体内保护性实验
评估单mAb对SARS-CoV-2感染的预防效果及逃逸突变出现
仓鼠接受10 mg/kg mAb(MB025_A07K、MB025_A09L、MB027_E04L或帕利珠单抗对照)腹腔注射,24小时后鼻内感染104 TCID50 SARS-CoV-2 614G,4天后分析病毒滴度和病理。
Somatic hypermutation shapes the viral escape profile of SARS-CoV-2 neutralising antibodies.
包含体内仓鼠挑战、体外病毒逃逸分析、SPR亲和力测定及Fc效应功能等多种实验,并进行功能验证。
叙利亚仓鼠感染模型 VSV∗ΔG-S体外病毒逃逸模型 ExpiCHO细胞表达系统
仓鼠模型:10 mg/kg mAb腹腔注射,24h后104 TCID50 SARS-CoV-2 614G鼻内感染,4天后安乐死 病毒逃逸测定:六种递减抗体浓度与0.5×106 pfu VSV∗ΔG-S孵育1h,Vero-B4细胞感染4天 SPR测量:Biacore 8K+,C1芯片,固定Wuhan/Alpha/Delta/Omicron RBD,多浓度动力学 表位分箱:SPR竞争实验,饱和第一mAb后依次测试其他mAb结合能力
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估单mAb对SARS-CoV-2感染的预防效果及逃逸突变出现
仓鼠接受10 mg/kg mAb(MB025_A07K、MB025_A09L、MB027_E04L或帕利珠单抗对照)腹腔注射,24小时后鼻内感染104 TCID50 SARS-CoV-2 614G,4天后分析病毒滴度和病理。
鉴定不同mAb诱导的病毒逃逸突变热点
使用表达SARS-CoV-2刺突蛋白的重组VSV(VSV∗ΔG-S),在梯度抗体浓度下连续传代,选择逃逸突变体,并通过测序鉴定刺突RBD区域的突变。
定量比较成熟mAb与生殖系版本对不同VOC RBD的结合亲和力
使用Biacore 8K+ SPR系统,将Wuhan、Alpha、Delta、Omicron RBD固定在C1芯片上,以mAb为分析物进行多浓度动力学测量。
确定mAbs是否结合非重叠表位以形成抑制逃逸的抗体组合
利用SPR竞争实验,饱和一个mAb后测试其他mAb的额外结合能力,以判断表位重叠性。
评估mAb组合对ADCD、ADCP、ADNP和ADNKA的影响
通过抗体依赖性补体沉积(ADCD)、THP-1细胞吞噬(ADCP)、中性粒细胞吞噬(ADNP)和NK细胞活化(ADNKA)测定,比较单价和组合mAb的效应功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗体表达 | ExpiCHO细胞 | Thermo Fisher | -- |
| ExpiFectamine CHO转染试剂盒 | Thermo Fisher | A29129 | |
| 抗体纯化 | Protein A HiTrap Fibro柱 | Cytiva | 17549856 |
| Qubit蛋白质测定 | Invitrogen | Q33212 | |
| Superdex 200 increase柱 | Cytiva | -- | |
| 体内实验 | HiTrap Protein G HP亲和色谱柱 | Cytiva | 17040503 |
| Luer Lock塑料注射器 | Braun | 461709F | |
| 显色内毒素定量试剂盒 | Thermo Scientific | A39552 | |
| 病毒滴定 | TissueLyser II组织匀浆器 | Qiagen | -- |
| Calu-3细胞 | ATCC | HTB-55 | |
| 免疫组化 | 抗SARS-CoV-2核衣壳抗体 | Sino Biological | 40143-MM05 |
| 病毒逃逸测定 | Vero-B4细胞 | DSMZ | ACC 033 |
| IgG1 ELISA试剂盒 | Invitrogen | BMS2092 | |
| MiniPrep Plus试剂盒 | Zymo | R2070 | |
| PrimeScript RT预混液 | Takara | RR0364 | |
| PCR纯化试剂盒 | Qiagen | 28506 | |
| SPR测量 | Biacore 8K+ | Cytiva | -- |
| C1传感芯片 | Cytiva | -- | |
| 效应功能测定 | NHS-Sulfo-LC-LC生物素化试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| Zeba离心脱盐柱 | Thermo Fisher | -- | |
| NeutrAvidin标记微球 | Invitrogen | -- | |
| 豚鼠补体 | Cedarlane | -- | |
| 抗豚鼠C3a-FITC抗体 | MP Biomedicals | -- | |
| ID7000光谱细胞分析仪 | Sony Biotechnology | -- | |
| ACK裂解缓冲液 | Biomol | -- | |
| 抗人CD66b-Pacific Blue抗体 | BioLegend | -- | |
| THP-1细胞 | DSMZ | ACC 16 | |
| RosetteSep NK细胞富集混合物 | STEMCELL Technologies | -- | |
| 重组人IL-15 | BioLegend | -- | |
| 布雷菲德菌素A | Sigma-Aldrich | -- | |
| GolgiStop | BD Biosciences | -- | |
| 抗人CD107a-BV605抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗人CD3-APC-Cy7抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗人CD56-PE-Cy7抗体 | BioLegend | -- | |
| 固定透化试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 抗人MIP-1β-BV421抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗人IFN-γ-PE抗体 | BioLegend | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内保护实验 | 仓鼠品系:叙利亚仓鼠(Mesocricetus auratus),6-10周龄;mAb剂量:10 mg/kg;感染剂量:104 TCID50 SARS-CoV-2 614G;感染时间:mAb处理后24小时;安乐死时间:感染后4天 阅读提示:Methods: SARS-CoV-2 infection of hamsters |
| 病毒逃逸测定 | 病毒:VSV∗ΔG-S;细胞:Vero-B4;抗体浓度:6种递减浓度;病毒量:0.5×106 pfu;孵育时间:1小时;传代时间:4天 阅读提示:Methods: Virus antibody escape assay |
| SPR测量 | 仪器:Biacore 8K+;芯片:C1;抗原:SARS-CoV-2 RBD(Wuhan、Alpha、Delta、Omicron);温度:37°C;流速:50 μl/min;浓度系列:至少8个浓度 阅读提示:Methods: Surface plasmon resonance measurements |
| 表位分箱 | 芯片:C1;抗原:Wuhan RBD;流速:10 μl/min;饱和顺序:依次饱和第一mAb后测试其他mAb 阅读提示:Methods: Surface plasmon resonance measurements (Epitope binning) |
| Fc效应功能测定 | mAb浓度范围:0.024-100 μg/ml;组合总浓度100 μg/ml;效应细胞:中性粒细胞、NK细胞、THP-1细胞、补体 阅读提示:Methods: Determination of Fc-mediated effector functions |