Ca2+依赖性HDAC4/5磷酸化检测
验证离子霉素刺激是否诱导HDAC4和HDAC5磷酸化。
用0.5 μM离子霉素刺激VSM细胞,时间梯度0-60分钟,免疫印迹检测磷酸化HDAC4(Ser632)和HDAC5(Ser498)。
MEF2 is regulated by CaMKIIδ2 and a HDAC4-HDAC5 heterodimer in vascular smooth muscle cells.
包括细胞培养、免疫印迹、免疫沉淀、免疫荧光、报告基因检测和定量PCR等多种实验,并涉及功能获得与缺失验证。
大鼠主动脉血管平滑肌细胞(原代培养)
细胞来源:Sprague-Dawley大鼠胸主动脉中膜 刺激条件:离子霉素(0.5 μM)、Ang II(100 nM)、PDGF(10 ng/ml) CaMKIIδ2敲低方法:shRNA(腺病毒)和siRNA(电穿孔) HDAC4敲低方法:siRNA电穿孔 检测时间点:磷酸化(10 min)、MEF2 DNA结合(10 min)、mRNA(1 hr)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证离子霉素刺激是否诱导HDAC4和HDAC5磷酸化。
用0.5 μM离子霉素刺激VSM细胞,时间梯度0-60分钟,免疫印迹检测磷酸化HDAC4(Ser632)和HDAC5(Ser498)。
验证磷酸化HDAC4的亚细胞定位变化。
离子霉素刺激后分离核质组分,免疫印迹检测HDAC4分布。
验证Ca2+刺激是否增强MEF2 DNA结合能力。
离子霉素刺激VSM细胞,使用TransAm MEF2 Assay检测MEF2 DNA结合活性。
验证组成性活化的CaMKIIδ2是否足以诱导HDAC磷酸化和MEF2激活。
感染表达组成性活化CaMKIIδ2(T287D)的腺病毒,检测HDAC4/5磷酸化和MEF2 DNA结合。
验证CaMKIIδ2敲低是否抑制Ca2+诱导的MEF2激活和靶基因表达。
用shRNA或siRNA敲低CaMKIIδ2,刺激离子霉素,检测MEF2 DNA结合活性及Nur77和MCP1 mRNA水平。
验证AngII和PDGF是否诱导HDAC4/5磷酸化和核质穿梭。
用AngII或PDGF刺激VSM细胞,检测磷酸化HDAC4/5和核质分布。
验证CaMKIIδ2敲低或激酶失活是否减弱AngII/PDGF诱导的HDAC磷酸化。
用shRNA敲低CaMKIIδ2或表达激酶阴性CaMKIIδ2,刺激AngII或PDGF,检测HDAC4/5磷酸化。
验证AngII和PDGF对MEF2 DNA结合的影响及CaMKIIδ2的参与。
刺激AngII或PDGF,检测MEF2 DNA结合活性;敲低CaMKIIδ2后重复实验。
验证内源性CaMKIIδ2与HDAC4和HDAC5的物理相互作用及其调控。
免疫沉淀CaMKIIδ2或HDAC4,免疫印迹检测共沉淀的蛋白。
验证HDAC4是否介导HDAC5的磷酸化。
用siRNA敲低HDAC4或过表达显性抑制型HDAC4(3S>A),刺激AngII或PDGF,检测HDAC5磷酸化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco-BRL | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 硝酸纤维素膜 | GE Lifesciences | -- | |
| 增强化学发光底物 | GE Lifesciences | -- | |
| X光胶片 | E.M. Parker | -- | |
| Fuji LAS 4000成像系统 | Fuji Inc. | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A琼脂糖珠子 | Thermo Scientific | -- |
| 免疫荧光 | 胶原蛋白(PureCol) | -- | -- |
| 二抗 | Molecular Probes Inc. | -- | |
| Leica DM IRB倒置荧光显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss LSM 510 META共聚焦显微镜 | Carl Zeiss, Inc. | -- |
| 细胞转染 | Amaxa核转染系统 | Lonza Group LTD. | -- |
| Fugene HD转染试剂 | Roche Applied Science | -- | |
| 腺病毒感染 | 腺病毒 | -- | -- |
| MEF2 DNA结合实验 | TransAm MEF2检测试剂盒 | Active Motif | -- |
| 核提取试剂盒 | Active Motif | -- | |
| 定量PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| QuantiTect反转录试剂盒 | Qiagen | -- | |
| Brilliant III Ultra-Fast SYBR染料 | Agilient | -- | |
| Mx3000P定量PCR仪 | Agilent | -- | |
| 抗体 | HDAC4抗体 | Santa Cruz, Inc. | -- |
| HDAC7抗体 | Santa Cruz, Inc. | -- | |
| HDAC5抗体 | Signalway Antibody Inc. | -- | |
| 磷酸化HDAC4(Ser632)抗体 | Abnova | -- | |
| 磷酸化HDAC5(Ser498)抗体 | Abcam | -- | |
| CaMKIIδ2抗体 | -- | -- | |
| 泛CaMKII抗体 | -- | -- | |
| RNA干扰 | HDAC4 siRNA池 | Dharmacon Inc. | -- |
| CaMKIIδ2 siRNA池 | Dharmacon Inc. | -- | |
| 质粒 | pMAXGFP质粒 | Lonza | -- |
| 突变HDAC4(Ser278,478,632突变为Ala)表达质粒 | Addgene Inc. | -- | |
| 组织培养 | 组织培养基 | Gibco-BRL | -- |
| 组织培养用品 | Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | SDS-PAGE耗材 | Bio-Rad Inc. | -- |
| 其他 | 其他化学试剂 | Sigma Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞来源:Sprague-Dawley大鼠胸主动脉中膜;培养条件:DMEM/F12+10% FBS,37°C,5% CO2;传代次数:3-10次 阅读提示:Materials and methods, Cell Culture |
| 免疫印迹 | 裂解液:改良RIPA缓冲液;检测蛋白:HDAC4, HDAC5, phospho-HDAC4 Ser632, phospho-HDAC5 Ser498, CaMKIIδ2等;一抗孵育时间和温度需参考图注 阅读提示:Materials and methods, Cell Lysates and Immunoblotting; Figure legends |
| 免疫沉淀 | 抗体:CaMKIIδ2, HDAC4;蛋白A珠子:Thermo Scientific;刺激条件:AngII或离子霉素10 min 阅读提示:Materials and methods, Immunoprecipitations; Figure 7 legend |
| 细胞转染和病毒感染 | siRNA转染:Amaxa Nucleofectin系统;质粒转染:Fugene HD;腺病毒感染:MOI=50,感染时间:16小时(用于功能获得实验) 阅读提示:Materials and methods, Cell Transfections and adenoviral infections |
| MEF2 DNA结合实验 | 核提取:Active Motif核提取试剂盒;刺激条件:离子霉素0.5 μM,AngII 100 nM,PDGF 10 ng/ml;时间点:10 min 阅读提示:Materials and methods, MEF2 DNA Binding Assay; Figure 6 legend |
| 定量PCR | RNA提取:Trizol;反转录:QuantiTect;SYBR:Brilliant III Ultra-Fast;刺激条件:离子霉素0.25 μM或AngII 100 nM,处理1小时;引物序列见Methods 阅读提示:Materials and methods, Quantitative PCR |
| 统计分析 | 数据表示为均值±SE;组间比较ANOVA + Newman-Keuls检验;P<0.05显著性 阅读提示:Materials and methods, Statistics |