抗体分离与鉴定
从精英中和者P27的PBMC中分离出具有中和活性的单克隆抗体FD22。
从P27的PBMC中分选记忆B细胞,培养13天后通过微量中和实验筛选出FD22。鉴定其基因来源和突变频率。
A potent and broad CD4 binding site neutralizing antibody with strong ADCC activity from a Chinese HIV-1 elite neutralizer.
包含多层级证据:体外中和实验、细胞系结合与ADCC功能验证、AlphaFold3结构预测、突变验证及自体病毒逆转突变实验。
U87 CD4+CCR5+细胞(中和实验靶细胞) ACH-2细胞(潜伏HIV激活模型) H9 (IIIB)细胞(HIV感染靶细胞) TZM-bl细胞(感染指示细胞)
FD22重链来源于IGHV3-30胚系,SHM 37%,CDRH3长20个氨基酸 中和实验使用145株假病毒,U87 CD4+CCR5+细胞为靶细胞 ADCC实验以H9 (IIIB)为靶细胞,PBMC为效应细胞,E:T=6:1 FcγRIIIa刺激实验使用Jurkat-Lucia NFAT-CD16a报告细胞 AlphaFold3结构预测关键参数:ModelSeeds等
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从精英中和者P27的PBMC中分离出具有中和活性的单克隆抗体FD22。
从P27的PBMC中分选记忆B细胞,培养13天后通过微量中和实验筛选出FD22。鉴定其基因来源和突变频率。
评估FD22与gp120的结合能力、亲和力及表位竞争性。
通过ELISA检测FD22与gp120蛋白的结合,BLI测定亲和力,竞争ELISA分析其与已知CD4bs抗体的竞争关系,并检测自体反应性。
评估FD22对多种HIV-1假病毒的中和广度和效力。
使用145株Env假病毒进行中和实验,计算IC50,并比较FD22与VRC01的中和谱。
评估FD22对激活后潜伏HIV感染靶细胞的抑制作用。
使用ACH-2细胞,以TNF-α或panobinostat激活潜伏HIV,然后加入FD22,检测其对靶细胞感染的抑制。
评估FD22是否通过FcγRIIIa诱导ADCC效应。
使用Jurkat-Lucia NFAT-CD16a报告细胞检测FcγRIIIa刺激,NK细胞脱颗粒实验和LDH释放实验评估ADCC活性。
通过AlphaFold3预测FD22与Env SOSIP复合物结构,并通过突变验证关键残基。
使用AlphaFold3预测FD22 Fab与多种Env SOSIP三聚体的结构,分析相互作用界面;通过定点突变和自体病毒逆转突变验证R102等关键残基的作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Cytiva | -- | |
| Biomyc-3抗支原体试剂 | Biological Industries | -- | |
| SMM 293-TII培养基 | Sino Biological Inc. | -- | |
| 抗体生产 | 白细胞介素-2 | -- | -- |
| 白细胞介素-21 | -- | -- | |
| 3T3-msCD40L饲养细胞 | -- | -- | |
| 假病毒生成 | pNL4-3.Luc.R-E-质粒 | -- | -- |
| EZ Trans转染试剂 | Life-iLab | -- | |
| 中和实验 | 荧光素酶检测系统 | Promega | -- |
| 结合实验 | HRP标记的山羊抗人IgG抗体 | -- | -- |
| ABTS底物 | -- | -- | |
| 竞争ELISA | EZ-Link NHS-LC-生物素 | Thermo Fisher | -- |
| 10kDa离心过滤膜 | Millipore | -- | |
| BLI | Octet RED96系统 | ForteBio | -- |
| 细胞表面结合 | 活/死染料 | Thermo Fisher | -- |
| Alexa Fluor 647偶联的山羊抗人IgG (H+L)抗体 | Thermo Fisher | -- | |
| FcγRIIIa刺激 | Nano-Glo活细胞试剂 | Promega | N2058 |
| NK细胞激活 | NK细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-092-657 |
| 重组人IL-15 | Gibco | PHC9154 | |
| IMEM培养基 | Gibco | 12440053 | |
| 小鼠抗人CD107a-PE | BD Pharmingen | 555801 | |
| 小鼠抗人CD3-PerCP-Cy5.5 | BD Pharmingen | 560835 | |
| 小鼠抗人CD56-PE-Cy™7 | BD Pharmingen | 557747 | |
| 小鼠抗人CD16-FITC | BD Pharmingen | 555406 | |
| 固定/通透化溶液试剂盒 | BD Biosciences | 554714 | |
| 小鼠抗人IFN-γ | BD Pharmingen | 564791 | |
| 小鼠抗人MIP-1β | BD Pharmingen | 560686 | |
| ADCC评估 | CytoTox 96非放射性细胞毒性检测试剂盒 | Promega | G1780 |
| 裂解液 | Promega | G182A | |
| CytoTox 96试剂 | Promega | G179A | |
| 终止液 | Promega | G183A | |
| 自体反应性 | Alexa Fluor 647偶联的山羊抗人IgG (H+L) | Invitrogen | -- |
| 多反应性 | 心磷脂 | -- | -- |
| 单基因组扩增 | Platinum Taq高保真系统 | Invitrogen | -- |
| 基因克隆 | Primestar聚合酶 | TAKARA | -- |
| pcDNA3.1(-)表达载体 | Invitrogen Life Technologies | -- | |
| AXYGEN质粒小提试剂盒 | AXYGEN | -- | |
| 结构分析 | ChimeraX软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 中和实验 | 靶细胞U87 CD4+CCR5+的培养条件,假病毒的构建方法,抗体稀释倍数,孵育时间,检测系统 阅读提示:Materials and methods: Neutralization experiments |
| 潜伏病毒激活抑制实验 | ACH-2细胞的激活条件(TNF-α浓度,panobinostat浓度,处理时间),FD22浓度系列,TZM-bl细胞培养 阅读提示:Materials and methods: Inhibition of reactivated HIV-1 latently infected cells; P24 ELISA |
| FcγRIIIa刺激实验 | 靶细胞类型,抗体浓度,共培养时间,报告细胞系 阅读提示:Materials and methods: FcγRIIIa stimulation assay |
| NK细胞激活实验 | PBMC分离方法,NK细胞纯化试剂盒,IL-15浓度,E:T比例,孵育时间,抗体浓度 阅读提示:Materials and methods: NK cell activation |
| ADCC评估 | 靶细胞H9 (IIIB),效应细胞PBMC,E:T比例,抗体浓度范围,孵育时间,LDH检测试剂盒 阅读提示:Materials and methods: ADCC evaluation |