siRNA敲低kinesin-12或kinesin-5
确定kinesin-12对星形胶质细胞增殖和迁移的影响
使用siRNA转染培养的星形胶质细胞敲低kinesin-12或kinesin-5,通过qRT-PCR和western blot验证敲低效率,然后进行EdU增殖实验和Transwell迁移实验
Depletion of kinesin-12, a myosin-IIB-interacting protein, promotes migration of cortical astrocytes.
包含体外培养星形胶质细胞模型,结合siRNA敲低、EdU增殖、Transwell迁移、Co-IP、GST pull-down、FRET及定点突变等功能和机制验证。
大鼠皮层星形胶质细胞原代培养 新生大鼠(P1)
星形胶质细胞原代培养纯度(GFAP阳性>95%) siRNA敲低效率(qRT-PCR和western blot确认) Transwell迁移实验(8 μm孔径,无趋化因子) kinesin-12 T1142磷酸化位点 myosin-IIB相互作用结构域(氨基酸1345-1976)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定kinesin-12对星形胶质细胞增殖和迁移的影响
使用siRNA转染培养的星形胶质细胞敲低kinesin-12或kinesin-5,通过qRT-PCR和western blot验证敲低效率,然后进行EdU增殖实验和Transwell迁移实验
确定kinesin-12是否与myosin-IIB直接相互作用并定位相互作用结构域
使用抗kinesin-12抗体进行免疫共沉淀,检测myosin-IIB和myosin-IIA;使用GST-tagged kinesin-12截短体和His-tagged myosin-IIB截短体进行GST pull-down实验
验证kinesin-12和myosin-IIB在星形胶质细胞中的共定位和直接相互作用
使用免疫细胞化学检测kinesin-12和myosin-IIB的共定位;共转染kinesin-12-GFP和myosin-IIB-mCherry进行FRET分析(受体光漂白)
确定kinesin-12 Thr1142磷酸化是否调节与myosin-IIB的相互作用及细胞迁移
构建T1142A(磷酸化突变体)和T1142D(磷酸化模拟)突变体,转染星形胶质细胞,进行Transwell迁移实验、免疫细胞化学共定位分析、Co-IP检测与myosin-IIB的结合
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| 谷氨酰胺 | Invitrogen | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 多聚-L-赖氨酸 | Gibco | -- | |
| siRNA处理 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Western blotting | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 抗kinesin-12抗体 | Abmart | 11313-1hz | |
| 抗kinesin-5抗体 | SAB | 27083 | |
| 抗myosin-IIA抗体 | Cell Signaling Technology | 3403 | |
| 抗myosin-IIB抗体 | Abcam | ab684 | |
| 细胞增殖检测 | Cell-Light™ EdU DNA细胞增殖检测试剂盒 | Ribobio | -- |
| 迁移实验 | 8 μm孔径Transwell小室 | Costar | -- |
| 免疫共沉淀 | 免疫共沉淀试剂盒 | Pierce | -- |
| NP-40细胞裂解液 | Pierce | -- | |
| GST pull-down | 谷胱甘肽凝胶 | 7Sea Pharmatech | -- |
| 抗His6标签抗体 | Abcam | ab18184 | |
| 抗GST抗体 | Abcam | ab9058 | |
| FRET | HP X-tremeGENE DNA转染试剂 | Roche | -- |
| 免疫细胞化学 | GFP抗体 | BiYunTian | AG279 |
| 抗myosin-IIB抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-376954 | |
| 定点突变 | QuikChange® Lightning定点突变试剂盒 | Stratagene | -- |
| 仪器 | Odyssey红外成像系统 | LI-COR | -- |
| 激光共聚焦扫描显微镜 | Leica | TCS SP5 | |
| DMR荧光显微镜 | Leica | -- | |
| 流式细胞仪 | BD | FACS-Aria | |
| 超声匀浆器 | Ningbo Scientz Biotechnology | JY92-2D |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 星形胶质细胞原代培养 | 细胞来源(新生大鼠P1)、培养基(DMEM+10%FBS+0.5mM谷氨酰胺+1%青霉素-链霉素)、培养条件(37°C,5% CO2)、纯化方法(摇床150rpm 14-16小时)、GFAP阳性比例>95% 阅读提示:Materials and Methods, Cell culture and reagents |
| siRNA处理 | siRNA序列(Table S1)、转染试剂(Lipofectamine 2000)、转染时间(24小时后重新铺板)、敲低效率(>80%) 阅读提示:Materials and Methods, siRNA treatment and western blotting; Table S1 |
| 增殖检测 | EdU浓度(50 μM)、孵育时间(24小时)、固定(4%甲醛30分钟)、检测试剂盒(Cell-Light™ EdU Kit) 阅读提示:Materials and Methods, Analyses of cell proliferation and migration |
| 迁移检测 | Transwell孔径(8 μm)、上室细胞数(3×10^4)、下室培养基体积(600 μl)、迁移时间、染色(0.1%结晶紫) 阅读提示:Materials and Methods, Analyses of cell proliferation and migration |
| Co-IP | 抗体(抗kinesin-12、抗myosin-IIB、抗GFP)、细胞裂解液(NP-40)、免疫共沉淀试剂盒(Pierce) 阅读提示:Materials and Methods, Co-immunoprecipitation |
| GST pull-down | 截短构建体(GST-K-12 743-1333, His-myosin-IIB-1/2/3)、IPTG浓度(0.4 mM)、孵育时间(4°C过夜) 阅读提示:Materials and Methods, GST pulldown assay |
| FRET | 细胞接种密度(0.5×10^5/24孔)、转染试剂(X-tremeGENE HP)、转染后时间(48小时)、固定(4% PFA) 阅读提示:Materials and Methods, Fluorescence resonance energy transfer |
| 定点突变和过表达 | 突变试剂盒(QuikChange Lightning)、突变位点(T1142A/T1142D)、转染试剂(X-tremeGENE HP)、表达时间 阅读提示:Materials and Methods, Site-directed mutagenesis and gene overexpression of kinesin-12 mutants |