慢性GA-13315暴露诱导
评估长期低剂量GA-13315暴露对细胞敏感性及耐药性的影响。
MCF-7和HCT116细胞分别用1 µM GA-13315处理12周,每2-3天换液,定期监测细胞活力。
Chronic exposure to the gibberellin derivative GA-13315 sensitizes breast cancer MCF-7 cells but not colon cancer HCT116 cells to irinotecan.
包含细胞模型(MCF-7、HCT116)的体外实验,涵盖药物敏感性、蛋白/基因表达(Western blot、RT-qPCR)、DNA损伤(彗星电泳)和机制(Top1活性)等多层级验证。
MCF-7乳腺癌细胞系 HCT116结肠癌细胞系 MCF-7/ADR多药耐药细胞系(背景提及)
慢性暴露剂量:1 µM GA-13315,持续12周 细胞系:MCF-7和HCT116 药物敏感性检测:CCK-8法,IC50计算 Top1蛋白表达变化:MCF-7下降,HCT116上升 Top1活性分析:非Top1毒物,抑制催化活性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估长期低剂量GA-13315暴露对细胞敏感性及耐药性的影响。
MCF-7和HCT116细胞分别用1 µM GA-13315处理12周,每2-3天换液,定期监测细胞活力。
检测慢性暴露后细胞对GA-13315、伊立替康和顺铂的敏感性变化。
CCK-8法检测不同浓度药物处理48小时后的细胞活力,计算IC50。
探究GA-13315暴露对化疗敏感性相关蛋白和转录本表达的影响。
Western blot检测Top1、Tdp1、Chk1、Bax、Bcl-2蛋白水平;RT-qPCR检测其mRNA水平。
明确GA-13315对DNA损伤的直接影响及是否作为Top1毒物。
单细胞凝胶电泳检测DNA片段化;体外Top1活性实验检测催化抑制和切割活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| McCoy's 5A培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | Gibco | -- | |
| 链霉素 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | GA-13315 | 合成 | -- |
| 伊立替康 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 顺铂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞裂解 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白提取 | 抑肽酶 | Sigma-Aldrich | -- |
| 亮抑酶肽 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 蛋白定量 | Micro BCA蛋白检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | 20151201 |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | -- | -- |
| Top1抗体 | Abcam | ab109374 | |
| Tdp1抗体 | Cell Signaling Technology | 2360 | |
| Chk1抗体 | Cell Signaling Technology | 59710 | |
| Bax抗体 | Abcam | ab32503 | |
| Bcl-2抗体 | Abcam | ab32124 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8227 | |
| 辣根过氧化物酶标记山羊抗兔IgG | Signalway Antibody | L3001 | |
| Phototope-HRP Western Blot检测试剂盒 | Cell Signaling Technology | -- | |
| FluorChem E成像系统 | ProteinSimple | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | M-MLV第一链cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | -- |
| SYBR Premix Select Master Mix试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ABI PRISM 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| DNA损伤检测 | 低熔点琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 正常熔点琼脂糖 | -- | -- | |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 十二烷基肌氨酸钠 | Adamas-Beta | P1293625 | |
| Triton X-100 | Beyotime | -- | |
| 二甲基亚砜 | Amresco | 201508 | |
| 氯化钠 | 广东光华科技 | 20190104 | |
| 荧光显微镜 | Leica Microsystems | DMI300B | |
| Top1活性检测 | TopoGEN拓扑异构酶I药物筛选试剂盒 | TopoGEN | 18FB14 |
| 超螺旋质粒DNA (pHOT1) | -- | -- | |
| 蛋白酶K | Calbiochem | D00091408 | |
| 溴化乙锭 | Invitrogen | 0492 | |
| 统计 | GraphPad Prism | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 慢性暴露 | GA-13315浓度为1 µM,暴露时间为12周,细胞活力≥90% 阅读提示:Materials and methods, Chronic exposure of cell lines to GA-13315 |
| 药物敏感性检测 | 细胞密度8×10^3/孔,药物处理48小时,CCK-8检测,IC50计算 阅读提示:Materials and methods, Evaluation of cell viability |
| 蛋白表达分析 | 抗体稀释比例、抗体克隆号 阅读提示:Materials and methods, Western blotting |
| mRNA表达分析 | 引物序列、内参基因β-actin、2^-ΔΔCq法 阅读提示:Materials and methods, RT-qPCR, Table I |
| DNA损伤检测 | 药物处理浓度(IC50)、处理时间48小时、彗星电泳条件(电压25V,时间30分钟) 阅读提示:Materials and methods, DNA agarose gel electrophoresis |
| Top1活性检测 | Top1酶单位、底物量、反应时间、GA-13315浓度范围 阅读提示:Materials and methods, Top1 assay |