P3a定点诱变
引入点突变、缺失、插入或替换
使用带3'突出端的引物对进行PCR扩增,然后DpnI消化,转化DH5α。示例包括Q493E点突变和BRPF1 N端缺失。
Seamless and Highly Efficient Site-directed Mutagenesis for Protein, RNA, and Plasmid Engineering.
提供了详细的实验方案和示例结果,但主要验证了诱变效率,缺少多层级独立验证。
DH5α大肠杆菌
诱变效率接近100%:仅需分析两个菌落 PCR循环数:19-22个循环 引物设计:3'突出端,互补区9 bp Q5或SuperFi II DNA聚合酶的使用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
引入点突变、缺失、插入或替换
使用带3'突出端的引物对进行PCR扩增,然后DpnI消化,转化DH5α。示例包括Q493E点突变和BRPF1 N端缺失。
获得携带突变质粒的细菌菌落
将DpnI消化产物转化入化学感受态DH5α细胞,涂布于含抗生素的LB琼脂平板。
验证突变是否正确引入
从菌落中接种液体培养,使用QIAprep Spin Miniprep Kit提取质粒,进行Sanger测序并分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| PCR扩增 | Q5热启动预混液 | New England Biolabs | M0494S |
| Platinum SuperFi II PCR预混液 | Thermo Fisher Scientific | 12368010 | |
| DpnI消化 | DpnI限制性内切酶 | New England Biolabs | R0176 |
| 质粒提取 | QIAprep 旋转小提试剂盒 | Qiagen | 27106 |
| PCR扩增 | Pfu_Ultra高保真DNA聚合酶 | Agilent | 600380 |
| 培养基配制 | 胰蛋白胨 | Oxoid | LP0042B |
| 酵母提取物 | Gibco | 212750 | |
| 氯化钠 | Bioshop Canada | SOD004 | |
| 琼脂 | MultiCell | 80-001-0CG | |
| 葡萄糖 | Sigma | G8270 | |
| 感受态细胞制备 | DH5α感受态细胞 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PCR扩增 | 引物浓度和设计、PCR循环数、延伸时间 阅读提示:见Basic Protocol 1和Figure 3 |
| DpnI消化 | DpnI用量和消化时间 阅读提示:见Basic Protocol 1步骤5-6 |
| 转化 | 感受态细胞用量、热激温度和时间 阅读提示:见Basic Protocol 2 |
| 质粒提取 | 细菌培养时间和转速、离心条件 阅读提示:见Basic Protocol 3 |