PD-1偶联微球的制备与表征
建立用于检测PD-1/PD-L1相互作用的微球平台
将重组人PD-1蛋白通过化学偶联至功能微球,使用不同蛋白输入量(22.5, 45, 90 µg)优化偶联效率,并通过流式细胞术确认偶联成功。
A Bead-Based Screening Platform for Identifying Monoclonal Antibodies That Disrupt PD-1/PD-L1 Interactions.
包含体外微球检测、细胞共培养功能验证,以及多种抗体验证,涉及多个证据层级。
PD-1偶联聚苯乙烯微球 Expi293F稳转PD-L1细胞系 人原代CD3+ T细胞
PD-L1 AF488浓度为12.5 µg/mL 抗PD-L1抗体浓度范围0.1-15 µg/mL 共培养比例为2:1 (Expi PD-L1+ : CD3+ T细胞) 共培养时间为18小时 抗PD-L1抗体浓度为3 µg/mL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立用于检测PD-1/PD-L1相互作用的微球平台
将重组人PD-1蛋白通过化学偶联至功能微球,使用不同蛋白输入量(22.5, 45, 90 µg)优化偶联效率,并通过流式细胞术确认偶联成功。
制备荧光标记的PD-L1蛋白以检测其与PD-1微球的结合
将人PD-L1蛋白与Alexa Fluor 488 (AF488)偶联,使用商业试剂盒进行标记,并纯化标记蛋白。
验证PD-L1 AF488与PD-1微球的结合能力及特异性
将不同浓度的PD-L1 AF488与PD-1微球孵育,结合曲线显示剂量依赖性结合。通过使用未偶联微球和自竞争实验验证特异性。
建立检测抗体阻断PD-1/PD-L1相互作用的实验流程
将PD-L1 AF488与不同浓度的阻断抗体(αPD-L1 mAb、avelumab、非阻断抗体或IgG对照)预孵育,然后与PD-1微球孵育,通过流式细胞术检测结合信号变化。
建立稳定表达人PD-L1的细胞系以用于功能验证
从Expi293F细胞提取RNA,逆转录和PCR扩增PD-L1基因,克隆至pCI-neo载体,转染Expi293F细胞,并通过G418筛选稳定表达。
验证微球检测中观察到的阻断活性是否转化为功能性T细胞活化恢复
将PD-L1+ Expi293F细胞与人类CD3+ T细胞共培养,加入抗PD-L1抗体或IgG对照,检测T细胞活化标志物CD69、IFN-γ和Ki-67的表达。
评估方法的批内和批间精密度
在单次运行中对每个浓度点进行六次重复测量以评估批内精密度;在不同日期由两名分析人员进行三次独立实验评估批间精密度。计算%RSD和IC50。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| PD-1偶联微球制备 | BD细胞计数微球阵列功能微球偶联缓冲液套装 | BD | 558556 |
| 功能微球A4 | BD | 558578 | |
| 二硫苏糖醇 | Thermo Fisher Scientific | 20290 | |
| 硫基-SMCC | Thermo Fisher Scientific | M6035-10MG | |
| 离心柱 | Global Life Sciences | 28918004 | |
| N-乙基马来酰亚胺 | Thermo Fisher Scientific | 23030 | |
| PD-L1蛋白标记 | NanoDrop Lite分光光度计 | Thermo Fisher | -- |
| 流式细胞术分析 | BD FACSCanto II流式细胞仪 | BD | -- |
| FlowJo 10.7.1软件 | -- | -- | |
| PD-L1过表达细胞构建 | TRI试剂 | Sigma-Aldrich | T9424 |
| GoScript逆转录系统 | Promega | A5000 | |
| Q5高保真DNA聚合酶 | New England Biolabs | M0491 | |
| pCI-neo质粒 | Promega | E1841 | |
| NEBuilder Hifi DNA组装试剂盒 | New England Biolabs | E2621X | |
| 质粒小提试剂盒 | Zymo Research | D4209 | |
| 质粒中提试剂盒 | Zymo Research | D4201 | |
| Expi293F细胞 | Invitrogen | A14527 | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000008 | |
| Opti-MEM减血清培养基 | Thermo Fisher Scientific | 31985062 | |
| G418抗生素 | Gibco | 11811031 | |
| 共培养实验 | RPMI-1640培养基 | Sigma-Aldrich | R6504 |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 12657029 | |
| 抗人CD3抗体(克隆UCHT1) | -- | 555329 | |
| 抗人CD28抗体(克隆CD28.2) | BD | 555725 | |
| 流式细胞术分析 | BD Horizon可固定活性染料510 | BD | 564406 |
| 人Fc阻断剂(克隆Fc1) | BD | 564219 | |
| PE-Cy7小鼠抗人CD274(克隆MIH1) | BD | 558017 | |
| PE-Cy7同型对照(克隆MOPC-21) | BD | 557872 | |
| PBMC分离和CD3+细胞分选 | Ficoll-Paque PLUS密度梯度分离液 | Cytiva | 17144002 |
| BD FACSMelody细胞分选仪 | BD | -- | |
| 免疫表型和胞内染色 | 胞内染色试剂盒 | Invitrogen | 00-5523-00 |
| 抗人IFN-γ抗体(克隆4S.B3) | BD | 563416 | |
| 抗人Ki-67抗体(克隆B56) | BD | 567719 | |
| 流式细胞术分析 | BD FACSymphony A5流式细胞仪 | BD | -- |
| 蛋白定量 | Qubit蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | Q33211 |
| Qubit 4荧光计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式细胞术分析 | 抗PD-1 BV421抗体(克隆MIH4) | BD | 564323 |
| APC-H7小鼠抗人CD3(克隆SK7) | BD | 641415 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PD-1偶联微球制备 | PD-1蛋白输入量、偶联缓冲液、偶联时间、偶联温度、微球类型、偶联后储存条件 阅读提示:Methods 2.1节 |
| PD-L1蛋白标记 | 标记试剂盒、PD-L1浓度、标记时间、标记温度 阅读提示:Methods 2.3节 |
| 流式细胞术阻断实验 | PD-L1 AF488浓度、抗体浓度范围、预孵育时间、孵育时间、温度、微球数量、洗涤条件 阅读提示:Methods 2.5节 |
| 构建PD-L1过表达细胞系 | 细胞系、转染试剂、筛选抗生素浓度、筛选时间 阅读提示:Methods 2.6和2.7节 |
| T细胞共培养功能验证 | 共培养比例、共培养时间、CO2浓度、抗体浓度、抗CD3/抗CD28用量 阅读提示:Methods 2.9节 |