S蛋白与OGT相互作用验证
验证SARS-CoV-2 S蛋白是否与OGT存在物理相互作用。
在HEK293T细胞中共表达HA-OGT与GFP-S,通过免疫共沉淀和GST-pulldown检测相互作用。
O-GlcNAcylation at S659 enhances SARS-CoV-2 spike protein stability and pseudoparticle packaging efficiency.
研究包含免疫共沉淀与GST-pulldown、质谱、突变体Western blot、CHX追踪、ACE2结合及假病毒包装等多个独立实验层级,具功能与机制验证。
HEK293T细胞 Huh7.5.1细胞 SARS-CoV-2假病毒包装系统
IP实验需验证GFP-S与HA-OGT共转染及相应抗体IP O-GlcNAc检测需使用TMG增强信号 CHX追踪实验中需明确CHX浓度及处理时间(原文未给出具体数值) 假病毒包装需按比例8:4:3:3共转染四种质粒 ACE2结合实验需共表达HA-ACE2并进行IP
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SARS-CoV-2 S蛋白是否与OGT存在物理相互作用。
在HEK293T细胞中共表达HA-OGT与GFP-S,通过免疫共沉淀和GST-pulldown检测相互作用。
鉴定S蛋白上O-GlcNAc修饰的具体位点。
利用离子迁移质谱分析S蛋白肽段,并通过突变体S659A与抗O-GlcNAc抗体Western blot验证。
评估O-GlcNAc修饰是否影响S蛋白的稳定性及其与泛素化的关系。
检测S659A突变体及OGA过表达对S蛋白泛素化水平的影响,并通过CHX追踪比较WT与突变体的半衰期。
评估S659A突变是否影响S蛋白与ACE2受体的结合。
在HEK293T细胞中共表达HA-ACE2与GFP-S-WT或S659A,通过IP检测结合。
评估S659A突变是否影响SARS-CoV-2假病毒的包装和感染效率。
用四质粒系统包装假病毒,感染Huh7.5.1细胞,检测荧光素酶活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | HEK293细胞 | COBIOER | CBP60232 |
| 抗体 | 抗Flag抗体 | 未知 | XHY021L |
| 兔抗GFP抗体 | Proteintech | 50430-2-AP | |
| 抗HA抗体 | Proteintech | 51064-2-AP | |
| HRP标记亲和纯化山羊抗兔IgG(H+L) | Proteintech | SA00001-2 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Immunoway | YM3028 | |
| 抗O-GlcNAc (RL2)抗体 | Abcam | ab2739 | |
| 质粒 | 带N端GFP标签的SARS-CoV-2刺突蛋白ORF cDNA表达质粒 | Sino Biological | RG81059-ANG |
| 带C端HA标签的人ACE2 ORF cDNA克隆表达质粒 | Sino Biological | HG10108-CY | |
| 假病毒包装 | PEI MAX转染级线性聚乙烯亚胺盐酸盐 | 未明确 | 24765-1 |
| 裂解液 | ECL检测系统 | Beyotiome | P0018FM-1 |
| 化学试剂 | Thiamet-G | 未明确 | -- |
| 异丙基β-D-硫代半乳糖苷 (IPTG) | 未明确 | -- | |
| 纯化 | 谷胱甘肽-琼脂糖珠 | 未明确 | -- |
| 试剂 | Steady-glo试剂 | Promega | -- |
| 仪器 | Bio-Rad ChemiDoc Touch凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 酶标仪 (TECAN SPARK) | TECAN | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白相互作用 | HEK293T细胞中GFP-S与HA-OGT共表达条件;IP抗体及Wash条件 阅读提示:Materials and Methods 中 IP and immunoblotting 及图1图注 |
| O-GlcNAc修饰检测 | S659A突变体构建;TMG浓度及处理时间(原文未明确) 阅读提示:Results 中 O-GlcNAcylation modification 部分及图2图注 |
| 蛋白稳定性 | CHX浓度及处理时间点(未明确);泛素化实验的转染条件及检测 阅读提示:Results 中 Impact of O-GlcNAcylation on S protein stability 及图3图注 |
| 假病毒包装 | 四质粒比例(8:4:3:3);PEI转染条件;病毒收获时间(48小时);感染细胞(Huh7.5.1)数量 阅读提示:Materials and Methods 中 SARS-CoV-2pp packaging 及图4图注 |