验证AIBP在斑马鱼中对淋巴管生成的作用
探究Aibp2缺失是否影响淋巴管内皮细胞命运和淋巴管形成。
通过Aibp2敲除斑马鱼与fli1a:egfp转基因杂交,免疫染色分析Prox1阳性细胞,观察TD形态,并检测LEC相关基因表达。
APOA1 binding protein promotes lymphatic cell fate and lymphangiogenesis by relieving caveolae-mediated inhibition of VEGFR3 signaling.
包含斑马鱼遗传敲除与敲入、小鼠角膜和尾部淋巴水肿模型、mESC分化、细胞信号和蛋白质互作等至少两个独立证据层级,并有功能与机制验证。
斑马鱼apoa1bp2−/−;fli1a:egfp 人淋巴管内皮细胞(hLECs) 小鼠胚胎干细胞(mESC)淋巴管内皮分化 成年小鼠角膜和尾部淋巴水肿模型
斑马鱼Aibp2敲除导致Prox1+ LEC减少(4 dpf,TD) hLECs中AIBP和HDL联合处理增强VEGFC诱导的VEGFR3磷酸化 VEGFR3AAA突变体丧失CAV-1结合并增强VEGFR3信号 小鼠角膜VEGFC/AA/CSD植入促进淋巴管生成 小鼠尾部淋巴水肿模型中VEGFC和AIBP联合给药加速恢复
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究Aibp2缺失是否影响淋巴管内皮细胞命运和淋巴管形成。
通过Aibp2敲除斑马鱼与fli1a:egfp转基因杂交,免疫染色分析Prox1阳性细胞,观察TD形态,并检测LEC相关基因表达。
确定AIBP是否在体外促进LEC分化。
从mESC制备拟胚体,在含BMP4和bFGF的分化培养基中培养,第3天添加VEGFA/VEGFC或AIBP,分析LEC标志物表达。
测试AIBP是否通过降低胆固醇和破坏caveolae来调控VEGFR3信号。
在hLECs中检测AIBP处理后caveolae数量、胆固醇外流和胆固醇水平,并通过TEM和蔗糖梯度离心分析。
探究CAV-1是否直接结合并抑制VEGFR3信号。
通过免疫共沉淀检测VEGFR3与CAV-1结合,构建VEGFR3AAA突变体,检测其与CAV-1结合、信号强度和caveolae定位。
确定Cav-1缺失或Vegfr3突变能否恢复Aibp2敲除引起的淋巴缺陷。
使用Cas12a/crRNA急性敲除Cav-1,构建Vegfr3AAA敲入斑马鱼,分析Prox1+ LEC数量。
评估AIBP对治疗性淋巴管生成的促进作用。
在角膜淋巴管生成模型植入VEGFC/AA/CSD,在尾部淋巴水肿模型腹腔注射VEGFC和AIBP,评估淋巴管面积和水肿恢复。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 血管细胞基础培养基 | ATCC | PCS-100-030 |
| 微血管内皮细胞生长试剂盒-VEGF | ATCC | PCS-110-041 | |
| 药物处理 | 甲基-β-环糊精 | Sigma | C4555 |
| 胆固醇外流 | 高密度脂蛋白 | Athens Research & Technology | 12-16-080412-TC |
| 细胞处理 | 重组AIBP | Sino Biological | 13421-H08H |
| BODIPY胆固醇外流 | 胆固醇外流试剂盒 | Biovision | K582 |
| 细胞培养 | ESGRO-2i培养基 | Sigma | SF016-200 |
| mESC培养补充 | ESGRO-2i补充试剂盒 | Sigma | ESG1121 |
| 细胞分化 | 骨形态发生蛋白4 | Gibco | PHC9534 |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | R&D systems | 233-FB/CF | |
| 血管内皮生长因子A | R&D systems | 293 | |
| 血管内皮生长因子C | R&D systems | 2179-VC | |
| 信号通路抑制 | DAPT | Cayman chemical | 13197 |
| SAR13165 | Cayman chemical | 28385 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAi MAX | Invitrogen | 13778100 |
| 质粒构建 | Stbl3感受态细胞 | ThermoFisher Scientific | C737303 |
| Gibson组装 | Gibson组装 | NEB | E2611S |
| Western blot | Pierce蛋白酶和磷酸酶抑制剂迷你片 | ThermoFisher Scientific | A32961 |
| 抗磷酸酪氨酸抗体(4G10) | CST | 96215S | |
| Caveolin-1抗体 | CST | 3238S | |
| GAPDH抗体 | CST | 2118S | |
| VEGFR3抗体 | Santa Cruz | SC321 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖 | Santa Cruz | SC-9996 |
| IgG A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | SC-28297 | |
| PLA | Duolink原位红色起始试剂盒(小鼠/兔) | Sigma | DUO92101 |
| 斑马鱼注射 | EnGen Lba Cas12a(Cpf1) | NEB | M0653T |
| Alt-R L.b. Cas12a crRNA | Integrated DNA Technologies | -- | |
| 基因分型 | MslI限制性内切酶 | NEB | R0571S |
| 斑马鱼培养 | Hank's平衡盐溶液 | Gibco | 14025-092 |
| 化学处理 | 4-羟基他莫昔芬 | Sigma | H7904 |
| 阿托伐他汀 | Sigma | PZ0001 | |
| 免疫染色 | Prox1a抗体 | GeneTex | GTX128354 |
| Prox1抗体 | Angiobio | 11-002P | |
| pErk1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| GFP抗体 | ThermoFisher Scientific | A10262 | |
| 信号放大 | Alexa Fluor 594酪胺信号放大试剂盒 | ThermoFisher Scientific | B40925 |
| 角膜模型 | 血管内皮生长因子C | PEPROTECH | P49767 |
| CAV-1支架结构域(CSD) | Enzo Life Sciences | ALX-153-064-M005 | |
| 硫糖铝 | Sigma | S0652 | |
| 聚甲基丙烯酸羟乙酯 | Sigma | P3932 | |
| 细胞培养 | 胶原蛋白IV包被的培养皿 | -- | -- |
| TEM | JEOL 1400+透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| JEOL 1230电子显微镜 | JEOL | -- | |
| 质谱 | Orbitrap Fusion Tribrid质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 斑马鱼Aibp2功能分析 | 斑马鱼品系:apoa1bp2−/−;fli1a:egfp;Prox1+ LEC计数(TD,7个肌节) 阅读提示:Results部分(图1a, b)和Methods(斑马鱼饲养) |
| mESC-LEC分化 | 分化培养基中BMP4(2 ng/ml)、bFGF(10 ng/ml)浓度;AIBP浓度(100 ng/ml);处理时间(第3天至第7天) 阅读提示:Methods(mLEC分化)和图1c |
| hLEC信号检测 | AIBP(100 ng/ml)和HDL(50 μg/ml)处理时间(4小时);VEGFC刺激浓度(100 ng/ml)和时间(20分钟);Western blot检测pAKT、pERK 阅读提示:Methods(hLEC处理)和图3g, h |
| CAV-1结合与信号 | VEGFR3AAA突变位点(W1106A, F1108A, W1113A);免疫共沉淀和PLA分析 阅读提示:Results(图4)和Methods(VEGFR3AAA突变体构建) |
| 斑马鱼Cav-1功能 | Cas12a/crRNA敲除效率(MslI消化验证);Prox1+ LEC计数(7个肌节,36 hpf) 阅读提示:Results(图5)和Methods(CRISPR/Cas12a敲除) |
| 小鼠角膜淋巴管生成 | VEGFC(800 ng)、AIBP(1600 ng)、APOA1(2400 ng)、CSD(800 ng)剂量;角膜植入10天 阅读提示:Methods(小鼠角膜淋巴管生成)和图6 |
| 小鼠尾部淋巴水肿模型 | 手术切除3 mm皮肤;VEGFC(0.7 µg)和AIBP(5 µg)每周两次腹腔注射;尾巴体积测量 阅读提示:Methods(小鼠尾部淋巴水肿模型)和图7 |