ACAT1活性与表达分析
评估ACAT1在癌细胞和正常细胞中的酶活性和蛋白水平。
检测多种癌细胞系、原代白血病细胞和正常对照细胞的ACAT1活性、蛋白表达及基因表达。
Tetrameric Acetyl-CoA Acetyltransferase 1 Is Important for Tumor Growth.
包含体外激酶实验、细胞实验、患者样本检测和异种移植瘤模型等多层级验证;功能验证与机制验证齐全。
人类癌细胞系(H1299、K562等) 人原代白血病细胞 NIH/3T3细胞 H1299异种移植瘤裸鼠模型
ACAT1四聚体/单体状态(通过非变性凝胶电泳和蔗糖密度超速离心) ACAT1 Y407磷酸化水平(通过Western blot) AH的浓度和处理时间 细胞增殖和代谢检测(如PDH活性、糖酵解率、耗氧率)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ACAT1在癌细胞和正常细胞中的酶活性和蛋白水平。
检测多种癌细胞系、原代白血病细胞和正常对照细胞的ACAT1活性、蛋白表达及基因表达。
检测EGF刺激是否增强ACAT1活性并促进四聚体形成。
NIH/3T3细胞用EGF处理不同时间,检测ACAT1活性、四聚体/单体比例和酪氨酸磷酸化;用纯化的重组激酶进行体外激酶实验。
验证Y407磷酸化对ACAT1四聚体形成和活性的影响。
构建Y→F突变体,检测FGFR1处理后ACAT1活性和磷酸化;分离单体和四聚体,检测Y407磷酸化水平;用Y407F突变体进行实验。
筛选并验证AH作为共价ACAT1抑制剂。
通过体外ACAT1活性检测筛选化合物库,识别AH;检测其对ACAT1的抑制活性及选择性;通过NMR、热位移实验和分子对接研究其结合机制。
验证AH是否能特异性破坏ACAT1四聚体并阻止其再形成。
用AH处理纯化的ACAT1,通过非变性凝胶电泳和Western blot分析四聚体/单体变化;使用3H-AH结合实验确定其结合偏好;检测AH处理后的单体能否重新形成四聚体。
研究Y407磷酸化是否通过稳定四聚体而非促进单体聚合来增强ACAT1活性。
用FGFR1和/或AH处理ACAT1,检测四聚体/单体比例和Y407磷酸化;比较WT和Y407F突变体的行为。
验证Y407磷酸化对癌细胞增殖和代谢的影响。
构建ACAT1敲低并回补WT或Y407F的H1299细胞,检测细胞增殖、PDH活性、糖酵解率、乳酸产生、ROS、耗氧和ATP水平,并研究PDP1/PDHA1乙酰化突变体的影响。
评估AH对癌细胞增殖和肿瘤生长的抑制作用。
体外检测AH对多种癌细胞系增殖的影响;异种移植瘤模型中给予AH,评估肿瘤生长和肿瘤组织中ACAT1活性及代谢标志物。
验证AH对患者来源的原代白血病细胞的抑制作用。
从患者和健康供体中分离细胞,用AH处理,检测细胞活力、ACAT1活性、Y407磷酸化和四聚体水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ACAT1活性检测 | SpectraMax Plus分光光度计 | Molecular Devices | -- |
| 热位移实验 | 蛋白质热位移染料试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| 体外激酶实验 | 重组EGFR | -- | -- |
| 重组FGFR1 | -- | -- | |
| 化合物筛选 | The Spectrum Collection化合物库 | MicroSource | -- |
| 细胞处理 | L-半胱氨酸 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ACAT1活性检测 | 缓冲液组成(50mM Tris-HCl pH8.1, 20mM MgCl2, 40mM KCl, 10µM acetoacetyl-CoA, 60µM CoA),蛋白量100ng 阅读提示:Experimental Procedures: ACAT1 activity assay and inhibitor screening |
| 细胞培养和处理 | 细胞系(NIH/3T3, H1299, K562等)及培养条件,EGF浓度和处理时间,AH浓度和处理时间 阅读提示:Figure legends 1C-1F, 4A-4B, 6A-6C |
| Y407磷酸化检测 | ACAT1抗体,Y407磷酸化特异性抗体,Western blot条件 阅读提示:Figure legends 2D, 4A, 6D, 7A |
| 四聚体/单体分析 | 非变性凝胶电泳条件(10%丙烯酰胺,0.375M Tris-HCl pH8.8,无SDS),细胞裂解物制备 阅读提示:Experimental Procedures: Native PAGE |
| 体外激酶实验 | 重组激酶(EGFR, FGFR1等)的浓度和活性,ATP浓度,反应缓冲液和温度时间 阅读提示:Figure legends 1F, 2B, 2E-2F, 4C-4D |
| ACAT1活性检测 | 检测波长303nm,使用SpectraMax Plus分光光度计 阅读提示:Experimental Procedures: ACAT1 activity assay and inhibitor screening |