GSK3对IGF-IR表达的调控验证
验证GSK3是否影响IGF-IR蛋白及mRNA水平。
使用LiCl(GSK3抑制剂)处理或siRNA敲低GSK3β/GSK3α,检测IGF-IR蛋白和mRNA表达;过表达组成性活化或激酶失活的GSK3β突变体,检测IGF-IR表达水平。
GSK3 protein positively regulates type I insulin-like growth factor receptor through forkhead transcription factors FOXO1/3/4.
包含细胞模型(HepG2、SMMC-7721)中的Western blot、RT-PCR、ChIP、荧光素酶报告基因、EdU增殖实验,以及siRNA敲低和过表达验证。
人肝癌细胞系HepG2 人肝癌细胞系SMMC-7721
GSK3β敲低或LiCl抑制对IGF-IR表达的影响 FOXO1/3/4敲低对IGF-IR表达及肝癌细胞增殖的影响 LiCl或GSK3β敲低对IGF-I诱导的IGF-IR、Akt、ERK1/2磷酸化的影响 血清饥饿或Akt抑制对IGF-IR表达及FOXO活性的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证GSK3是否影响IGF-IR蛋白及mRNA水平。
使用LiCl(GSK3抑制剂)处理或siRNA敲低GSK3β/GSK3α,检测IGF-IR蛋白和mRNA表达;过表达组成性活化或激酶失活的GSK3β突变体,检测IGF-IR表达水平。
确定FOXO是否直接结合IGF-IR启动子并调控其表达。
使用ChIP实验检测FOXO1在IGF-IR启动子区域的结合;siRNA敲低FOXO1、FOXO3或FOXO4,检测IGF-IR蛋白表达。
验证GSK3是否正向调节FOXO的转录激活活性。
通过FOXO-responsive荧光素酶报告基因检测LiCl处理、GSK3β敲低或过表达GSK3β突变体对FOXO活性的影响。
研究在血清饥饿或Akt抑制条件下,GSK3和FOXO对IGF-IR表达及FOXO活性的影响。
在低血清(0.5%)或Akt抑制剂条件下,检测IGF-IR表达、FOXO活性及GSK3β磷酸化;结合LiCl或siRNA处理,观察对IGF-IR上调的影响。
验证GSK3β是否影响IGF-I诱导的下游信号激活。
LiCl处理或GSK3β敲低后,血清饥饿处理,再用IGF-I刺激,检测IGF-IR、Akt、ERK1/2磷酸化水平。
评估GSK3β与FOXO1/3/4在IGF-I诱导的细胞增殖中的作用。
使用EdU实验检测LiCl、GSK3β敲低或FOXO1/3/4敲低对细胞增殖及IGF-I诱导增殖的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 氯化锂 | Sigma | -- |
| 胰岛素样生长因子I | PeproTech Inc. | -- | |
| Western blotting | 抗IGF-IR抗体 | Cell Signaling Technology | -- |
| 抗FOXO1抗体 | Cell Signaling Technology | sc-11350 | |
| 抗FOXO3抗体 | Cell Signaling Technology | 2497 | |
| 抗FOXO4抗体 | Cell Signaling Technology | 9472 | |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 抗磷酸化IGF-IR (Tyr-1135)抗体 | Cell Signaling Technology | 3918 | |
| 抗磷酸化Akt (Ser-473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| FOXO1抗体(用于ChIP) | Abcam Ltd. | ab39670 | |
| 抗GSK3抗体 | Signalway Antibody LLC | SAB-390 | |
| 抗磷酸化GSK3β (Ser-9)抗体 | Eptomics | E1A6006 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-1615 | |
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良鹰培养基 | -- | -- |
| 新生牛血清 | -- | -- | |
| RNA干扰 | 靶向GSK3β的siRNA | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | -- |
| 靶向FOXO1的siRNA | GenePharma Co., Ltd | -- | |
| 靶向FOXO3的siRNA | GenePharma Co., Ltd | -- | |
| 靶向FOXO4的siRNA | GenePharma Co., Ltd | -- | |
| 细胞转染 | OPTI-MEM I低血清培养基 | Invitrogen | 31985-070 |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668-027 | |
| Western blotting | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| HRP标记二抗 | -- | -- | |
| 化学荧光试剂 | -- | -- | |
| TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596-026 | |
| RT-PCR | 莫洛尼鼠白血病病毒逆转录酶 | -- | 28025-013 |
| oligo(dT)引物 | -- | -- | |
| SYBR Select预混液 | Invitrogen | 4472908 | |
| CHIP实验 | 染色质免疫沉淀系统 | Millipore Corp. | 17-295 |
| 荧光素酶报告基因实验 | FOXO响应性荧光素酶报告基因质粒 | Addgene Inc. | -- |
| 报告基因裂解缓冲液 | Promega BioSciences | E3971 | |
| 荧光素酶检测试剂盒 | Promega | E1500 | |
| EdU实验 | EdU培养基 | -- | -- |
| 甘氨酸 | -- | 56-40-6 | |
| Triton X-100 | -- | 9002-93-1 | |
| Apollo 567工作液 | -- | -- | |
| Hoechst 33342 | -- | 23491-52-3 | |
| 细胞培养 | Akt抑制剂 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系(HepG2、SMMC-7721),培养基(DMEM+10%新生牛血清),培养条件(37°C、5% CO2),LiCl浓度(10 mM),IGF-I处理时间(15分钟),血清饥饿条件(0.5%血清)。 阅读提示:见Experimental Procedures中的Cell Culture与Reagents,以及各图注。 |
| RNA干扰 | siRNA靶序列(GSK3β:GATCTGTCTTGAAGGAGAA和ATAGTCCGATTGCGTTATT;FOXO1:GAGCGTGCCCTACTTCAAG;FOXO3:CAACCTGTCACTGCATAGT;FOXO4:AGAAGCCGATATGTGGACC),siRNA浓度(50 nM),转染试剂(Lipofectamine 2000)。 阅读提示:见Experimental Procedures中的RNA Interference。 |
| Western blotting | 细胞裂解液(RIPA裂解液含蛋白酶抑制剂),蛋白上样量(30 μg),一抗孵育条件(4°C过夜),二抗孵育(室温1小时),检测试剂。 阅读提示:见Experimental Procedures中的Western Blotting。 |
| RT-qPCR | 引物序列(GSK3β:CTCCTCATGCTCGGATTCA/TGCAGAAGCAGCATTATTGG;IGF-IR:AATCGCATCATCATAACCTG/CATCCTGCCCATCATACTC),内参基因β-actin,分析方法(2^-ΔCt)。 阅读提示:见Experimental Procedures中的Quantitative Reverse Transcription-PCR。 |
| CHIP实验 | 甲醛固定时间(10分钟),超声片段大小(200-1000 bp),抗体(抗FOXO1或IgG),PCR引物。 阅读提示:见Experimental Procedures中的Chromatin Immunoprecipitation (CHIP) Assay及图2A。 |
| 荧光素酶报告基因实验 | FOXO-luc报告基因用量(320 ng/孔),转染试剂(Lipofectamine),检测时间(转染后24小时),裂解缓冲液(1× reporter lysis buffer)。 阅读提示:见Experimental Procedures中的Luciferase Assay。 |
| EdU实验 | 细胞密度(5000细胞/孔),EdU孵育时间(2小时),处理时间(24小时),检测试剂(Apollo 567,Hoechst 33342)。 阅读提示:见Experimental Procedures中的Cell-lightTM EdU Assay。 |