK293T、hHLCs培养条件;T3处理浓度(100 nM)和时间;Agomir/Ant-378转染浓度(20 nM)和时间(36 h) 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and treatment |
| 胆汁酸测定 | 胆汁样本收集(小鼠禁食6小时),粪便收集(24小时),胆汁酸提取条件(70%乙醇,55℃ 4小时) 阅读提示:Materials and Methods: Quantification of cholesterol, BA, and C4 levels |