工程化EV的制备与表征
验证EV可被工程化携带免疫调节蛋白(CD80, OX40L, PD-L1),并表征其生物物理特性和蛋白组成。
使用转染方法在HEK293T细胞中过表达人/鼠CD80、OX40L或PD-L1,通过RT-qPCR、Western blot、流式细胞术验证表达;通过NTA和TEM检测EV大小和形态;通过质谱蛋白质组学分析EV蛋白组成,比较工程化EV与WT EV的差异。
Engineered Immunomodulatory Extracellular Vesicles from Epithelial Cells with the Capacity for Stimulation of Innate and Adaptive Immunity in Cancer and Autoimmunity.
涵盖体外细胞实验、外泌体表征、T细胞功能实验、多种体内肿瘤模型及自身免疫肝炎模型,并包含CD8+T细胞耗竭等机制验证。
HEK293T工程细胞系 B16-F10黑色素瘤小鼠模型 MC-38结直肠癌小鼠模型 ConA诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型
EV浓度:50 μg/ml(体外实验) EV给药剂量:50 μg/只(体内肿瘤模型),20 μg/只(联合抗CTLA-4实验),100 μg /只(EVmIM实验) 给药途径:腹腔注射(体内实验) 给药频次:每隔一天(肿瘤模型) 细胞系:B16-F10(5×10^4细胞,皮内),MC-38(1×10^5细胞,皮下)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证EV可被工程化携带免疫调节蛋白(CD80, OX40L, PD-L1),并表征其生物物理特性和蛋白组成。
使用转染方法在HEK293T细胞中过表达人/鼠CD80、OX40L或PD-L1,通过RT-qPCR、Western blot、流式细胞术验证表达;通过NTA和TEM检测EV大小和形态;通过质谱蛋白质组学分析EV蛋白组成,比较工程化EV与WT EV的差异。
验证工程化EV是否能在体外诱导人和鼠T细胞的阳性或阴性共刺激。
从PBMC(人)或脾脏(鼠)分离T细胞,激活后与工程化EV或对照共培养,通过流式细胞术检测T细胞活化标志物(CD25, CD69)、增殖标志物(Ki67)、细胞因子(IL-2, IFNγ)和细胞毒性标志物(Granzyme B)。
评估工程化EV在体内对肿瘤生长的影响及其对肿瘤免疫微环境的调节作用。
将B16-F10或MC-38细胞植入免疫活性小鼠,通过腹腔注射给予EV或对照,测量肿瘤体积,并通过流式细胞术分析肿瘤浸润免疫细胞。
评估工程化EV在ConA诱导的自身免疫性肝炎模型中对疾病进展的影响。
对小鼠预先给予EV或对照,然后静脉注射ConA,通过组织学评分和免疫细胞分析评估肝脏损伤和免疫变化。
确定OX40L EV的抗肿瘤作用是否依赖CD8+ T细胞。
使用抗CD4或抗CD8抗体进行T细胞亚群耗竭,评估OX40L EV对肿瘤生长和生存的影响。
评估OX40L EV与抗CTLA-4联合使用的抗肿瘤效果。
在B16-F10黑色素瘤模型中,联合给予OX40L EV和抗CTLA-4抗体,评估肿瘤生长和生存期。
评估EVmIM(含CD80, 4-1BBL, CD40L, CD2, CD32)对T细胞和APC的激活作用及抗肿瘤效果。
通过体外培养鼠脾细胞和DC2.4细胞,检测免疫细胞激活标志物和细胞因子释放;在B16-F10模型中进行体内治疗,并分析免疫细胞表型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | -- |
| RPMI-1640培养基 | Corning | -- | |
| 胎牛血清 | Gemini | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 基因过表达 | 潮霉素 | -- | -- |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy RNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| DNase酶 | Qiagen | -- | |
| 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Life Technologies | -- | |
| Power SYBR green PCR预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | 增强化学发光液 | Pierce or GenDEPOT | -- |
| Amersham Hyperfilm胶片 | GE Healthcare | -- | |
| 流式细胞术 | 醛/硫酸盐微珠 | Invitrogen | -- |
| Brilliant染色缓冲液 | BD | -- | |
| 可固定活力染料eFluor 780 | eBioscience | -- | |
| Cytofix/Cytoperm固定/破膜试剂 | BD | -- | |
| Perm/Wash缓冲液 | BD | -- | |
| Cytofix固定缓冲液 | BD | -- | |
| 质谱分析 | MicroBCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| Qubit定量仪 | Thermo | -- | |
| 二硫苏糖醇 | Sigma | 3483-12-3 | |
| 碳酸氢铵 | Sigma | 1066-33-7 | |
| 胰蛋白酶/LysC混合酶 | Promega | -- | |
| Pierce C18离心柱 | Thermo Scientific | -- | |
| Q-Exactive HF质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| EASY-nLC II 1200色谱系统 | Thermo Scientific | -- | |
| ReproSIL-Pur C18-AQ树脂 | -- | -- | |
| 纳米电喷雾离子源 | Thermo Scientific | -- | |
| 主动背景离子还原装置 | ESI Source Solutions | -- | |
| Xcalibur软件 | Thermo Scientific | -- | |
| 体内实验 | 刀豆蛋白A | Sigma | -- |
| Histopaque-1119分离液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Roche | -- | |
| Liberase TL消化酶 | Roche | -- | |
| 细胞培养 | GentleMACS组织处理器 | Miltenyi Biotec | -- |
| 细胞增殖检测 | CellTiter-Glo发光细胞活力检测试剂盒 | Promega | -- |
| ELISA试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 纳米颗粒分析 | NanoSight LM10纳米颗粒分析仪 | Malvern | -- |
| NanoSight NS300纳米颗粒分析仪 | Malvern | -- | |
| 电镜 | JEM 1010透射电子显微镜 | JEOL | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 工程化EV制备 | HEK293T/17细胞培养条件(DMEM,10% FBS,1%青霉素-链霉素);转染试剂及筛选抗性(Lipofectamine 3000,hygromycin或puromycin);EV产生时间(无血清培养基中24或48小时);EV分离方法(超速离心,100,000 xg,3小时) 阅读提示:Methods and Materials - Cell culture and generation of overexpressing cells; EV production |
| 体外T细胞功能实验 | PBMC分离方法(Ficoll);T细胞激活条件(anti-CD3e和anti-CD28,1 μg/ml);EV浓度(50 μg/ml);处理时间(16-24小时);检测指标(CD25, CD69, Ki67, IL-2, IFNγ, Granzyme B) 阅读提示:Methods and Materials - Ex vivo assays with human T cells; Ex vivo assays with murine T cells; Figure 2, 3 |
| 体内肿瘤模型 | 小鼠品系(C57BL/6J);肿瘤细胞接种数量和途径(B16-F10 5×10^4皮内,MC-38 1×10^5皮下);EV剂量和给药频率(50 μg或100 μg,每隔一天,腹腔注射);肿瘤体积测量方法和公式 阅读提示:Methods and Materials - In vivo studies; Figure 4, 5 |
| 自身免疫性肝炎模型 | EV预处理时间点(-96h, -48h, 0h);ConA剂量(20 mg/kg);组织收集时间(ConA后8小时);肝脏损伤评分标准 阅读提示:Methods and Materials - In vivo studies; Figure 6 |
| 联合治疗实验 | EV剂量(20 μg/只);抗CTLA-4抗体剂量和给药时间(200 μg第6天,100 μg第9/12/16天);CD4/CD8耗竭抗体剂量和时间(200 μg第6-20天,100 μg第20-30天) 阅读提示:Methods and Materials - In vivo studies; Figure 7, 8 |