临床样本中APOA4表达检测
比较OA患者与非对照者IFP、滑液和血清中APOA4的表达水平。
收集OA和对照组的IFP组织、滑液和血清,分别通过IHC和ELISA检测APOA4表达。
APOA4 Protects Chondrocytes and Modulates Wnt Signaling in Osteoarthritis.
包含临床样本检测、体外细胞功能实验、过表达/敲低、炎症模型及转录组和Wnt通路初步验证,但缺乏体内实验和蛋白水平机制验证。
人软骨细胞系C28/I2 OA患者髌下脂肪垫组织 OA患者滑液和血清
APOA4在OA IFP、滑液和血清中的表达升高(n=3 IFP、n=11滑液/血清) 重组人APOA4处理浓度为5 nM,处理72小时 IL-1β刺激浓度为10 ng/mL,处理24小时,随后与5 nM APOA4共处理72小时 Wnt3a激活实验中Wnt3a浓度为100 ng/mL,预处理24小时,共处理72小时 RNA-seq GSEA显示Wnt信号负富集趋势(NES=-1.314,名义P=0.008,FDR q=1.00)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较OA患者与非对照者IFP、滑液和血清中APOA4的表达水平。
收集OA和对照组的IFP组织、滑液和血清,分别通过IHC和ELISA检测APOA4表达。
评估外源APOA4对软骨细胞合成代谢和分解代谢标志物的影响。
用5 nM重组人APOA4处理C28/I2软骨细胞72小时,qRT-PCR检测COL2、ACAN、MMP3、MMP13表达。
验证APOA4对软骨细胞基质基因的因果关系。
使用OE-APOA4质粒和si-APOA4转染C28/I2细胞,检测基质基因表达。
评估APOA4对软骨细胞增殖能力的影响。
使用CCK-8和集落形成实验检测APOA4处理后的细胞增殖。
评估APOA4对IL-1β诱导的软骨细胞炎症损伤的影响。
用IL-1β诱导炎症,随后加入APOA4共处理,检测基质基因表达。
探索APOA4作用的转录组机制并验证Wnt通路参与。
对APOA4处理前后的C28/I2细胞进行RNA-seq,并通过qPCR和Wnt3a拯救实验验证Wnt/β-catenin信号。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ELISA检测 | 人APOA4 ELISA试剂盒 | Cloud-Clone | SEA835Hu |
| SpectraMax iD3酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| 细胞培养 | C28/I2细胞系 | Kerafast | RRID: CVCL_0U51 |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 重组人APOA4 | Sino Biological | 11617-H08H |
| 重组人IL-1β | -- | -- | |
| 重组人Wnt3a | -- | -- | |
| 转染 | 脂质体3000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 靶向APOA4的siRNA | Nanjing Jixi Biotechnology Co., Ltd. | H337-siAPOA4-1 and H337-siAPOA4-2 | |
| pcDNA3.1(+)载体 | GenScript | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| RNA定量 | NanoDrop 2000c分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| qPCR | PowerUp SYBR Green预混液 | Thermo Fisher Scientific | A25742 |
| QuantStudio 5实时PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| CFX96实时PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| iTaq Universal SYBR Green预混液 | Bio-Rad | -- | |
| CCK-8检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | CK04 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本检测 | APOA4在IFP、滑液和血清中的表达水平;样本量;KL分级 阅读提示:Methods: Clinical Samples and Baseline Characteristics, ELISA; Figure 1 and 2 |
| 细胞处理 | APOA4处理浓度(5 nM)和处理时间(72小时);细胞密度(1×10^5 cells/well) 阅读提示:Methods: Chondrocyte Culture and APOA4 Treatment |
| 过表达和敲低 | 转染试剂(Lipofectamine 3000);质粒和siRNA浓度(50 nM);处理时间(过表达24小时,敲低48小时) 阅读提示:Methods: Overexpression and Silencing Experiments |
| 炎症模型 | IL-1β浓度(10 ng/mL)和处理时间(24小时);APOA4共处理浓度(5 nM)和时间(72小时) 阅读提示:Methods: Inflammatory Model and Treatment with IL-1β and APOA4 |
| Wnt通路验证 | Wnt3a浓度(100 ng/mL)和预处理时间(24小时);APOA4共处理时间(72小时) 阅读提示:Methods: Wnt Pathway Activation (Wnt3a Rescue Assay); Figure 11 |