系统泛癌分析将NCOA4确定为免疫学和预后生物标志物并在肺腺癌中验证

背景:癌症免疫治疗已彻底改变了治疗方式，但预测患者反应仍具挑战性。核受体辅激活因子4（NCOA4）作为生物标志物的潜力已在不同类型的癌症中被发现。然而，其作为跨癌症（尤其是肺腺癌，LUAD）的免疫学和预后因素的作用仍需全面了解。本研究旨在通过系统分析NCOA4在泛癌中的表达及其与临床结局和免疫反应的相关性来填补这一空白。目的:评估NCOA4作为预后生物标志物，并探讨其与不同癌症类型（特别关注LUAD）中免疫微环境的关联。方法:我们综合分析来自CCLE、GTEx和TCGA数据库的数据。分析正常和肿瘤组织中NCOA4的表达，并使用单变量Cox回归和Kaplan-Meier分析评估其与总生存期的相关性。使用ESTIMATE、TIMER和xCELL算法评估免疫浸润。我们综合分析了其与六种基因组不稳定性标志物及某些肿瘤中基于DNA甲基化和mRNA的干性指数的相关性，以探究NCOA4在介导癌症基因组异质性和干性中的潜在作用。进行了PPI网络分析和KEGG/GO富集分析以识别相关蛋白和通路。使用免疫组织化学（IHC）对LUAD样本进行染色。使用TIDE算法预测TCGA-LUAD队列中的免疫检查点阻断（ICB）反应。结果:在包括LUAD在内的18种癌症类型中，NCOA4表达显著高于正常组织，而在5种类型中则较低。单变量Cox回归和Kaplan-Meier分析显示，特定癌症的生存结果与NCOA4表达呈负相关。免疫浸润分析显示NCOA4与免疫细胞（包括CD8+ T细胞、中性粒细胞和树突状细胞）的存在显著相关。基因组不稳定性标志物，包括TMB和MSI，与NCOA4表达显著相关，表明其在免疫治疗反应中的潜在作用。干性指数分析提示NCOA4参与调控肿瘤干性。PPI网络和KEGG/GO富集分析表明NCOA4参与免疫相关的生物学过程和通路。LUAD组织的IHC染色证实肿瘤中NCOA4表达高于非癌组织。TIDE算法预测，较高的NCOA4表达水平（如升高的TIDE评分所示）与TCGA-LUAD队列中较差的ICB反应率相关。结论:NCOA4在癌症中表现出与预后、免疫浸润和基因组不稳定性的情境依赖性关联。虽然LUAD中的实验验证支持其作为生物标志物的候选资格，但仍需机制研究以建立因果关系。这些发现突出了NCOA4在将患者分层用于免疫治疗和铁死亡靶向治疗中的潜在用途。