mig-cDC在tdLN中的减少
探究肿瘤进展是否影响DCs向tdLN的迁移。
通过免疫荧光染色和流式细胞术分析人和小鼠肿瘤模型不同阶段的tdLN中迁移性DC的数量。
Rescuing dendritic cell interstitial motility sustains antitumour immunity
涉及人样本分析、小鼠肿瘤模型、CRISPR筛选、体外迁移实验及体内治疗实验等多个层级,并包含机制验证。
B16F10黑色素瘤小鼠模型 MC38结肠癌小鼠模型 人胰腺癌、乳腺癌和结肠癌前哨淋巴结样本 BMDC体外分化模型
肿瘤早期/晚期定义(<200 mm³ vs >600 mm³) CRISPR筛选流程(BMDC或HSPC感染、移植、mig-cDC收集) 西地那非给药剂量及方案(0.02 mg/g,隔日一次,共7次) DC迁移实验条件(3D胶原蛋白浓度1.7 mg/ml)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究肿瘤进展是否影响DCs向tdLN的迁移。
通过免疫荧光染色和流式细胞术分析人和小鼠肿瘤模型不同阶段的tdLN中迁移性DC的数量。
鉴定调控DC迁移的基因。
使用BMDC或HSPC感染sgRNA文库,移植到小鼠体内,收集tdLN中的mig-cDCs进行sgRNA富集分析。
验证Pde5在DC迁移和抗肿瘤免疫中的作用。
通过共转移实验、条件敲除小鼠模型和肿瘤生长实验验证Pde5的功能。
研究肿瘤进展如何影响DC间质迁移。
使用3D胶原凝胶迁移实验、RNA-seq分析、免疫荧光等手段评估DC迁移能力和相关基因表达。
阐明cGMP调节DC迁移的分子机制。
通过Western blot、DNA-PAINT超分辨显微镜、FRET传感器等检测cGMP对MLC磷酸化、RhoA活性的影响。
评估PDE5抑制剂西地那非的治疗潜力。
在多种肿瘤模型中给予西地那非,评估肿瘤生长、DC迁移和T细胞反应。
验证西地那非的抗肿瘤作用是否依赖于DC。
使用Pde5DC-cKO和Pde5DC-cKI小鼠,特异性敲除或敲入DC中的Pde5,观察西地那非的效应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11965500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141C | |
| 青霉素-链霉素-谷氨酰胺 | Thermo Fisher Scientific | 10378016 | |
| 细胞因子 | FLT3配体 | SinoBiological | 51113-M02H |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L2630 | |
| 药物处理 | 8-溴-cGMP | Sigma-Aldrich | B1381 |
| 西地那非 | MedChemExpress | HY-15025 | |
| DETA NONOate | MedChemExpress | HY-136278 | |
| Blebbistatin | Sigma-Aldrich | 203391 | |
| PKG抑制剂肽 | MedChemExpress | HY-P1292 | |
| ODQ | MedChemExpress | HY-101255 | |
| Rhosin盐酸盐 | MedChemExpress | HY-12646 | |
| Y27632 | Sigma-Aldrich | Y0503 | |
| 抗体 | 抗CD3抗体 | Abcam | ab307134 |
| 抗CD19抗体 | Abcam | ab196515 | |
| 抗CD11c抗体 | Abcam | ab279329 | |
| 抗LAMP3抗体 | Cell Signaling Technology | 47778T | |
| 抗兔Alexa Fluor 647 | Thermo Fisher Scientific | A-21245 | |
| 抗兔Alexa Fluor 594 | Thermo Fisher Scientific | A-11012 | |
| 免疫荧光 | ProLong玻璃抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | P36980 |
| O.C.T包埋剂 | SAKURA | 4583 | |
| 抗CD11c抗体 | BioLegend | 117312 | |
| 抗小鼠MHC II类(I-A/I-E)抗体 | Bio X cell | BE0108 | |
| 抗小鼠/大鼠XCR1抗体 | BioLegend | 148204 | |
| 抗LYVE1抗体 | Abcam | ab14917 | |
| 细胞培养 | ACK裂解缓冲液 | -- | -- |
| 细胞分离 | EasySep小鼠泛DC富集试剂盒 | StemCell | 19763 |
| 细胞标签 | CTV染料 | Invitrogen | C34557 |
| CFSE染料 | BioLegend | 423801 | |
| 组织消化 | 胶原酶IV | Worthington | LS004188 |
| DNase I | Roche | 11284932001 | |
| 流式 | Zombie Aqua活死染料 | BioLegend | 423102 |
| Fc受体阻断剂 | BD Biosciences | 553142 | |
| ELISA | cGMP ELISA试剂盒 | Genscript | L00461 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche | 4906845001 | |
| pMLC2 (Ser19)抗体 | Cell Signaling Technology | 3671 | |
| 磷酸化ROCK1(T455和S456)抗体 | Abcam | ab203273 | |
| PKG1抗体 | Cell Signaling Technology | 3248 | |
| PDE5抗体 | Cell Signaling Technology | 2395 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| SuperSignal West Femto底物 | Thermo Fisher Scientific | 34095 | |
| 动物实验 | 西地那非 | MCE | HY-15025 |
| 抗PD-1抗体 | Bioxcell | BE0146 | |
| 抗CD8α抗体 | Bioxcell | BE0061 | |
| 大鼠IgG2b同型对照 | Bioxcell | BE0090 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肿瘤模型 | 肿瘤细胞系和接种细胞数 阅读提示:Methods: Mouse tumour models |
| 人或小鼠肿瘤分期 | 早期和晚期肿瘤的定义标准 阅读提示:Methods: Mouse tumour models |
| DC迁移实验 | 胶原蛋白浓度、细胞处理药物及浓度、成像系统 阅读提示:Methods: DC motility in the 3D-collagen assay |
| CRISPR筛选 | sgRNA文库、感染细胞类型、移植流程 阅读提示:Methods: The pre-round screening procedure, The major-round screening procedure |
| PDE5功能验证 | Pde5敲除或敲入小鼠模型、竞争性转移实验条件 阅读提示:Methods: In vivo DC competition assay |
| 西地那非治疗 | 给药剂量、给药途径、给药频率和总次数 阅读提示:Methods: Tumour treatment experiments |