分布式无细胞蛋白生物制造的国际多站点实施以推进健康与研究公平

International multisite implementation of distributed cell-free protein biomanufacturing to advance health and research equity.

作者信息Severino Jefferson Ribeiro da Silva, Quinn Matthews, Séverine Cazaux, Justin R J Vigar, Bárbara N R Santos, Deyse C M Carvalho, Lauren A Cranmer, David Duplat, Serena Singh, Mohammad Simchi, Paula Benítez-Bolivar, Thaíse Yasmine Vasconcelos de Lima Cavalcanti, Kaiyue Wu, Renata P G Mendes, Tanvi Kale, Ana L L Divarzak, Kristof Bozovicar, Jennifer Doucet, Anibal Arce, Cielo Léon, Valentina Ferrando, Jessica Nguyen, Anson Ho, Suelen C de Lima, Pouriya Bayat, Yuxiu Guo, Seray Cicek, Aidan Tinafar, Larissa Krokovsky, Laís C Machado, Ashyad Rayhan, Idorenyin A Iwe, Alexander Klenov, Thiago P G de Araujo, Jean P M Nascimento, Jurandy J F Magalhães, Marcela Guevara-Suarez, Patricia Garcia Canete, Kodjo Ayi, Moiz Charania, Tara E Stehelin, Kate Chatfield-Reed, Marcelo H S Paiva, Ian Crandall, Tony Mazzulli, Gabriel da Luz Wallau, Abelardo Silva-Júnior, Adriana Bernal, Chaitanya A Athale, Alexander A Green, Scott C Weaver, Camila González, Fernán Federici, Lindomar Pena, Keith Pardee
PMID42213847
期刊Sci Adv
发布时间2026-05-29
DOI10.1126/sciadv.aeb7039

实验完整度

包含多层次的实验证据:体外无细胞蛋白合成及功能验证、细胞增殖实验、小鼠免疫实验、多中心患者样本试验以及实地部署测试,覆盖从分子到临床的多个层面。

主要模型

无细胞蛋白质合成反应体系 BALB/c小鼠模型 患者临床样本 NIH-3T3和TF-1细胞系

重点核对

FD-CFPS反应在环境温度下储存至少2周活性无明显损失 不同离心机(台式、电池供电、3D打印手动)纯化蛋白质产量和纯度相当 生长因子FGF-1和IL-3的细胞增殖活性与商业产品相当 Nuvax疫苗在小鼠中诱导强IgG抗体反应 本地生产的RT-LAMP试剂对SARS-CoV-2、CHIKV和OROV的临床诊断准确率达90-100%

摘要

全球范围内研究和医疗保健能力获取的限制损害了公平性、可持续性和韧性,尤其是在资源有限的环境中。分子诊断和生物治疗有望彻底改变医学;然而,我们对集中式生物制造和冷链物流的依赖限制了对这些益处的获取。这些限制反映了一个长期存在的、尚未解决的全球性挑战。在此,我们与北美、南美和亚洲的研究团队合作,挑战自上而下的范式,推进社区驱动的解决方案,增强服务不足人群参与生物经济的能力,使他们能够按需、按时、按地生产所需产品。我们的方法利用低负担生物制造——基于无细胞蛋白质合成和开源硬件——实现高价值生物制品(包括生长因子、疫苗和诊断酶)的本地按需生产,展示出与商业金标准相当的性能。该平台在全球10个地点实施,支持针对全球相关病原体的患者试验。总之,这些努力为全球包容性生物制造生态系统奠定了基础,其中创新超越地理边界。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何通过分布式无细胞生物制造,在资源有限的环境中实现高价值生物制品的本地、按需生产,以提升全球健康与研究的公平性和可及性?
核心机制
基于冻干无细胞蛋白质合成(FD-CFPS)和开源硬件,实现生物制品的现场生产,无需冷链物流和集中式基础设施,从而降低成本、缩短获取时间。
主要证据
通过多中心实验(包括11种生长因子表达、Nuvax疫苗小鼠免疫、16种病原体诊断试验及116例患者样本验证)证明该平台产出的生物制品在性能和功效上与商业金标准相当。
研究意义
为全球包容性生物制造生态系统奠定基础,推动生物技术的公平获取,增强本地科研和医疗响应能力。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

技术转移与标准化验证

验证FD-CFPS系统在不同地理位置和实验室条件下的稳定性、可转移性和可重复性。

将FD-CFPS反应在不同地点间常温运输,使用sfGFP作为模型蛋白,通过FITC标准化曲线比较荧光表达,评估跨实验室的可重复性。

2

便携式纯化设备评估

比较不同离心策略对His6-tagged deGFP纯化效果的影响,评估低成本便携式设备的可行性。

使用His6-tagged deGFP作为模型蛋白,用三种离心装置(传统台式离心机、电池供电离心机、3D打印手动离心机)进行Ni-NTA亲和纯化,比较产量和纯度。

3

生长因子的本地生产与功能验证

证明CFPS可以生产具有生物活性的生长因子,并验证其性能与商业产品相当。

设计并表达11种生长因子,选择FGF-1、IL-3、IL-15进行细胞增殖实验,并评估其成本。

4

疫苗抗原的生产与免疫原性评估

评估CFPS生产的SARS-CoV-2核衣壳蛋白疫苗候选物(Nuvax)在小鼠中的免疫原性。

使用ClearColi BL21(DE3) lysates表达核衣壳蛋白,纯化后与佐剂混合,免疫BALB/c小鼠,检测特异性IgG抗体。

5

诊断传感器的开发与验证

开发并验证基于toehold switch的SARS-CoV-2诊断传感器,并优化其性能。

设计142个toehold switch传感器,筛选出最佳传感器D07;使用RT-LAMP预扩增,在PURExpress中评估诊断性能。

6

现场诊断酶的生产与LAMP检测建立

建立本地生产LAMP酶(Bst LF和M-MLV RT)的流程,并开发针对16种病原体的检测方法。

使用CFPS生产Bst LF和M-MLV RT,优化LAMP/RT-LAMP反应条件,在多个现场进行性能评估。

7

多中心患者样本验证

验证本地生产的诊断试剂在真实临床样本中的诊断准确性,与金标准RT-qPCR比较。

收集加拿大、智利、哥伦比亚、巴西的患者样本,使用本地生产的RT-LAMP试剂进行双盲试验。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
PURExpressNEBE6800L
NEBExpress无细胞大肠杆菌蛋白质合成系统NEBE5360S
S30 T7提取物试剂盒PromegaL1130
JuiceLiberumCF0001.B
NEBExpress Ni离心柱NEBS1427L
Strep-TactinXT 4高容量树脂IBA2-5010-010
Pierce BCA蛋白检测试剂盒Thermo Fisher Scientific23225
杜氏改良Eagle培养基Gibco--
最低必需培养基Gibco--
RPMI 1640培养基Gibco--
ImmunoCult-XF T细胞扩增培养基STEMCELL Technologies--
CellTiter-Glo 2.0细胞活力检测试剂盒Promega9242
重组人FGF1Sino Biological10013-HNAE
重组IL-3PeproTech200-03
重组人IL-15Sino Biological10360-HNAE
Alhydrogel 2%InvivoGenvac-alu-50
CpG-ODN 2395InvivoGenvac-2395-1
SARS-CoV-2核衣壳蛋白IgG抗体ELISA试剂盒ABclonalRK04178
抗His-HRP抗体Southern Biotech4603-05
抗SARS-CoV-2核衣壳一抗Sino Biological40588-T62
抗兔IgG(HRP)二抗Abcamab6721
SARS-CoV-2核衣壳重组蛋白Sino Biological40588-V07E
Clarity Western ECL底物Bio-Rad1705061
Mini-Protean TGX预制蛋白胶Bio-Rad4561093和4561096
Pierce高容量内毒素去除离心柱试剂盒Thermo Fisher Scientific88274
Pierce显色内毒素定量试剂盒Thermo Fisher ScientificA39552
QIAamp DNA微型试剂盒QIAGEN51304
QIAamp病毒RNA微型试剂盒QIAGEN52906
QIAquick PCR纯化试剂盒QIAGEN28106
EZNA质粒中量提取试剂盒Omega Bio-TekD6904
Q5高保真DNA聚合酶NEBM0491L
HiScribe T7快速高产RNA合成试剂盒NEBE2050S
脱氧核糖核酸酶INEBM0303A
RNeasy MinElute纯化试剂盒QIAGEN74204
WarmStart LAMP 2×预混液NEBE1700S
QuantiNova SYBR Green PCR预混液QIAGEN208052
QuantiNova探针RT-PCR试剂盒QIAGEN208354
QuantStudio 3或5实时荧光定量PCR仪Applied Biosystems--
FluoroPLUMLSK Technologies (now part of Nicoya)--
SpiniOne 2020便携式离心机----
3D打印手动离心机----
LB培养基----
NEB 5-alpha感受态大肠杆菌NEBC2987I
Schneider培养基SERVA4752
CpG-ODN 2395InvivoGenvac-2395-1
GamS核酸酶抑制剂NEBP0774S
PURExpress二硫键增强剂NEBE6820S
彩色预染蛋白质标准,宽范围(10-250 kDa)NEBP7719
大肠杆菌BL21(DE3)NEBC2527I
大肠杆菌SHuffleNEBC3028J
ClearColi BL21(DE3)Biosearch Technologies60810-1
BL21(DE3)-Gold-∆LacAddgene99247
Vero CCL-81细胞ATCCCCL-81
NIH-3T3细胞ATCCCRL-1658
Vero E6细胞ATCCCRL-1586
TF-1细胞ATCCCRL-2003
ImmunoCult人CD3+ T细胞STEMCELL Technologies--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
FD-CFPS反应
冻干无细胞裂解物的制备批次、储存温度和时间、运输条件
阅读提示:Materials and Methods中的“Freeze-drying of molecular components”和“CFPS reaction setup”
生长因子表达与纯化
DNA模板序列、His6标签位置、表达温度和时间、离心方式
阅读提示:Results中的“Local production yields growth factors with commercial-grade bioactivity”及Figure 3 legend
Nuvax疫苗免疫
疫苗剂量(1 μg/只)、佐剂比例(1:50:500)、免疫时间点(第0天和第15天)、采血时间点
阅读提示:Results中的“Cell-free produced Nuvax elicits a robust immunoglobulin G–specific immune response in mice”及Figure 4 legend
LAMP/RT-LAMP检测
引物浓度、MgSO4浓度、dNTP浓度、酶浓度、反应温度和时间、检测方法
阅读提示:Materials and Methods中的“LAMP and RT-LAMP reaction setup”
患者样本验证
样本收集类型(鼻咽拭子、血清)、RNA提取方法、金标准RT-qPCR方法
阅读提示:Results部分“Multicenter and international patient trial assessment of locally manufactured diagnostic reagents”及Figure 7 legend