circRNA设计与体外表达验证
验证circRNA能否表达融合抗原并保留关键表位
设计了circVB16T13,通过Sanger测序和RNase H消化验证环化;在HEK293T和A549细胞中检测表达和翻译持续性;通过SPR检测糖基化对抗原表位的影响。
A circular RNA vaccine induces durable and cross-protective immunity against Neisseria meningitidis serogroup B in mice.
包含体外细胞表达与表位分析、小鼠免疫原性与攻毒保护实验、被动转移实验等多层级验证,并明确功能验证和机制验证。
6周龄雌性BALB/c小鼠 ICR (CD-1) 远交系小鼠 7日龄Wistar大鼠幼崽 HEK293T、A549、NIH 3T3、Expi293F细胞系
circRNA纯化:RNase R消化和SEC,纯度90.7% (CE)和71.1% (CGE-LIF) BALB/c小鼠免疫剂量:15 μg或30 μg circRNA-LNP,肌肉注射,三剂,间隔2周 攻毒模型:MC58菌株2×10^6 CFU腹腔注射,感染前16小时肌肉注射10 mg铁葡聚糖 SBA分析:使用人补体,起始稀释度1:4,血清56°C灭活30分钟 CD8+ T细胞耗竭:抗CD8α抗体200 μg/只,攻毒前第-3天和-1天腹腔注射
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证circRNA能否表达融合抗原并保留关键表位
设计了circVB16T13,通过Sanger测序和RNase H消化验证环化;在HEK293T和A549细胞中检测表达和翻译持续性;通过SPR检测糖基化对抗原表位的影响。
评估circRNA疫苗诱导的体液和细胞免疫反应
BALB/c小鼠免疫三剂circRNA-LNP或蛋白疫苗,检测血清抗体滴度、SBA滴度、IgG亚类、Tfh和GC B细胞频率、细胞因子分泌。
评估circRNA疫苗对致死性MC58攻击的保护效果
在攻击前用铁葡聚糖处理,腹腔注射MC58,监测菌血症和存活率,进行组织病理学检查。
评估circRNA疫苗对中国流行菌株的杀菌活性
使用三剂免疫的BALB/c小鼠血清和两剂免疫的CD-1小鼠血清,对18株菌株和7株菌株进行hSBA检测,并与许可疫苗比较。
评估免疫反应的持久性及血清的保护性转移
单剂或两剂免疫CD-1小鼠,检测SBA滴度至24周;将免疫小鼠血清被动转移至大鼠幼崽,攻击后检测菌血症。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| circRNA制备 | 核糖核酸酶R | -- | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| SMM 293-TII表达培养基 | SinoBiological | -- | |
| 细菌培养 | 血琼脂平板 | HuanKai Microbial | -- |
| SBA | Hanks平衡盐溶液 | Gibco | -- |
| 人补体 | Pel-Freez | -- | |
| 攻毒实验 | 铁葡聚糖 | -- | -- |
| CD8+T细胞耗竭 | 抗CD8α抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| circRNA制备与纯化 | RNase R消化条件、SEC条件、纯度标准(CE和CGE-LIF) 阅读提示:材料与方法部分和S1C Fig |
| 细胞转染与表达 | 细胞系、转染剂量(1 μg)、检测时间点(24-96小时) 阅读提示:Results 的“circRNA robustly expressed...”部分和S2D Fig |
| 免疫原性实验 | 小鼠品系和性别、周龄、每组数量(n=5)、免疫剂量(15或30 μg circRNA;20 μg蛋白)、免疫途径(肌注或皮下)、间隔(2周)、佐剂使用 阅读提示:Materials and methods 的 Immunization 部分和Fig 3A |
| 攻毒保护实验 | 攻毒菌株(MC58)、攻毒剂量(2×10^6 CFU)、攻毒途径(腹腔)、铁葡聚糖剂量(10 mg)和时间(攻毒前16小时)、监测时间点 阅读提示:Materials and methods 的 Challenge assay 部分和S7 Fig |
| SBA分析 | 血清起始稀释度(1:4)、人补体稀释度(1:4)、细菌浓度(1.25×10^4 CFU/mL)、孵育条件(37°C,65 rpm,1小时) 阅读提示:Materials and methods 的 Serum bactericidal assay 部分 |
| 被动转移实验 | 大鼠品系(Wistar)、日龄(7天)、血清转移体积和稀释度(1:10)、攻毒剂量(1×10^6 CFU)、采血时间(3小时) 阅读提示:Materials and methods 的 Passive transfer 部分(原文未明确,可查Table 4) |