细胞培养和转染
在HEK293T细胞中表达宿主和病毒RHIM蛋白
HEK293T细胞以指定密度接种于35mm或100mm培养皿,孵育20-24小时后,使用Xfect试剂转染表达Nsp13、ZBP1和RIPK3的质粒。
Protocol for the detection of RHIM-protein oligomeric complex formation using DSP-mediated crosslinking in HEK293T cultured cells.
方案包含细胞培养、转染、DSP交联、亚细胞分级、SDS-PAGE和免疫印迹,并用突变体验证RHIM依赖性,但主要为方法学描述,功能验证有限。
HEK293T细胞
细胞系:HEK293T(人胚肾细胞) 转染试剂:Xfect,用量按质粒DNA量(0.3 μL/μg) DSP交联浓度:2 mM 裂解缓冲液:NP-40 HEPES缓冲液,含蛋白酶和磷酸酶抑制剂 检测抗体:抗Strep-Tag、抗HA-Tag、抗ZBP1(均为1:1000)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在HEK293T细胞中表达宿主和病毒RHIM蛋白
HEK293T细胞以指定密度接种于35mm或100mm培养皿,孵育20-24小时后,使用Xfect试剂转染表达Nsp13、ZBP1和RIPK3的质粒。
稳定RHIM蛋白间的相互作用并捕获寡聚复合物
转染后约28-30小时,用含2 mM DSP的NP-40 HEPES裂解缓冲液裂解细胞,冰上孵育45分钟,然后加入终止液终止交联。
将交联后的裂解物分为可溶和不溶性组分,以分析寡聚体性质
离心交联裂解物,收集上清和沉淀,分别用含或不含BME的样品缓冲液制备,并于95°C煮沸5-10分钟。
检测并分析RHIM蛋白的寡聚体
使用8% SDS-PAGE凝胶分离样品,半干转印至PVDF膜,分别用抗Strep-Tag、抗HA-Tag和抗ZBP1抗体孵育,再用HRP标记的二抗检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 10270106 |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15240062 | |
| 胰蛋白酶(2.5%),无酚红 | Thermo Fisher Scientific | 15090046 | |
| 转染 | Xfect转染试剂 | Takara Bio | 631318 |
| Opti-MEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 31985070 | |
| 裂解缓冲液 | HEPES(1 M) | Thermo Fisher Scientific | 15630080 |
| NP-40替代物 | Millipore | 492016 | |
| 磷酸酶抑制剂PhosSTOP | Sigma-Aldrich | PHOSSRO | |
| cOmplete Mini EDTA-free蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | 11836170001 | |
| SDS-PAGE | 甘油 | Sigma-Aldrich | G5516 |
| 溴酚蓝 | Sigma-Aldrich | B0126 | |
| 十二烷基硫酸钠 | Sigma-Aldrich | L3771 | |
| 免疫印迹 | PVDF转印膜 | Cytiva | 10600023 |
| Immobilon Forte Western HRP底物 | Millipore | WBLUF0500 | |
| 抗ZBP1抗体 | AdipoGen Life Sciences | AG-20B-0010-C100 | |
| 抗Strep标签抗体 | QIAGEN | 34850 | |
| 抗HA标签抗体 | Invitrogen | 26183 | |
| 辣根过氧化物酶标记的兔抗小鼠IgG | Jackson ImmunoResearch | 315-035-047 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和转染 | 细胞密度、传代数、转染试剂Xfect的用量和孵育时间 阅读提示:Materials and equipment, Step-by-step method details 步骤1 |
| 交联 | DSP工作浓度(2 mM)、裂解缓冲液组成、裂解时间 阅读提示:Step-by-step method details 步骤3和4 |
| 样品制备 | 离心条件(6000 ×g, 15-20分钟)、样品缓冲液还原剂(BME)使用 阅读提示:Step-by-step method details 步骤5-9 |
| SDS-PAGE和免疫印迹 | 凝胶浓度(8%)、上样量、电泳条件、转印条件、抗体稀释度 阅读提示:Step-by-step method details 步骤10-17 |