构建与表征融合抗体
生成IGF2融合抗体并验证其与MARV GP和IGF2R的结合能力
将人IGF2及其Y27L变体融合到AF-03轻链N端,在CHO-S细胞中表达纯化,通过SDS-PAGE和SPR检测结合亲和力
Pan-filovirus activity of an IGF2-fused monoclonal antibody: Impairment by IGF1R cross-engagement and rescue via IGF2 Y27L mutation.
包含多种体外实验,如SPR结合、细胞附着、内化、中和实验,并构建突变体及基因敲除验证,但缺乏动物实验或患者样本验证。
HEK293T细胞 假型丝状病毒(EBOV、SUDV、BDBV、TAFV、RESTV、BOMV、MARV、RAVN、MLAV、LLOV)
IGF2融合位点:轻链N端通过TVAAP接头 Y27L突变对IGF1R和IGF2R结合的影响 细胞表面IGF1R和IGF2R的表达水平 中和实验的抗体浓度范围:0.3 µM起始三倍稀释 病毒种类包括十种丝状病毒和三种EBOV突变体
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
生成IGF2融合抗体并验证其与MARV GP和IGF2R的结合能力
将人IGF2及其Y27L变体融合到AF-03轻链N端,在CHO-S细胞中表达纯化,通过SDS-PAGE和SPR检测结合亲和力
测试融合抗体对多种假型丝状病毒的中和能力
使用HIV假病毒携带不同丝状病毒GP,感染HEK293T细胞,检测荧光素酶活性计算抑制率
探究中和活性差异是否由于附着或内化缺陷
通过流式细胞术检测细胞表面附着,通过流式、共聚焦、ELISA和Western blot检测内化及定位
证明IGF2与IGF1R相互作用导致AF03-IL活性弱
检测细胞表面IGF1R和IGF2R表达;构建IGF1R敲除细胞;用可溶性IGF1R蛋白封闭IGF2结合
验证Y27L突变是否能消除IGF1R干扰并恢复活性
制备AF03-ILm1,检测与IGF1R和IGF2R结合,重复附着、内化和中和实验
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白表达 | ExpiCHO表达培养基 | Gibco | A2910001 |
| 蛋白纯化 | 镍柱 | GE Healthcare | 11003399 |
| SPR分析 | Biacore T200系统 | GE Healthcare | -- |
| 蛋白A芯片 | GE Healthcare | -- | |
| 胰岛素样生长因子2 | Abcam | ab283420 | |
| 假病毒制备 | JetPRIME转染试剂 | -- | -- |
| 0.45微米滤膜 | Millipore | SLHUR33RB | |
| 中和实验 | 重组人IGF1R蛋白 | Sino Biological | 10164-H08H-100 |
| Bright-Glo荧光素酶试剂 | Vazyme | DD1204 | |
| 附着实验 | PE抗人IgG1 Fc抗体 | Biolegend | 410708 |
| 流式分析 | FACSAria II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 内化实验 | 内化试剂 | Sartorius | 4722 |
| 共聚焦 | 多聚赖氨酸 | Beyotime | Y286384 |
| LysoTracker Green溶酶体探针 | Beyotime | C1047S | |
| Hoechst 33342染料 | Beyotime | C1025 | |
| Zeiss LSM880共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| ELISA | HRP标记的山羊抗人IgG (H+L)二抗 | Thermo | 31130 |
| TMB底物 | CWBIO | CW0050 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo | 89901 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo | 78429 | |
| PVDF膜 | Merck | IPVH00010 | |
| 兔抗人重链抗体 | Abcam | ab109489 | |
| Chemiscope 6000化学发光成像系统 | CLiNX | -- | |
| IGF1R敲除 | IGF1R/IGF2R敲除慢病毒载体 | genechem | -- |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 流式分析 | PE标记的抗人IGF1R抗体 | Biolegend | 351805 |
| FITC标记的抗人IGF2R抗体 | Biolegend | 364207 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 融合抗体表达 | CHO-S细胞培养条件:ExpiCHO表达培养基,37°C,8% CO2 阅读提示:材料与方法:蛋白制备 |
| SPR结合分析 | Biacore T200,蛋白A芯片;固定抗体浓度1 µg/ml或IGF2 1 µg/ml;分析物浓度范围包括IGF2R域6.25-200 nM、MARV GP 0.195-12.5 nM;结合120秒,解离280秒;再生使用10 mM甘氨酸-HCl pH 2.0 阅读提示:材料与方法:SPR |
| 假病毒制备 | HEK293T细胞接种于6孔板7×10^5细胞/孔,转染2 µg质粒(0.4 µg GP和1.6 µg HIV载体),转染试剂JetPRIME;48小时后收集上清,3000×g离心10分钟,0.45 μm滤膜过滤 阅读提示:材料与方法:假病毒制备 |
| 中和实验 | HEK293T细胞3×10^4细胞/孔,抗体起始浓度0.3 µM三倍稀释,与细胞预孵育2小时,假病毒加入后共孵育36小时,荧光素酶检测 阅读提示:材料与方法:假病毒进入和抗体中和试验 |
| 细胞附着 | 抗体浓度0.03、0.06、0.12 µM,4°C孵育30分钟,PE标记二抗检测 阅读提示:材料与方法:抗体附着实验 |
| 内化实验 | HEK293T细胞1×10^5/孔,5 µg/ml内化试剂与100 μl抗体混合,37°C孵育1-48小时,流式检测 阅读提示:材料与方法:抗体内化评估 |
| 溶酶体定位 | HEK293T细胞1×10^5/培养皿培养过夜,内化试剂0.3 µM和抗体0.06 µM混合孵育6小时,LysoTracker Green 50 nM孵育1小时,Hoechst 33342 1 µg/ml孵育20分钟,共聚焦成像 阅读提示:材料与方法:抗体溶酶体定位实验 |
| IGF1R敲除 | HEK293T细胞感染IGF1R敲除慢病毒MOI=10,添加polybrene,16-24小时后换液,继续培养48小时加嘌呤霉素2 µg/ml,7-10天后验证敲除 阅读提示:材料与方法:IGF1R敲除 |