Seneca Valley病毒A颗粒及相关结构状态的冷冻电镜结构

小核糖核酸病毒的细胞入侵需要一系列衣壳蛋白构象变化，最终导致基因组脱壳。对于肠道病毒，受体结合触发从完整（F）衣壳到改变（A）颗粒的转变，然后释放其基因组，最终转变为空（E）颗粒。相反，非肠道病毒，如口蹄疫病毒属、心病毒属或塞内卡谷病毒，通过将衣壳解离成五聚体来释放基因组。虽然先前推测非肠道病毒存在瞬时A颗粒，但从未通过结构方法直接观察。塞内卡谷病毒（SVV）是一种溶瘤小核糖核酸病毒，通过识别肿瘤内皮标记物8（TEM8）作为宿主受体，选择性靶向癌细胞。SVV在酸性pH下解离成五聚体，表明内体的酸性环境可能导致衣壳解体。我们使用冷冻电镜研究了酸性条件下以及生理pH下与TEM8复合的SVV，鉴定了多个脱壳中间体。这些中间体包括改变颗粒、空旋转（ER）颗粒和一系列排出卷曲基因组的开放颗粒。A颗粒是膨胀的，衣壳蛋白之间的相互作用减少，基因组重排，VP1 N末端、VP2 N末端和VP4分辨率较差。ER颗粒的五聚体旋转，颗粒内接触减少，缺少基因组、VP1和VP2 N末端以及VP4。我们的工作提供了对瞬时SVV结构状态的理解，并支持中间体SVV A颗粒的存在。这些发现可能有助于优化SVV用于溶瘤治疗。