验证Zap70在mESCs中的表达
确定Zap70是否在未分化mESCs中表达,并与分化状态相关。
通过qRT-PCR和免疫印迹检测EL4细胞、mESCs和MEF中Zap70的mRNA和蛋白水平,并在RA诱导分化过程中监测Zap70表达变化。
Zap70 functions to maintain stemness of mouse embryonic stem cells by negatively regulating Jak1/Stat3/c-Myc signaling.
包含体外细胞实验(Zap70敲低/过表达)、信号通路分析(免疫印迹、qRT-PCR)、功能验证(自我更新、分化、凋亡、增殖)、体内畸胎瘤实验及挽救实验。
J1小鼠胚胎干细胞系 DBA/252小鼠胚胎干细胞系 NOD/SCID小鼠畸胎瘤模型
Zap70敲低效率:约90%,使用shRNA质粒H-1-3和H-1-4克隆 LIF浓度范围:0-1000 U/ml,用于自我更新和存活实验 Stat3抑制剂Stattic处理时间:24小时 LIF饥饿时长:24小时,用于信号刺激实验 畸胎瘤形成实验:5×10^5细胞皮下注射NOD/SCID小鼠,观察6周
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Zap70是否在未分化mESCs中表达,并与分化状态相关。
通过qRT-PCR和免疫印迹检测EL4细胞、mESCs和MEF中Zap70的mRNA和蛋白水平,并在RA诱导分化过程中监测Zap70表达变化。
探究Zap70缺失对mESCs全局基因表达的影响,特别是多能性相关基因。
通过shRNA转染和嘌呤霉素筛选建立Zap70KD克隆(H-1-3和H-1-4),进行微阵列分析,并用qRT-PCR和免疫印迹验证关键基因表达。
验证Zap70敲低是否导致Stat3激活和c-Myc上调,并确定其因果关系。
免疫印迹检测磷酸化Stat3和c-Myc水平,使用Stattic(Stat3抑制剂)处理24小时,并检测Stat3下游靶基因表达。
检测Zap70敲低是否增强mESCs的自我更新和对LIF的依赖性降低。
在不同LIF浓度下培养,观察细胞形态,检测碱性磷酸酶活性、Oct4表达、细胞凋亡(annexin V)、二次胚体形成效率和细胞增殖。
探究Zap70敲低是否损害mESCs的体外和体内分化能力。
通过RA诱导分化观察形态变化,并皮下注射mESCs到NOD/SCID小鼠形成畸胎瘤,进行组织学分析。
明确Zap70如何影响Jak1/Stat3信号通路,关注LIFR表达和SHP-1活性。
LIF饥饿后刺激,检测Jak1和Stat3磷酸化水平,测量LIFR和gp130表达,通过免疫共沉淀和磷酸酶活性实验分析SHP-1活性及与Zap70的相互作用。
通过瞬时过表达Zap70验证其对Stat3和c-Myc的抑制作用,并确认SHP-1的参与。
在mESCs中瞬时转染Zap70表达质粒,检测磷酸化Stat3和c-Myc水平,以及碱性磷酸酶活性;部分实验共转染siSHP-1。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良鹰培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| 白血病抑制因子 | Chemicon | -- | |
| 基因修饰 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 靶向小鼠ZAP70的shRNA质粒 | Open Biosystems | RMM3981-9590842 | |
| RNA提取与RT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| SuperScriptII第一链合成系统 | Invitrogen | -- | |
| Quantitect SYBR Green PCR试剂盒 | Qiagen | -- | |
| Exicycler 96实时荧光定量热循环仪 | Bioneer | -- | |
| 免疫印迹 | 抗ZAP70抗体 | Santa Cruz | sc-574 |
| 抗磷酸化ZAP70 (Tyr-493)抗体 | Cell Signaling | 2704 | |
| 抗磷酸化Stat3 (Tyr-705)抗体 | Cell Signaling | 9131 | |
| 抗磷酸化JAK (Tyr-1022)抗体 | Signalway Antibody | 11149 | |
| 抗c-Myc抗体 | Santa Cruz | sc-764 | |
| 抗Oct4抗体 | Abcam | ab19857 | |
| 抗ERK抗体 | Santa Cruz | sc-154 | |
| 抗磷酸化ERK (Thr202/Tyr204)抗体 | Sigma | -- | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Santa Cruz | sc-1616 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Santa Cruz | sc-30169 | |
| PVDF膜 | Perkin Elmer Life Sciences | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Amersham | -- | |
| 细胞凋亡分析 | Annexin V-FITC | BD PharMingen | -- |
| 碘化丙啶 | BD PharMingen | -- | |
| 畸胎瘤形成 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 微阵列 | Illumina TotalPrep RNA扩增试剂盒 | Ambion | -- |
| Illumina小鼠WG-6表达芯片 | Illumina | -- | |
| Illumina微珠阵列共聚焦扫描仪 | Illumina | -- | |
| 显微镜检查 | ECLIPSE TE2000倒置显微镜 | Nikon | -- |
| 碱性磷酸酶活性 | 碱性磷酸酶活性检测试剂盒 | AnaSpec | 71230 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与试剂 | 细胞系:J1 mESCs (ATCC #SCRC-1010)、DBA/252 mESCs;培养基成分:DMEM、15% FCS、0.1 mM 2-巯基乙醇、100 U/ml青霉素、100 µg/ml链霉素、2 mM谷氨酰胺、1000 U/ml LIF 阅读提示:材料与方法:Reagents and Cell culture |
| Zap70敲低细胞系建立 | shRNA质粒:靶向小鼠ZAP70的shRNA质粒(Open Biosystems, RMM3981-9590842);转染试剂:Lipofectamine 2000;筛选浓度:1 µg/ml嘌呤霉素 阅读提示:材料与方法:Genetic modification of mESCs |
| 信号通路分析 | LIF饥饿时间:24小时;LIF刺激时间:0-30分钟;抗体:抗磷酸化Stat3 (Y705) #9131、抗磷酸化JAK (Y1022) #11149等;Stattic处理:24小时(浓度未明确) 阅读提示:结果:Expression of c-Myc is robustly up-regulated...;图2E |
| 自我更新功能分析 | LIF浓度梯度:0, 10, 50, 100, 1000 U/ml;培养时间:4天;检测:碱性磷酸酶活性、Oct4免疫印迹、annexin V凋亡、二次EB形成、XTT增殖 阅读提示:结果:Zap70KD has enhanced self-renewal capacity;图3 |
| 分化能力分析 | RA诱导分化时间:4天EB形成后3天分化;畸胎瘤形成:5×10^5细胞皮下注射NOD/SCID小鼠,观察4-6周;组织学染色:H&E、Masson's trichrome、Alcian Blue 阅读提示:结果:Defective differentiation capacity in Zap70KD;图4 |
| SHP-1活性分析 | 免疫沉淀:抗SHP-1抗体;磷酸酶活性测定方法;LIF刺激时间点 阅读提示:结果:Altered LIFR expression and SHP-1 enzymatic activity...;图5 |