IgG微珠模型建立与吞噬效率定量
验证CD47对IgG介导吞噬的抑制作用,并确定SHP-1/2等磷酸酶的作用。
制备包被IgG或IgG+CD47的脂质双层微珠,与BMDMs共孵育,通过共聚焦显微镜计数内化微珠,并使用SHP-1/2/ SHIP1/2抑制剂处理。
CD47 inhibits phagocytosis through Vav dephosphorylation.
包含体外细胞模型(BMDMs)和多种功能验证(如抑制剂、突变体、TIRF成像、免疫印迹),并验证了CD47信号通路。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) L1210小鼠白血病细胞系(WT和CD47KO) CD47包被的脂质双层微珠(IgG+CD47 beads)
CD47对吞噬动力学的影响(时间、频率) Rac和Rho GTPase活性在吞噬杯的时空分布 Vav1磷酸化状态(pY174)及其去磷酸化 SHP-1/2抑制剂的效应 Rac2E62K和Vav3F突变体的功能验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CD47对IgG介导吞噬的抑制作用,并确定SHP-1/2等磷酸酶的作用。
制备包被IgG或IgG+CD47的脂质双层微珠,与BMDMs共孵育,通过共聚焦显微镜计数内化微珠,并使用SHP-1/2/ SHIP1/2抑制剂处理。
确定CD47影响吞噬的哪个步骤(结合、起始、完成)。
时间流逝共聚焦显微镜追踪吞噬过程,记录结合、起始、完成的时间及概率,并区分reaching和sinking吞噬模式。
确认CD47是否特异性抑制Rac活性而不影响Rho。
转染Rac或Rho生物传感器,在吞噬过程中测量活性GTPase在吞噬杯的富集;同时观察F-actin分布。
验证CD47阳性目标依赖Rho而非Rac进行吞噬。
用Rac抑制剂(NSC23766, MBQ-167)或Rho抑制剂(C3 transferase)处理BMDMs,然后检测吞噬IgG和IgG+CD47微珠的效率;并使用L1210细胞验证。
确定CD47抑制是否发生在Rac激活的上游。
从Rac2E62K/+小鼠分离BMDMs,与WT或CD47KO L1210细胞共孵育,监测吞噬。
检测CD47是否导致Vav1去磷酸化,并验证SHP-1/2的作用。
用IgG或IgG+CD47微珠孵育BMDMs,通过免疫印迹检测磷酸化Vav1和Syk;用免疫沉淀验证。用SHP-1/2抑制剂处理。用不能结合SIRPα的CD47突变体验证特异性。
确定CD47是否影响Vav1招募到吞噬突触,以及组成型活性Vav1能否绕过CD47抑制。
使用TIRF显微镜观察Vav1在平面脂质双层上的分布,并测量与IgG簇的共定位;转染组成型活性Vav1 (Vav3F)突变体,检测吞噬效率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | GIBCO | Catalog #11965–092 |
| 青链霉素-谷氨酰胺 | Corning | Catalog #30–009 CI | |
| 热灭活胎牛血清 | Atlanta Biologicals | Catalog #S11150H | |
| RPMI-1640培养基 | GIBCO | Catalog #72400120 | |
| 病毒包装 | Lenti-X 293T细胞 | Takara Biosciences | Cat# 632180 |
| Lipofectamine LTX转染试剂 | Invitrogen | Cat #15338–100 | |
| LentiX浓缩液 | Takara Biosciences | Cat# 631232 | |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA琼脂糖 | QIAGEN | Cat# 30230 |
| Superdex 200 10/300 GL色谱柱 | GE Healthcare | Cat# 17517501 | |
| 脂质双层制备 | POPC磷脂 | Avanti | Cat# 850457 |
| 生物素化的PE磷脂 | Avanti | Cat# 870273 | |
| PEG5000-PE磷脂 | Avanti | Cat# 880230 | |
| Ni2+-DGS-NTA脂质 | Avanti | Cat# 790404 | |
| Atto390-DOPE荧光脂质 | ATTO-TEC GmbH | Cat# AD 390–161 | |
| Atto647-DOPE荧光脂质 | ATTO-TEC GmbH | Cat# AD 647–161 | |
| 酪蛋白 | Sigma | Cat# C5890 | |
| 吞噬实验 | 二氧化硅微珠 | Bangs Laboratories | Cat# SS05003 |
| 抗生物素IgG | Jackson ImmunoResearch Laboratories | Cat# 200–002-211 | |
| CD47胞外域 | Sino Biological | Cat# 57231-M08H | |
| TPI-1 | Sigma | Cat# SML3119 | |
| SHP099 | MedChemExpress | Cat# HY-100388 | |
| 3AC | Sigma | Cat# 565835 | |
| AS1938909 | Sigma | Cat# 565840 | |
| NSC23766 | APExBIO | Cat# A1952 | |
| MBQ-167 | MedChemExpress | Cat# HY-112842 | |
| C3转移酶 | Cytoskeleton | Cat# CT04-A | |
| CellTrace Far Red细胞染料 | Thermo Fisher Scientific | Cat# C34572 | |
| 抗小鼠CD20抗体 | Genentech | clone 5D2 | |
| 流式分析 | 抗CD47 APC抗体 | BioLegend | Cat# 127514 |
| 免疫印迹 | 抗Vav1抗体 | Cell Signaling Technology | Cat# 2502S |
| 抗磷酸化Vav1抗体 | Abcam | Cat# ab76225 | |
| 抗Syk抗体 | Cell Signaling Technology | Cat# 13198 | |
| 抗磷酸化Syk抗体 | Cell Signaling Technology | Cat# 2717 | |
| 抗磷酸化酪氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | Cat# 8954 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A琼脂糖珠 | Cell Signaling Technology | Cat# 9863S |
| IPEGAL CA-630去污剂 | EMD-Millipore | Cat# 8896 | |
| 苯zonase核酸酶 | EMD-Millipore | Cat# 101697 | |
| 蛋白酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | Cat# 78430 | |
| 显微成像 | 玻璃底96孔板 | Brooks | Cat# MGB096–1-2-LG-L |
| Ibidi盖玻片 | Ibidi | Cat# 10812 | |
| 鬼笔环肽 | Cytoskeleton | Cat# PHDG1 | |
| 转盘共聚焦显微镜 | Nikon | 40 × 0.95 NA Plan Apo air objective | |
| 全内反射荧光显微镜 | iLas2 ring TIRF | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 吞噬实验 | 微珠表面CD47密度、IgG浓度、吞噬时间、SHP抑制剂浓度 阅读提示:Methods: Phagocytosis assays, Bead engulfment |
| 吞噬动力学分析 | 成像间隔、z步长、吞噬阶段定义 阅读提示:Methods: Kinetics of engulfment |
| Rac和Rho活性检测 | 生物传感器类型、成像设置、定量方法 阅读提示:Methods: Measuring Rac, Cdc42, and Rho activity during phagocytosis |
| 抑制剂验证 | Rac和Rho抑制剂浓度、处理时间、L1210调理方法 阅读提示:Methods: Phagocytosis assays, L1210 engulfment |
| Vav1磷酸化检测 | 抗体稀释、裂解条件、免疫沉淀步骤 阅读提示:Methods: Immunoblotting, Immunoprecipitation |
| Vav1招募和活性验证 | TIRF成像条件、脂质双层组成、Vav3F表达 阅读提示:Methods: TIRF imaging, Quantification of IgG clusters and Vav1 recruitment |