细胞模型建立与验证
建立FoxM1过表达和敲低的胰腺癌细胞系,并验证其效果。
筛选10种胰腺癌细胞系中FoxM1表达水平,选择低表达的Panc10.05进行过表达,高表达的PaTu8988进行敲低,利用慢病毒载体和siRNA转染,并通过qPCR和Western blot验证。
A FoxM1/Smad4 positive feedback loop promotes pancreatic cancer progression.
包含体外细胞功能实验(迁移、侵袭、克隆形成)、分子机制实验(co-IP、EMSA、荧光素酶报告基因)、体内原位移植瘤模型及人组织样本多色免疫荧光验证,涉及多层级验证。
人胰腺癌细胞系Panc10.05(FoxM1低表达) 人胰腺癌细胞系PaTu8988(FoxM1高表达) BALB/c裸鼠原位胰腺癌移植瘤模型 人胰腺癌组织芯片(90例患者)
FoxM1过表达/敲低细胞系的构建与验证(Panc10.05过表达,PaTu8988敲低) TGF-β1刺激浓度(2.5、5、10 μg/ml)及SB-431542抑制浓度(10 μM) Smad4泛素化水平的变化(受FoxM1影响,MG132处理验证蛋白酶体途径) FoxM1与Smad4启动子结合位点(EMSA探针序列) 体内实验中细胞植入数量(5×10^5个细胞/50 μL PBS)及观察时间(5周)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立FoxM1过表达和敲低的胰腺癌细胞系,并验证其效果。
筛选10种胰腺癌细胞系中FoxM1表达水平,选择低表达的Panc10.05进行过表达,高表达的PaTu8988进行敲低,利用慢病毒载体和siRNA转染,并通过qPCR和Western blot验证。
验证胰腺癌细胞系对TGF-β1刺激及SB-431542抑制的应答性。
用不同浓度TGF-β1(0、2.5、5、10 μg/ml)和SB-431542(10 μM)处理细胞,通过Western blot检测Smad2/3磷酸化及EMT相关蛋白(N-钙黏蛋白、波形蛋白)的表达。
评估FoxM1对TGF-β1诱导的胰腺癌细胞迁移、侵袭和克隆形成能力的影响。
对Panc10.05和PaTu8988细胞进行TGF-β1和SB-431542处理,进行划痕实验、Transwell侵袭实验和克隆形成实验。
验证FoxM1是否通过抑制泛素-蛋白酶体途径降解来稳定Smad4。
利用co-IP检测FoxM1与Smad4的结合及Smad4泛素化水平;用MG132、氯喹、环己酰亚胺处理细胞,观察Smad4蛋白水平变化。
验证Smad4能否结合FoxM1启动子并激活其转录,以及FoxM1能否结合Smad4启动子,形成相互调控。
通过EMSA检测FoxM1和Smad4对各自启动子探针的直接结合;通过荧光素酶报告基因检测Smad4对FoxM1启动子活性的影响。
验证FoxM1在体内对胰腺肿瘤生长的影响。
通过原位植入胰腺癌细胞到裸鼠胰腺,检测肿瘤形成大小和重量。
评估FoxM1/Smad4正反馈环路在人类胰腺癌组织中的表达及与分化程度的相关性。
利用人胰腺癌组织芯片进行多重免疫荧光染色,检测FoxM1、Smad4、p-Smad3和CK7表达;分析分化程度与表达水平的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MycoGuard™ 支原体PCR检测试剂盒 2.0 | iGeneBio | MP004 |
| Western blot | GAPDH抗体 | KeyGEN Biotech | KGAA002 |
| FoxM1抗体 | Abcam | ab207298 | |
| Smad4抗体 | Santa Cruz | sc-7966 | |
| 免疫沉淀 | Smad4抗体 | Abcam | ab236321 |
| Western blot | 泛素抗体 | Abcam | ab134953 |
| E-钙黏蛋白抗体 | Abcam | ab40772 | |
| N-钙黏蛋白抗体 | Abcam | ab98952 | |
| 磷酸化Smad2抗体 | Abcam | ab188334 | |
| 磷酸化Smad3抗体 | Abcam | ab52903 | |
| Smad2抗体 | Abcam | ab40855 | |
| Smad3抗体 | Abcam | ab40854 | |
| Snail1抗体 | Abcam | ab216347 | |
| Snail2抗体 | Abcam | ab51772 | |
| Twist抗体 | Abcam | ab175430 | |
| 波形蛋白抗体 | Abcam | ab92547 | |
| Zeb1抗体 | Abcam | ab203829 | |
| Zeb2抗体 | Abcam | ab138222 | |
| ZO-1抗体 | Abcam | ab96587 | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗兔IgG | KeyGEN Biotech | KGAA35 | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗鼠IgG | KeyGEN Biotech | KGAA37 | |
| 免疫荧光 | 荧光素标记的抗兔IgG | KeyGEN Biotech | KGAA99 |
| 细胞处理 | 重组人TGF-β1蛋白 | SinoBiological | 10804-H08H |
| MG132 | MCE | HY-13259 | |
| 氯喹 | MCE | HY-17598A | |
| 侵袭实验 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| RNA提取与qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript RT预混液 | TaKaRa | RR036B |
| 一步法PrimeScript RT-PCR试剂盒 | TaKaRa | RR086B | |
| 蛋白提取 | 总蛋白提取试剂盒 | KeyGen BioTECH | KGB5303 |
| 免疫共沉淀 | WB/IP裂解缓冲液试剂盒 | KeyGen BioTECH | KGB5202 |
| 免疫荧光 | Prolong Gold防淬灭剂 | -- | -- |
| 多重免疫荧光 | Opal 520染料 | PerkinElmer | NEL801001KT |
| Opal 570染料 | PerkinElmer | NEL801001KT | |
| Opal 650染料 | PerkinElmer | NEL801001KT | |
| Opal 690染料 | PerkinElmer | NEL801001KT | |
| Smad4抗体 | Abcam | ab40759 | |
| CK7抗体 | Abcam | ab181598 | |
| VECTASHIELD HardSet防淬灭封片剂 | Vector Labs | H-1400 | |
| 荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶检测试剂盒 | Promega | E1910 |
| GV238质粒 | Genechem | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000001 |
| EMSA | 核蛋白和胞浆蛋白提取试剂盒 | Jiangsu KGI Biotechnology Co., Ltd. | KGP150 |
| EMSA试剂盒 | Jiangsu KGI Biotechnology Co., Ltd. | KGS101 | |
| 统计分析 | SPSS 20.0软件 | IBM | -- |
| GraphPad Prism 8.3.0软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系选择与培养 | FoxM1过表达细胞系Panc10.05和敲低细胞系PaTu8988的构建,培养条件(培养基成分、血清浓度、添加物) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| TGF-β通路激活与抑制 | TGF-β1处理浓度(2.5、5、10 μg/ml)和SB-431542浓度(10 μM) 阅读提示:Results: FoxM1 promotes TGF-β-medicated migration...; Fig. 1 legend |
| 细胞功能实验 | 划痕实验融合度、侵袭实验细胞密度和基质胶体积、克隆形成细胞数和处理时间 阅读提示:Materials and methods: Migration, invasion and colony formation assays |
| Smad4稳定性和泛素化检测 | MG132、氯喹、环己酰亚胺的工作浓度和处理时间(文中未明确说明具体浓度) 阅读提示:Results: FoxM1 enhances Smad4 stability...; Fig. 4 legend |
| 启动子结合与转录活性 | EMSA探针序列、荧光素酶报告基因的构建和转染条件 阅读提示:Materials and methods: Luciferase assay, EMSA; Fig. 5 legend |
| 体内模型 | 细胞植入数量(5×10^5)、注射体积(50 μL)、观察时间(5周)、异氟烷浓度 阅读提示:Materials and methods: Orthotopic implantation of pancreatic cancer cells |
| 临床样本分析 | 组织芯片的规格、样本量(90例)、分化程度分组(7例低分化、9例高分化)、多重免疫荧光染色条件 阅读提示:Materials and methods: Patient samples; Immunostaining and multiplex immunofluorescence staining |