抗原制备与纳米抗体文库构建
获得高纯度RSV F蛋白并免疫骆驼以构建纳米抗体文库。
将RSV(A2株)F蛋白基因克隆至PTT5载体,在HEK 293F细胞中瞬时表达,经Ni-NTA纯化获得高纯度F蛋白;以0.5 mg/次免疫单峰骆驼四次,经ELISA检测血清效价;分离PBMC,提取RNA,逆转录为cDNA,PCR扩增VHH片段,克隆至噬菌粒载体,构建纳米抗体噬菌体展示文库。
Generation of nanobodies against the F protein of respiratory syncytial virus and establishment of an indirect immunofluorescence assay.
包含体外细胞模型、动物模型和多种功能验证,如ELISA、Western blot、流式、IHC、IF,以及中和实验。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得高纯度RSV F蛋白并免疫骆驼以构建纳米抗体文库。
将RSV(A2株)F蛋白基因克隆至PTT5载体,在HEK 293F细胞中瞬时表达,经Ni-NTA纯化获得高纯度F蛋白;以0.5 mg/次免疫单峰骆驼四次,经ELISA检测血清效价;分离PBMC,提取RNA,逆转录为cDNA,PCR扩增VHH片段,克隆至噬菌粒载体,构建纳米抗体噬菌体展示文库。
从噬菌体展示文库中筛选出特异性结合RSV F的纳米抗体。
使用F蛋白进行两轮panning,获得克隆库,通过单克隆噬菌体ELISA筛选阳性克隆,测序后选取7个候选纳米抗体;将其构建为Nb-TEV-Fc融合蛋白,经Protein A柱纯化,用SDS-PAGE验证纯度。
评估候选纳米抗体与RSV F的结合亲和力并确定其抗原表位。
通过ELISA测定候选抗体的EC50值;通过竞争性ELISA与已知表位抗体(131-2a、palivizumab、MPE8、101F、hRSV90、MEDI-8897)竞争,确定F-E2结合表位IV。
建立基于F-E2的RSV免疫荧光检测方法并优化其灵敏度和特异性。
使用F-E2-Fc或F-E2-His作为一抗,对感染RSV的Vero细胞进行免疫荧光染色,评估对不同RSV株的检测能力;确定最佳工作浓度(10 ng/mL);用不同呼吸道病毒(RSV、SARS-CoV-2 Omicron JN.1、HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63)验证特异性;通过梯度稀释病毒测试灵敏度。
验证F-E2在RSV中和试验中检测中和抗体的适用性。
以palivizumab和nirsevimab作为阳性对照,用间接免疫荧光法检测其中和RSV A2的效价,计算IC50;并用该方法评估扶正解毒方对RSV的抑制作用。
验证F-E2在多种检测方法中的适用性,包括流式细胞术、Western blot和免疫组织化学。
用F-E2作为一抗进行流式细胞术检测RSV感染细胞;Western blot检测RSV F蛋白线性表位;免疫组化检测RSV感染小鼠肺组织中的F蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Vero细胞 | BDBIO | C5168 |
| DMEM培养基 | VivaCell | C3103-0500 | |
| 胎牛血清 | VivaCell | BL201A | |
| 青霉素-链霉素 | Biosharp | BL505A | |
| 蛋白表达 | 聚乙烯亚胺 | MACKLIN | P924174-1g |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA亲和层析柱 | Bioworks | -- |
| HiTrap Protein A层析柱 | Cytiva | 17040301 | |
| Amicon Ultra超滤离心管 | Merck KGaA | -- | |
| 蛋白浓度测定 | NanoDrop One分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 筛选 | 96孔微孔板 | Beijing Yunpeptide Biotechnology | 100096H |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 |
| HRP标记的山羊抗人IgG (H+L) | Proteintech | SA00001-17 | |
| 超灵敏ECL化学发光液 | P&Q Science Technology | -- | |
| ELISA | 兔抗人IgG-Fc HRP | Sino Biological | 10702-T16-H-100 |
| TMB底物溶液 | Beyotime | P0209 | |
| Multiskan FC酶标仪 | Thermo Scientific | -- | |
| 流式细胞术 | FITC标记的山羊抗人IgG | Proteintech | SA00003-12 |
| CytoFLEX流式细胞仪 | -- | -- | |
| 免疫组化 | 异氟烷 | -- | -- |
| 二抗(Zsbio,#PV-6000) | Zsbio | PV-6000 | |
| DAB显色液 | Zsbio | ZLI-9018 | |
| Nikon Eclipse 50i显微镜 | Nikon | -- | |
| 免疫荧光 | ImageXpress MicroConfocal显微镜 | Moleculardevices | 76177-140 |
| 蛋白纯化 | 微量蛋白纯化系统 | Union-Biotech | UEV |
| 蛋白样品处理 | 2× SDS上样缓冲液 | TANON | 180-8210D |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与病毒扩增 | Vero细胞培养条件(DMEM、10% FBS、1%青霉素-链霉素)、RSV感染后收获时间(5-7天) 阅读提示:Materials and Methods, Cells and viruses |
| 抗原制备 | HEK 293F细胞转染条件(PEI、37°C、120 rpm、5% CO2、培养4天) 阅读提示:Materials and Methods, Construction, expression, and purification of RSV (strain A2) F proteins |
| 纳米抗体文库构建 | 免疫剂量(0.5 mg/次,共4次)、血清效价标准(OD450=0.1时稀释度>10000) 阅读提示:Results, Antigen production, immunizing camel, and building library |
| 间接免疫荧光检测 | F-E2工作浓度(10 ng/mL)、病毒稀释梯度、感染时间(1 h后换液,培养48 h) 阅读提示:Materials and Methods, Indirect immunofluorescence assay; Results, Establishment and optimization of an indirect immunofluorescence assay |