来自中国HIV-1精英中和抗体的具有强ADCC活性的有效且广谱的CD4结合位点中和抗体

A potent and broad CD4 binding site neutralizing antibody with strong ADCC activity from a Chinese HIV-1 elite neutralizer.

作者信息Yingdan Wang, Ping Ji, Qianying Liu, Nannan Jia, Yunping Ma, Tianyi Yuan, Palizhati Rehati, Jiali Chen, Yumei Wen, Fan Wu, Jinghe Huang
PMID40490455
发布时间2025-06-10
DOI10.1038/s41421-025-00808-x

实验完整度

包含多层级证据:体外中和实验、细胞系结合与ADCC功能验证、AlphaFold3结构预测、突变验证及自体病毒逆转突变实验。

主要模型

U87 CD4+CCR5+细胞(中和实验靶细胞) ACH-2细胞(潜伏HIV激活模型) H9 (IIIB)细胞(HIV感染靶细胞) TZM-bl细胞(感染指示细胞)

重点核对

FD22重链来源于IGHV3-30胚系,SHM 37%,CDRH3长20个氨基酸 中和实验使用145株假病毒,U87 CD4+CCR5+细胞为靶细胞 ADCC实验以H9 (IIIB)为靶细胞,PBMC为效应细胞,E:T=6:1 FcγRIIIa刺激实验使用Jurkat-Lucia NFAT-CD16a报告细胞 AlphaFold3结构预测关键参数:ModelSeeds等

摘要

针对HIV-1包膜糖蛋白(Env)上保守表位的广谱中和抗体(bNAbs)的发现,因其在开发有效治疗和疫苗策略方面的潜力而受到广泛关注。在本研究中,我们从中国一名感染B支病毒23年的精英中和者体内分离并鉴定了一种CD4结合位点(CD4bs)抗体FD22。FD22的重链来源于罕见的IGHV3-30胚系基因,具有极高的体细胞高频突变(SHM)(37%),并包含一个独特的20个氨基酸长的CDRH3环。FD22表现出强效且广谱的中和活性,与著名的bNAb VRC01相当。它有效中和了145种不同HIV-1假病毒中的82%,包括中国两种主要流行株CRF01_AE和CRF07_BC。FD22与HIV-1感染细胞系强结合,有效结合FcγRIIIa受体,触发NK细胞脱颗粒并释放IFN-γ和β-趋化因子等关键细胞因子,并强力诱导针对HIV-1感染靶细胞的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)。通过AlphaFold3对FD22与HIV Env SOSIP三聚体的结构预测、位点突变和自体病毒逆转突变实验揭示,FD22的表位跨越关键CD4结合位点,包括Loop D、CD4结合环(CD4 BLP)和V5环。FD22独特的CDRH3长环通过其带负电的残基R102与CD4结合位点相互作用,这使其区别于其他CD4bs抗体。我们的发现为FD22在病毒中和和ADCC中的作用机制提供了有价值的见解。FD22的双重功能增强了其作为有前景的治疗性抗体的潜力,并为设计具有增强ADCC能力的CD4bs靶向疫苗提供了新途径。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
从中国HIV-1精英中和者中分离的CD4bs抗体FD22是否具有广谱中和活性及ADCC功能,并阐明其作用机制。
核心机制
FD22通过其长的CDRH3环中的带正电荷残基R102与gp120上的CD4结合位点(Loop D、CD4 BLP、V5环)相互作用,介导中和和ADCC活性。
主要证据
中和实验显示FD22中和82%的145株假病毒,与VRC01相当;ADCC实验显示FD22诱导强效ADCC,优于VRC01和10-1074;AlphaFold3预测和突变分析证实R102的关键作用。
研究意义
FD22作为治疗性抗体具有潜力,并为设计增强ADCC能力的CD4bs靶向疫苗提供新途径。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

抗体分离与鉴定

从精英中和者P27的PBMC中分离出具有中和活性的单克隆抗体FD22。

从P27的PBMC中分选记忆B细胞,培养13天后通过微量中和实验筛选出FD22。鉴定其基因来源和突变频率。

2

结合活性与特异性分析

评估FD22与gp120的结合能力、亲和力及表位竞争性。

通过ELISA检测FD22与gp120蛋白的结合,BLI测定亲和力,竞争ELISA分析其与已知CD4bs抗体的竞争关系,并检测自体反应性。

3

中和活性评价

评估FD22对多种HIV-1假病毒的中和广度和效力。

使用145株Env假病毒进行中和实验,计算IC50,并比较FD22与VRC01的中和谱。

4

潜伏病毒激活抑制实验

评估FD22对激活后潜伏HIV感染靶细胞的抑制作用。

使用ACH-2细胞,以TNF-α或panobinostat激活潜伏HIV,然后加入FD22,检测其对靶细胞感染的抑制。

5

FcγRIIIa刺激与ADCC功能评估

评估FD22是否通过FcγRIIIa诱导ADCC效应。

使用Jurkat-Lucia NFAT-CD16a报告细胞检测FcγRIIIa刺激,NK细胞脱颗粒实验和LDH释放实验评估ADCC活性。

6

结构预测与关键残基验证

通过AlphaFold3预测FD22与Env SOSIP复合物结构,并通过突变验证关键残基。

使用AlphaFold3预测FD22 Fab与多种Env SOSIP三聚体的结构,分析相互作用界面;通过定点突变和自体病毒逆转突变验证R102等关键残基的作用。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基HyClone--
RPMI 1640培养基----
胎牛血清Gibco--
青霉素-链霉素Cytiva--
Biomyc-3抗支原体试剂Biological Industries--
SMM 293-TII培养基Sino Biological Inc.--
白细胞介素-2----
白细胞介素-21----
3T3-msCD40L饲养细胞----
pNL4-3.Luc.R-E-质粒----
EZ Trans转染试剂Life-iLab--
荧光素酶检测系统Promega--
HRP标记的山羊抗人IgG抗体----
ABTS底物----
EZ-Link NHS-LC-生物素Thermo Fisher--
10kDa离心过滤膜Millipore--
Octet RED96系统ForteBio--
活/死染料Thermo Fisher--
Alexa Fluor 647偶联的山羊抗人IgG (H+L)抗体Thermo Fisher--
Nano-Glo活细胞试剂PromegaN2058
NK细胞分离试剂盒Miltenyi Biotec130-092-657
重组人IL-15GibcoPHC9154
IMEM培养基Gibco12440053
小鼠抗人CD107a-PEBD Pharmingen555801
小鼠抗人CD3-PerCP-Cy5.5BD Pharmingen560835
小鼠抗人CD56-PE-Cy™7BD Pharmingen557747
小鼠抗人CD16-FITCBD Pharmingen555406
固定/通透化溶液试剂盒BD Biosciences554714
小鼠抗人IFN-γBD Pharmingen564791
小鼠抗人MIP-1βBD Pharmingen560686
CytoTox 96非放射性细胞毒性检测试剂盒PromegaG1780
裂解液PromegaG182A
CytoTox 96试剂PromegaG179A
终止液PromegaG183A
Alexa Fluor 647偶联的山羊抗人IgG (H+L)Invitrogen--
心磷脂----
Platinum Taq高保真系统Invitrogen--
Primestar聚合酶TAKARA--
pcDNA3.1(-)表达载体Invitrogen Life Technologies--
AXYGEN质粒小提试剂盒AXYGEN--
ChimeraX软件----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
中和实验
靶细胞U87 CD4+CCR5+的培养条件,假病毒的构建方法,抗体稀释倍数,孵育时间,检测系统
阅读提示:Materials and methods: Neutralization experiments
潜伏病毒激活抑制实验
ACH-2细胞的激活条件(TNF-α浓度,panobinostat浓度,处理时间),FD22浓度系列,TZM-bl细胞培养
阅读提示:Materials and methods: Inhibition of reactivated HIV-1 latently infected cells; P24 ELISA
FcγRIIIa刺激实验
靶细胞类型,抗体浓度,共培养时间,报告细胞系
阅读提示:Materials and methods: FcγRIIIa stimulation assay
NK细胞激活实验
PBMC分离方法,NK细胞纯化试剂盒,IL-15浓度,E:T比例,孵育时间,抗体浓度
阅读提示:Materials and methods: NK cell activation
ADCC评估
靶细胞H9 (IIIB),效应细胞PBMC,E:T比例,抗体浓度范围,孵育时间,LDH检测试剂盒
阅读提示:Materials and methods: ADCC evaluation