抗体发现与筛选
通过免疫小鼠和噬菌体展示技术生成结合PlGF-2或VEGFA165的抗体,并筛选出具有不同结合特性的克隆。
用重组人PlGF-2免疫BALB/c小鼠,构建scFv噬菌体文库,通过不同淘选策略(针对PlGF-2、跨物种、交替)筛选,经单克隆噬菌体ELISA鉴定出9个独特scFv克隆(C1-C9),并转化为嵌合人IgG1/κ抗体。
Antibodies blocking PlGF or VEGF interactions with the NRP1 receptor mediate antiproliferative effects.
包含抗体发现(噬菌体展示)、生化结合与阻断分析(ELISA、BLI)、体外功能验证(HUVEC管形成、Caki-I增殖与迁移)及机制探讨(表位分箱、竞争实验),多层次验证。
HUVEC(人脐静脉内皮细胞) Caki-I肾透明细胞癌细胞系 BALB/c小鼠免疫模型
抗体阻断NRP1或VEGFR1结合的能力需通过竞争ELISA和BLI实验验证 HUVEC管形成实验中Matrigel批号与浓度、细胞代数(<16)及抗体浓度范围(0.01-10 μg/ml)需核对 Caki-I增殖实验中血清饥饿时间(24h)、抗体与生长因子预孵育浓度(2.5或5 μg/ml抗体;12.5或50 ng/ml生长因子)及检测时间(72h)需核对 细胞迁移实验中HUVEC条件培养基制备、抗体浓度(10 μg/ml)及孵育时间(16h)需核对
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过免疫小鼠和噬菌体展示技术生成结合PlGF-2或VEGFA165的抗体,并筛选出具有不同结合特性的克隆。
用重组人PlGF-2免疫BALB/c小鼠,构建scFv噬菌体文库,通过不同淘选策略(针对PlGF-2、跨物种、交替)筛选,经单克隆噬菌体ELISA鉴定出9个独特scFv克隆(C1-C9),并转化为嵌合人IgG1/κ抗体。
评估抗体与不同生长因子亚型的结合能力,以及阻断NRP1和VEGFR1受体结合的效果,并确定表位竞争关系。
通过ELISA检测抗体与PlGF-2、PlGF-1、mPlGF-2、VEGFA165、VEGFA121的结合;通过竞争ELISA检测抗体对NRP1和VEGFR1结合的抑制;通过BLI进行表位分箱和亲和力测量。
评估抗VEGF抗体对VEGF介导的血管生成的抑制作用,并比较不同NRP1阻断抗体的效果。
在Matrigel上培养HUVEC,加入抗体(10-0.01 μg/ml)或对照,16-18小时后成像,分析网状结构和分支间隔。
评估抗PlGF和抗VEGF抗体对生长因子刺激的肾癌细胞增殖的影响,以确定NRP1在肿瘤细胞生长中的作用。
Caki-I细胞血清饥饿24小时后,用抗体与生长因子(PlGF-2或VEGFA165)预孵育后刺激72小时,加入刃天青孵育48小时,测量荧光。
验证NRP1阻断抗体对肾癌细胞迁移的影响,评估其在肿瘤转移中的潜在作用。
使用Transwell小室,下室为HUVEC条件培养基,上室接种Caki-I细胞,加入抗体(10 μg/ml),16小时后染色、成像和计数。
确认HUVEC条件培养基中存在PlGF和VEGF,支持迁移实验的合理性。
收集HUVEC条件培养基,用C5和C7抗体免疫沉淀,通过SDS-PAGE和Western blot检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物免疫 | 重组人PlGF-2 | R&D Systems | -- |
| 弗氏完全佐剂 | Sigma Aldrich | -- | |
| 弗氏不完全佐剂 | Sigma Aldrich | -- | |
| 文库构建 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| PureLink RNA提取试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| SuperScript IV逆转录酶试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 噬菌体展示 | M13K07辅助噬菌体 | New England Biolabs | -- |
| 抗myc标签抗体 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 蛋白表达与纯化 | ExpiCHO表达系统 | ThermoFisher Scientific | -- |
| ExpiHEK表达系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| Freestyle 293F细胞 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 蛋白纯化 | ÄKTA Pure FPLC系统 | Cytiva | -- |
| HiTrap Protein A HP层析柱 | Cytiva | -- | |
| CaptureSelect CH1-XL亲和基质 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| Strep-Tactin XT树脂 | IBA Lifesciences | -- | |
| ELISA | TMB底物 | ThermoFisher Scientific | -- |
| SpectraMax M5酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| EZ-Link Sulfo-NHS-生物素化试剂盒 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 竞争ELISA | 肝素 | Fisher | BP252410 |
| BLI | Forte Bio Octet系统 | Sartorius | -- |
| 细胞培养 | HUVEC-GFP细胞 | Angio Proteomie | -- |
| EGM-2完全培养基 | Lonza | -- | |
| RPMI 1640培养基 | Corning | -- | |
| DMEM培养基 | Corning | -- | |
| 管形成实验 | 基质胶(生长因子减少型) | Corning | -- |
| Ibidi 96孔μ板 | Ibidi | -- | |
| EVOS细胞成像系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 流式细胞术 | 抗VEGFR1抗体 | Invitrogen | RRID:AB_2609308 |
| 抗VEGFR2抗体 | R&D Systems | RRID:AB_2132190 | |
| 抗NRP1抗体 | Sino Biological | Cat # 1011-MM01 | |
| LSRFortessa SORP流式细胞仪 | BD | -- | |
| Attune NxT流式细胞仪 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 增殖实验 | 刃天青 | R&D Systems | -- |
| 免疫沉淀 | Pierce Protein A/G磁珠 | ThermoFisher Scientific | -- |
| DynaMag-2磁力架 | Invitrogen | -- | |
| Mini-Protean TGX预制胶 | BioRad | -- | |
| 迁移实验 | Transwell小室(8 μm孔径) | Falcon | -- |
| EVOS M7000细胞成像系统 | ThermoFisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 抗体发现与筛选 | 免疫所用PlGF-2来源、小鼠品系、免疫剂量、佐剂类型、噬菌体文库构建方法、淘选策略及抗体表达系统 阅读提示:Experimental procedures部分:Mouse immunization、Library generation、Phage display、Protein expression constructs |
| 生化结合与阻断分析 | ELISA包被抗原浓度、竞争ELISA中生物素化受体浓度、肝素浓度、BLI中抗体和生长因子浓度 阅读提示:Experimental procedures部分:ELISA to assess antibody binding, Competition ELISAs, Antibody binding kinetics & epitope binning |
| HUVEC管形成实验 | HUVEC代数(<16)、Matrigel用量、细胞接种数、抗体浓度范围、孵育时间 阅读提示:Experimental procedures部分:HUVEC tube formation assay |
| Caki-I增殖实验 | 血清饥饿时间(24h)、细胞接种数、抗体与生长因子预孵育条件、刺激时间(72h)、刃天青孵育时间(48h) 阅读提示:Experimental procedures部分:Cell proliferation assay |
| Caki-I迁移实验 | HUVEC条件培养基制备、Transwell孔径、细胞接种数、抗体浓度(10 μg/ml)、孵育时间(16h) 阅读提示:Experimental procedures部分:Cell migration assay |