活体蝙蝠感染模型建立
评估JFB对EBOV和MARV感染的临床结果、病毒复制和排毒情况。
通过口服、鼻内和皮下联合接种EBOV-Mayinga或MARV-Ozolin,监测体温、体重、血液学、排毒及组织病毒载量。
Jamaican fruit bats' competence for Ebola but not Marburg virus is driven by intrinsic differences.
包含活体蝙蝠感染模型、体外细胞感染、病毒进入与复制实验、先天免疫信号通路分析及转录组测序等多层级验证。
牙买加果蝠(Artibeus jamaicensis) JFB原代肾细胞(AjKi_RML1、AjKi_RML2) JFB原代肺细胞(AjLu_RML3) JFB翼膜成纤维细胞(AjUFi_RML6)
EBOV-Mayinga和MARV-Ozolin的接种剂量(总3.0×10^4 TCID50)及接种途径(口服、鼻内、皮下) 体内实验的观察时间点(3、7、28 DPI)及各时间点的动物数量(n=4) RT-qPCR检测病毒RNA的检测限(组织2.2 log10 copies/g,拭子1.63 log10 copies/mL) 体外感染实验的MOI(0.1或1.5)和检测时间点(24、48、72、96、120 HPI) IFN-I信号抑制实验中使用的抑制剂及浓度(itacitinib 0.25–25 nM,BAY-985 25 nM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估JFB对EBOV和MARV感染的临床结果、病毒复制和排毒情况。
通过口服、鼻内和皮下联合接种EBOV-Mayinga或MARV-Ozolin,监测体温、体重、血液学、排毒及组织病毒载量。
比较EBOV和MARV在JFB体内的复制能力和排毒模式。
通过RT-qPCR和病毒滴定检测拭子、组织和血清中的病毒RNA及感染性病毒。
评估EBOV和MARV感染后JFB的先天免疫和体液免疫反应。
通过RT-qPCR检测ISG和细胞因子mRNA表达,ELISA检测GP特异性抗体,病毒中和试验检测中和抗体,流式细胞术分析淋巴细胞亚群。
比较EBOV和MARV在JFB细胞中的复制效率、进入效率和IFN-I信号拮抗能力。
使用多种JFB细胞系(原代和永生化)感染不同EBOV和MARV毒株,监测复制动力学和宿主基因表达;使用VSV假颗粒和重组VSV评估进入和早期复制差异;通过western blot检测STAT1/2磷酸化。
验证MARV因无法有效拮抗IFN-I信号而复制受限。
使用IFN-I信号抑制剂(BAY-985、itacitinib)处理细胞,评估对EBOV和MARV复制的影响;检测外源IFN-β对病毒复制和ISG表达的敏感性。
比较EBOV和MARV感染后JFB肝脏的转录组变化。
对3 DPI肝脏RNA进行mRNA测序,分析差异表达基因和通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 病毒滴定 | Vero E6细胞 | ATCC | CRL-1586 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| RNA提取 | RNeasy小型试剂盒 | Qiagen | -- |
| QIAamp病毒RNA试剂盒 | Qiagen | -- | |
| RT-qPCR | TaqMan快速病毒一步法预混液 | Applied Biosystems | -- |
| QuantStudio 6或3 Flex实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | pSTAT1抗体(Y701) | Cell Signaling Technology | 9167S |
| pSTAT2抗体(Y690) | Cell Signaling Technology | 88410S | |
| 总STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 14994S | |
| 总STAT2抗体 | Cell Signaling Technology | 72604S | |
| EBOV VP24抗体 | Sino Biological | 40454-T46 | |
| EBOV VP40抗体 | GeneTex | GTX134034 | |
| MARV VP40抗体 | The Native Antigen Company | MAV12450-100 | |
| RIG-I抗体 | Kerafast | 1C3 | |
| β-微管蛋白抗体 | Sigma Aldrich | T8328 | |
| Lamin A/C抗体 | Cell Signaling Technology | 4777S | |
| Clarity Western ECL底物 | BioRad | -- | |
| SuperSignal West Femto底物 | Thermo Scientific | -- | |
| iBright成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞培养 | TrypLE Express消化液 | Gibco | -- |
| MEM非必需氨基酸 | Gibco | -- | |
| IFN-β表达 | pcDNA3.4载体 | GenScript | -- |
| FreeStyle 293表达培养基 | Gibco | -- | |
| PEI MAX转染试剂 | Polysciences | 24765-1 | |
| IFN-β纯化 | HisPur Ni-NTA树脂 | ThermoFisher Scientific | -- |
| Ni-NTA Superflow柱 | Qiagen | -- | |
| HiTrap Capto Q阴离子交换柱 | Cytiva | -- | |
| AKTA FPLC系统 | GE Healthcare | -- | |
| IFN-I抑制实验 | BAY-985抑制剂 | -- | -- |
| 伊他替尼 | -- | -- | |
| 高分子量聚肌胞苷酸 | Invitrogen | -- | |
| 病毒中和试验 | EBOV GP ELISA抗原 | -- | -- |
| MARV GP ELISA抗原 | IBT Bioservices | 0506-015 | |
| ELISA | Maxisorp板 | Nunc | -- |
| TMB底物试剂盒 | SeraCare | 5120-0047 | |
| 流式细胞术 | Alexa Fluor蛋白标记试剂盒 | Invitrogen | A10238 |
| ViaKrome 808可固定活力染料 | Beckman Coulter | -- | |
| Cytofix/Cytoperm试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| 别藻蓝蛋白标记抗CD79a抗体 | BD Biosciences | HM57 | |
| 异硫氰酸荧光素标记抗CD3ε抗体 | BioRad | CD3-12 | |
| Cytoflex LX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| BCR测序 | NEBNext Ultra II DNA文库制备试剂盒 | New England Biolabs | E7103S |
| NEBNext多重寡核苷酸(Illumina) | New England Biolabs | E7335S | |
| MiSeq测序仪 | Illumina | -- | |
| 血液学 | ProCyte DX血液分析仪 | IDEXX Laboratories | -- |
| 血液生化 | VetScan VS2生化分析仪 | Abaxis | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 活体感染 | EBOV-Mayinga和MARV-Ozolin病毒株、接种总剂量3.0×10^4 TCID50、接种途径(口服、鼻内、皮下)、动物年龄和性别比例 阅读提示:Methods: Bat inoculation |
| 样本采集与检测 | 拭子采集时间点(感染前、每2天至14 DPI、21 DPI、尸检)、组织采集时间点(3、7、28 DPI)、RT-qPCR检测限、病毒滴定检测限 阅读提示:Methods: Bat inoculation, RNA extractions and RT-qPCR, Virus titration |
| 体外感染 | 细胞系(AjKi_RML1、AjKi_RML2、AjUFi_RML6等)、MOI(0.1或1.5)、感染时间、培养基成分、重复次数 阅读提示:Methods: In vitro infections |
| IFN-I信号分析 | 抑制剂(BAY-985、itacitinib)浓度、IFN-β浓度和处理时间、western blot抗体信息 阅读提示:Methods: IFN-I pathway inhibition, Western blot analysis |
| 转录组分析 | RNA样本质量、测序平台(NextSeq)、差异表达分析参数(padj<0.05, fold change>2) 阅读提示:Methods: Next-generation sequencing of mRNA |