设计并合成ExcB衍生物
通过后期多样化修饰优化ExcB的STING抑制活性和溶解性。
对ExcB进行多种化学修饰,包括C12酯化、C16烯丙基氧化、环氧内酯开环等,合成一系列GHN系列类似物。
Orally Bioavailable and Site-Selective Covalent STING Inhibitor Derived from a Macrocyclic Marine Diterpenoid.
包含体外细胞实验、体内动物模型(急性结肠炎模型)以及体内靶点参与验证,并进行了机制验证(Cys91突变和荧光标记)和功能验证(信号通路抑制)。
THP-1人巨噬细胞 THP1-Dual KI hSTING报告细胞 小鼠急性结肠炎模型(DSS诱导) HEK293T细胞(STING过表达)
STING Cys91突变体(Cys91Ser)用于验证结合位点 GHN105口服给药剂量100 mg/kg用于体内实验 DSS诱导急性结肠炎模型中的延迟治疗方案 THP1-Dual KI hSTING细胞中的cGAMP刺激浓度(30 μg/mL) GHN105浓度(2 μM)用于细胞标记实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过后期多样化修饰优化ExcB的STING抑制活性和溶解性。
对ExcB进行多种化学修饰,包括C12酯化、C16烯丙基氧化、环氧内酯开环等,合成一系列GHN系列类似物。
筛选抑制STING介导的IFN-β分泌的活性化合物。
在THP-1巨噬细胞中,以10 μM化合物预处理1小时,然后加入cGAMP刺激,检测IFN-β分泌水平。
确定GHN105是否共价结合STING,并鉴定结合位点。
在过表达STING的HEK293T细胞中用GHN105标记,然后通过点击化学(CuAAC)与Cy5偶联,用凝胶内荧光检测结合。并通过Cys91突变体验证特异性。
检测GHN105是否抑制STING下游信号分子的磷酸化。
在NIH3T3细胞中用GHN105预处理,然后用dsDNA刺激,通过Western blot检测STING、TBK1和IRF3的磷酸化水平。
评估GHN105的口服生物利用度和安全性。
对小鼠静脉注射(2 mg/kg)、口服(10 mg/kg)和腹腔注射(15 mg/kg)GHN105,测定血浆药物浓度,计算药代参数;并连续5天口服100 mg/kg评估毒性。
评估口服GHN105对DSS诱导的急性结肠炎的治疗效果。
C57BL/6J小鼠先给予3% DSS 8天,然后口服GHN105(100 mg/kg)或对照6天,继续DSS处理,在第14天处死,检测体重、结肠长度、组织学变化和血浆TNF-α水平。
验证口服GHN105是否在体内(结肠)与STING共价结合。
从结肠组织中提取蛋白,与azide-biotin反应,通过链霉亲和素富集,Western blot检测STING。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| RPMI 1640培养基 | HyClone | -- | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞分化 | 佛波酯 | Sigma | -- |
| 细胞培养(选择压力) | 杀稻瘟菌素 | Invivogen | -- |
| 博来霉素 | Invivogen | -- | |
| 诺莫霉素 | Invivogen | -- | |
| 细胞培养 | IMDM培养基 | HyClone | -- |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | PeproTech | -- | |
| 细胞培养支原体检测 | MycoAlert PLUS支原体检测试剂盒 | Lonza | LT07-318 |
| 细胞刺激 | 2'3'-cGAMP | MedChemExpress | HY-100564A |
| 报告基因检测 | QUANTI-Luc试剂 | Invivogen | rep-qlc4lg1 |
| Envision酶标仪 | Promega | GM3000 | |
| ELISA | 人IFN-β DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY814 |
| 小鼠IFN-β ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY8234 | |
| 小鼠CXCL10 ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY466 | |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY406 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Invitrogen | 88-7324-88 | |
| 细胞活力检测 | alamarBlue检测试剂盒 | Invitrogen | DAL1025 |
| GloMax Discover酶标仪 | Promega | -- | |
| 转染 | TransIT-LT1转染试剂 | Mirus Bio | MIR2300 |
| 蛋白裂解 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Selleckchem | B14001 |
| SuperNuclease核酸酶 | Sino Biological | SSNP01 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | 23225 |
| 点击化学 | 叠氮-Cy5 | -- | -- |
| 硫酸铜 | -- | -- | |
| 三(2-羧乙基)膦盐酸盐 | -- | -- | |
| 三[(1-苄基-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基]胺 | -- | -- | |
| SDS-PAGE | 4× SDS上样缓冲液 | -- | -- |
| Bond-Breaker TCEP | Thermo Scientific | 77720 | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | 12003154 | |
| 考马斯亮蓝染色液 | BIO-HELIX | PS002-B500 | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPVH85R |
| 化学发光底物 | Thermo Scientific | 34580 | |
| 抗磷酸化STING抗体 | Cell Signaling Technology | 72971 | |
| 抗STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 | |
| 抗磷酸化TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 5483 | |
| 抗TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3504 | |
| 抗磷酸化IRF3 (S396)抗体 | Cell Signaling Technology | 29047 | |
| 抗IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 4302 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2144 | |
| 抗兔HRP二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 111-035-003 | |
| 病毒实验 | 单纯疱疹病毒1型 | National Infectious Diseases Bank, Taiwan | VI00053 |
| 动物实验(给药制剂) | 二甲基乙酰胺 | -- | -- |
| 聚氧乙烯蓖麻油 | -- | -- | |
| 聚氧乙烯蓖麻油 | -- | -- | |
| 动物实验(结肠炎诱导) | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | 160110 |
| 免疫组化 | 抗MPO抗体 | Proteintech | 22225-1-AP |
| HRP标记山羊抗兔抗体 | Abcam | ab205722 | |
| DAB底物 | Abcam | 64238 | |
| Surgipath Micromount封片剂 | Leica | 3801731 | |
| 组织学成像 | Axio Imager A2显微镜 | Zeiss | -- |
| 组织裂解 | 超声破碎仪Q700 | Qsonica | Q700 |
| 点击化学(体内) | 叠氮-生物素 | Vector Laboratories | CCT-1041 |
| 亲和纯化 | 链霉亲和素磁珠 | Thermo Scientific | 20353 |
| 化学合成 | 氯铬酸吡啶盐 | -- | -- |
| 1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐 | -- | -- | |
| 4-二甲氨基吡啶 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 化合物合成 | 反应条件(温度、时间、溶剂、试剂用量)以及化合物纯度(≥95%) 阅读提示:Experimental Section: Chemistry |
| 细胞培养 | 细胞系(THP-1, HEK293T, NIH3T3, hMSCs)、培养基配方、血清浓度、抗生素浓度、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Experimental Section: Cell Lines and Cell Culture |
| 细胞活性测定 | THP-1巨噬细胞分化条件(PMA浓度、时间)、化合物预处理浓度和时间、cGAMP刺激浓度和时间、ELISA检测方法 阅读提示:Experimental Section: ELISA Analyses of IFN-β, CXCL10, IL-6 and TNFα Levels |
| 体外靶点验证 | STING表达质粒、转染试剂、GHN105浓度和标记时间、点击化学组分浓度、凝胶内荧光检测条件 阅读提示:Experimental Section: In-Gel Fluorescence Detection of GNH105-Labeled Proteins |
| 信号通路分析 | 细胞系(NIH3T3)、GHN105预处理浓度和时间、dsDNA刺激时间和浓度、Western blot抗体使用 阅读提示:Results: GHN105 Inhibited STING Signaling and Activation in Cells; Experimental Section: Western Blot |
| 药代动力学研究 | 给药途径(i.v., p.o., i.p.)、剂量、取样时间点、分析方法(LC-MS/MS) 阅读提示:Experimental Section: In Vivo Pharmacokinetics Study |
| 毒性研究 | 动物品系(ICR)、给药剂量(100 mg/kg)、给药频率(每日一次,连续5天)、观察指标 阅读提示:Experimental Section: In Vivo Toxicity Study |
| 体内药效模型 | 动物品系(C57BL/6J)、DSS浓度(3%)、给药方案(延迟治疗)、GHN105剂量(100 mg/kg)和给药途径(口服) 阅读提示:Results: GHN105 Engaged STING In Situ and Suppressed Acute Colitis Progression; Experimental Section: Delayed Treatment Acute Colitis Animal Model |
| 体内靶点参与 | 组织处理(研磨、裂解)、蛋白定量、点击化学条件、亲和纯化步骤 阅读提示:Experimental Section: Detection of GHN105-mSTING Engagement in Mouse Colon Tissue |