TMEM16A抑制活性筛选
通过荧光淬灭实验筛选可抑制TMEM16A的化合物
使用YFP-F46L/H148Q/I152L质粒转染LA795细胞,加入100 μM水飞蓟宾孵育30分钟,检测ATP引起的荧光淬灭。
Inhibition of TMEM16A by Natural Product Silibinin: Potential Lead Compounds for Treatment of Lung Adenocarcinoma.
包含体外细胞实验、分子对接、定点突变、体内异种移植模型及Western blot等多层级验证,且涵盖功能验证和机制验证。
LA795细胞(小鼠肺腺癌细胞系) A549和NCI-H1299细胞(人肺癌细胞系) LA795细胞异种移植裸鼠模型 患者肿瘤组织样本(用于TMEM16A表达比较)
水飞蓟宾浓度依赖性抑制TMEM16A电流的IC50值(30.90 ± 2.10 μM) TMEM16A结合位点K384、R515、R535的突变验证 敲低TMEM16A后水飞蓟宾对细胞增殖和迁移的抑制作用消失 体内实验中水飞蓟宾的给药剂量(50和100 mg/kg)及给药间隔(每3天) 水飞蓟宾处理浓度(0-300 μM)和持续时间(24-72小时)对细胞功能的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过荧光淬灭实验筛选可抑制TMEM16A的化合物
使用YFP-F46L/H148Q/I152L质粒转染LA795细胞,加入100 μM水飞蓟宾孵育30分钟,检测ATP引起的荧光淬灭。
进一步验证水飞蓟宾对TMEM16A电流的抑制作用及其浓度依赖性
用含600 nM Ca2+的电极内液激活TMEM16A电流,记录不同浓度水飞蓟宾灌流时的电流变化。
预测水飞蓟宾与TMEM16A的结合位点
构建小鼠TMEM16A同源模型(基于5oyb),进行两步分子对接(全局随机和局部对接)。
通过突变验证预测的结合位点K384、R515、R535
将赖氨酸和精氨酸突变为丙氨酸,进行全细胞膜片钳记录,观察水飞蓟宾对突变体电流的抑制。
检测水飞蓟宾对肺腺癌细胞增殖、迁移和凋亡的影响
分别进行MTT实验检测增殖,划痕愈合实验检测迁移,annexin-V实验检测凋亡。
验证水飞蓟宾抑制细胞生长是否通过靶向TMEM16A
用shRNA敲低LA795细胞中TMEM16A表达,进行Western blot、膜片钳、MTT和划痕实验。
评估水飞蓟宾在体内的抗肿瘤效果和安全性
将LA795细胞接种于裸鼠,待肿瘤体积达150 mm3后分组给药,测量肿瘤体积和体重变化。
探索水飞蓟宾抑制肿瘤生长的分子机制
提取肿瘤组织和细胞蛋白,检测TMEM16A、MEK1/2、ERK1/2、cyclin D1、caspase凋亡相关蛋白的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 水飞蓟宾 | Solarbio | 22888-70-6 |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Sijiqing | -- | |
| 细胞增殖检测 | MTT | Solarbio | 298-93-1 |
| Western blot | TMEM16A抗体 | Abcam | ab53212 |
| MEK1/2抗体 | Abcam | ab178876 | |
| β-catenin抗体 | Abcam | ab223075 | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Abcam | ab150077 | |
| 磷酸化MEK1/2抗体 | Signalway Antibody | 11205 | |
| 磷酸化ERK1/2抗体 | Signalway Antibody | 12548 | |
| ERK1/2抗体 | Solarbio | K200062M | |
| cyclin D1抗体 | Proteintech | 60186-1-Ig | |
| N-钙粘蛋白抗体 | Boster | A01577-3 | |
| E-钙粘蛋白抗体 | Boster | BM4166 | |
| 波形蛋白抗体 | Boster | PB9395 | |
| cleaved-caspase 3抗体 | Affinity Biosciences | AF7022 | |
| cleaved-caspase 9抗体 | Affinity Biosciences | AF5240 | |
| 动物实验 | 裸鼠 | SPF Biotechnology | -- |
| 转染 | X-tremeGENE HP转染试剂 | Roche | -- |
| 荧光检测 | Premo™卤化物传感器 | -- | -- |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Leica | SP5 | |
| 电生理实验 | EPC10放大器 | HEKA Elektronik | -- |
| P-97拉制仪 | Sutter Instrument | -- | |
| Digi LIH1600接口 | -- | -- | |
| OM815渗透压计 | LöserMesstechnik | -- | |
| 划痕愈合实验 | 尼康显微镜 | Nikon | TE2000-S |
| MTT实验 | SpectraMAX i3酶标仪 | Molecular Devices | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Solarbio | CA1020 |
| 流式分析 | CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 定点突变 | Transgen快速突变系统试剂盒 | Transgen | FM111-02 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | LA795细胞培养条件(5% CO2,95%湿度),培养基(RPMI-1640+10% FBS) 阅读提示:Materials and Methods, Cell Culture and Transfection |
| 荧光淬灭实验 | YFP质粒转染时间(36小时),水飞蓟宾浓度(100 μM),孵育时间(30分钟),检测波长 阅读提示:Materials and Methods, Fluorescence Assay |
| 全细胞膜片钳 | 电极电阻(3-5 MΩ),细胞内液Ca2+浓度(600 nM),刺激电压步阶(-80至+80 mV) 阅读提示:Materials and Methods, Electrophysiology |
| 分子对接 | TMEM16A结构(PDB: 5oyb),对接软件(AutoDock 4.2)及算法 阅读提示:Materials and Methods, Modeling and Molecular Docking |
| 定点突变 | 突变位点(K384A, R515A, R535A),突变试剂盒(FM111-02) 阅读提示:Materials and Methods, Site-Directed Mutagenesis |
| MTT实验 | 细胞接种数(4000-7000),水飞蓟宾浓度(0-300 μM),处理时间(24小时),MTT浓度(5 mg/ml) 阅读提示:Materials and Methods, MTT Assay |
| 划痕愈合实验 | 细胞融合度(90%),水飞蓟宾浓度(0-300 μM),观察时间(0, 24, 48, 72小时) 阅读提示:Materials and Methods, Wound Healing Assay |
| 凋亡检测 | 水飞蓟宾浓度(200 μM),处理时间(24小时) 阅读提示:Materials and Methods, Annexin-V Assay |
| 体内实验 | 细胞接种量(5×10^6),给药剂量(顺铂7.5 mg/kg;水飞蓟宾50和100 mg/kg),给药频率(每3天),给药途径(尾静脉),给药次数(10次) 阅读提示:Materials and Methods, Tumor Xenografts in Mice |
| Western blot | 一抗稀释度(1:1000),二抗稀释度(1:5000) 阅读提示:Materials and Methods, Western Blotting |