验证Sp100A对多种DNA病毒的抑制作用
评估Sp100A及其S188突变体对HSV-2、VZV和腺病毒的抗病毒活性。
在HEp-2或Sp100−/−细胞中过表达GFP、Flag-Sp100A、Flag-Sp100A-188A、Flag-Sp100A-188D,感染HSV-2、VZV或腺病毒,通过空斑实验、qRT-PCR和流式细胞术检测病毒滴度和基因表达。
Nuclear translocation of Sp100A suppresses multiple DNA viruses and limits HSV-1 lytic replication in vivo.
包括体外细胞实验(HEp-2、Sp100−/−细胞)、临床HSV-2分离株、VZV、腺病毒,以及小鼠体内模型,明确功能验证和机制验证(S188磷酸化突变)。
HEp-2细胞 Sp100−/−细胞 BALB/c小鼠眼内感染模型
Sp100A的S188位点磷酸化状态(S188A或S188D突变) 病毒感染多重性(MOI 0.01或5) 细胞外囊泡(EVs)的分离和人工囊泡的制备 小鼠品系及感染剂量(1×10^5 PFU/眼) 潜伏建立及再激活的评估方法(explant reactivation)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Sp100A及其S188突变体对HSV-2、VZV和腺病毒的抗病毒活性。
在HEp-2或Sp100−/−细胞中过表达GFP、Flag-Sp100A、Flag-Sp100A-188A、Flag-Sp100A-188D,感染HSV-2、VZV或腺病毒,通过空斑实验、qRT-PCR和流式细胞术检测病毒滴度和基因表达。
探究Sp100A是否通过EVs介导细胞间抗病毒保护,以及该过程是否依赖S188磷酸化。
从转染Sp100A或其突变体的HEp-2细胞中分离EVs和人工囊泡,将其与Sp100−/−细胞共孵育,然后感染HSV-1或VSV-GFP,检测病毒滴度和基因组水平。
评估表达Sp100A及其S188突变体的重组HSV-1在细胞中的复制能力。
利用BAC系统构建表达Sp100A、Sp100A-S188A或Sp100A-S188D的重组HSV-1,在HEp-2和Vero细胞中检测单步和多步生长曲线及空斑大小。
评估Sp100A及其突变体在小鼠体内对HSV-1致病性的影响。
BALB/c小鼠眼睛感染重组HSV-1病毒(1 × 10^5 PFU/眼),监测生存率、体重变化、临床体征、泪液分泌及神经节病毒载量。
确定Sp100A是否影响HSV-1潜伏期的建立和再激活。
感染后14天和28天分别检测神经节病毒基因组水平;分离神经节进行外植体再激活实验,使用抗NGF刺激后检测病毒DNA和ICP27转录水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | 10-013-CVRC |
| 胎牛血清 | Gibco | 10270-106 | |
| 转染 | JetPRIME转染试剂 | Polyplus | 114-15 |
| 蛋白质检测 | 抗Flag抗体 | Proteintech | 80010 |
| 抗Sp100抗体 | GeneTex | GTX131569 | |
| 抗β-actin抗体 | Sino Biological | 1000166 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abways Technology | AB0037 | |
| 抗Histone H3抗体 | Sino Biological | 100005-MM01 | |
| 抗TSG101抗体 | Proteintech | 28283-1-AP | |
| 抗calnexin抗体 | Santa Cruz | sc23954 | |
| 抗ICP0抗体 | Santa Cruz | sc53070 | |
| 抗ICP8抗体 | Abcam | ab20194 | |
| 抗TK抗体 | GenicBio Limited | -- | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 594标记的山羊抗兔IgG(H+L) | Invitrogen | 2165334 |
| Western blot | 山羊抗小鼠IgG-HRP | Invitrogen | 31430 |
| 山羊抗兔IgG(H+L)-HRP | Invitrogen | 32460 | |
| 蛋白质提取 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | EO0492 |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | GLPBIO | GK10009 |
| Western blot | 增强化学发光试剂 | Thermo Fisher Scientific | 34580 |
| 细胞外囊泡分离 | 外泌体沉淀试剂盒 | System Biosciences | EXOTC10A-1 |
| 纳米颗粒分析 | NanoSight NS300 | Malvern | -- |
| 透射电子显微镜 | JEM-1400透射电子显微镜 | JEOL LTD | -- |
| DNA/RNA提取 | Omega DNA/RNA提取试剂盒 | -- | R6731-01 |
| qRT-PCR | SYBR green检测系统 | Accurate Biology | AG11701 |
| StepOnePlus | Thermo Fisher | -- | |
| 泪液分泌检测 | 酚红棉线 | Jingmin | PC3017 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与病毒感染 | 细胞系(HEp-2、Sp100−/−等)、培养基(DMEM+10% FBS)、感染MOI、感染时间、培养时间 阅读提示:Methods: Cell lines and viruses; Virus infections |
| 质粒转染与蛋白表达 | 转染试剂(JetPRIME)、质粒浓度、转染时间、检测方法(Western blot) 阅读提示:Methods: Plasmids and transient transfection; Western blotting |
| 细胞外囊泡(EVs)分离与人工囊泡制备 | 细胞数量、转染时间、离心步骤、外泌体沉淀试剂盒、人工囊泡制备的过滤步骤 阅读提示:Methods: Collection of EVs and preparation of artificial vesicles |
| 小鼠感染实验 | 小鼠品系(BALB/c雌性)、年龄(6周)、感染剂量(1×10^5 PFU/眼)、感染途径(眼部)、监测指标(体重、泪液) 阅读提示:Methods: Animal experiments; Phenol red thread test |
| 潜伏建立与再激活实验 | 感染后时间点(14 dpi、28 dpi或30 dpi)、神经节外植体培养条件(199V培养基、抗NGF 2 μg/mL、24小时)、基因检测(ICP27、Adipsin、Map2) 阅读提示:Methods: DNA/RNA extraction, qRT-PCR; Figure 5 legend |