纳米抗体筛选与鉴定
获得靶向HSV-2 gD的特异性中和纳米抗体并评估其中和活性。
免疫骆驼,构建噬菌体展示文库,筛选出13个阳性克隆,表达为Nb-Fc融合蛋白,通过流式细胞术筛选出Nb14和Nb32,并通过ELISA和SPR测定结合动力学和中和活性。
A potent protective bispecific nanobody targeting Herpes simplex virus gD reveals vulnerable epitope for neutralizing.
包含体外中和实验、SPR/ELISA结合实验、结构解析(X射线晶体学)、病毒-无融合实验、细胞间传播实验、多个动物模型(颅内、阴道、角膜)及功能验证与机制验证。
HEK293T细胞 Vero E6细胞 CHO-K1细胞 C57BL/6J小鼠颅内感染模型 BALB/c小鼠阴道感染模型
纳米抗体浓度及剂量:体外中和实验使用Nb14-Fc和Nb32-Fc的浓度范围,体内实验使用1 mg/kg或0.5 mg/kg,需核对具体浓度和给药途径。 细胞系:Vero E6细胞用于PRNT和细胞间传播实验,CHO-K1细胞用于受体结合实验,需核对细胞培养条件。 病毒株:HSV-1 F株、HSV-2 G株、HSV-1 V204G(KOS株)用于不同模型,需核对感染剂量(如107 PFU颅内、5×104 PFU阴道、2×105 PFU角膜)。 动物模型:C57BL/6J雄性和BALB/c雌性小鼠,年龄6-8周,需核对感染后的处理时间(12小时或24小时)和给药途径(腹腔注射)。 抑制剂或处理:如E317抗体用作阳性对照,需核对浓度和来源。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得靶向HSV-2 gD的特异性中和纳米抗体并评估其中和活性。
免疫骆驼,构建噬菌体展示文库,筛选出13个阳性克隆,表达为Nb-Fc融合蛋白,通过流式细胞术筛选出Nb14和Nb32,并通过ELISA和SPR测定结合动力学和中和活性。
揭示Nb14和Nb32的结合表位及中和机制的结构基础。
通过X射线晶体学解析Nb14/HSV-2 gD和Nb32/HSV-2 gD复合物结构,分析相互作用残基和表位,比较与已知受体及抗体表位的重叠。
验证Nb32阻断gD-Nectin-1相互作用,Nb14不阻断受体结合而影响gD-gH/gL相互作用。
通过SPR和细胞ELISA竞争实验检测抗体对受体结合的竞争,在CHO-K1细胞上表达单一受体进行中和实验,通过病毒-无融合实验验证Nb14抑制gD-gH/gL相互作用。
构建双特异性纳米抗体Nb14-32-Fc并评价其结合亲和力、中和活性及作用模式。
将Nb14与Nb32用(GGGGS)5连接并融合人IgG1 Fc,表达纯化后通过SPR测定亲和力,PRNT测定中和活性,并评估附着前/后中和能力及抑制细胞间传播。
在多种小鼠模型中评估Nb14-32-Fc对HSV-1和HSV-2感染的保护效果。
建立雄性C57BL/6J小鼠颅内感染HSV-1 F株模型、雌性BALB/c小鼠阴道感染HSV-2 G株模型以及角膜感染V204G模型,腹腔注射抗体后监测生存率、体重、病毒载量和病理变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | KeyGEN | -- |
| 胎牛血清 | KeyGEN | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Biosharp | BL505A | |
| 蛋白表达 | 聚乙烯亚胺 | Polyscience | 23966 |
| 蛋白纯化 | 镍柱 | GE Healthcare | -- |
| 蛋白A柱 | Genebiol | -- | |
| ELISA | TMB底物 | Beyotime | -- |
| SPR | 蛋白A芯片 | Cytiva | -- |
| CM5芯片 | Cytiva | -- | |
| 流式细胞术 | CellTracker Blue染料 | MedChemexpress | -- |
| 结晶 | Superdex 200凝胶过滤柱 | GE Healthcare | -- |
| 动物实验 | 醋酸甲羟孕酮 | -- | -- |
| qPCR | TRNzol Universal试剂 | Tiangen | -- |
| SYBR Premix Ex Taq II | Takara | -- | |
| PrimeScript RT试剂盒(带gDNA Eraser) | Takara | -- | |
| 抗His标签抗体 | Sino Biological | 105327-MM02T-H | |
| Western blot | HSV-1/2 ICP5抗体 | Santa Cruz | sc-56989 |
| Alexa Fluor 488标记驴抗小鼠IgG | Jackson ImmunoResearch | AB_2340846 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与病毒扩增 | 细胞系(HEK293T, Vero E6, CHO-K1, Expi293F)及培养条件(培养基、血清浓度)、病毒株(HSV-1 F株、HSV-2 G株、V204G)及滴度测定方法。 阅读提示:Methods: Cells and viruses |
| 纳米抗体筛选与表达 | 免疫方案(抗原剂量、次数)、噬菌体文库构建、筛选轮数、Nb-Fc表达载体及纯化方法。 阅读提示:Methods: Phage display, Protein expression and purification |
| 结合动力学测定 | SPR实验条件:固定化(蛋白A芯片或CM5芯片)、分析物浓度、流速、再生条件,以及ELISA的包被浓度、封闭液、抗体稀释倍数。 阅读提示:Methods: Surface Plasmon Resonance (SPR), Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) |
| 中和活性测定 | PRNT实验:Vero细胞密度、病毒量(75 PFU)、抗体浓度范围、孵育时间、覆盖物(甲基纤维素)、染色方法。 阅读提示:Methods: Plaque reduction neutralization test (PRNT) |
| 结构解析 | 蛋白复合物制备(摩尔比、孵育条件)、结晶条件(沉淀剂、pH)、衍射数据收集波长和束线。 阅读提示:Methods: Crystallization and data collection, Structural determination |
| 体内药效评估 | 动物品系、性别、年龄、感染途径和剂量、给药时间、剂量(1 mg/kg或0.5 mg/kg)、观察指标(生存率、体重、病毒载量、病理)。 阅读提示:Methods: Animal study, Figures 7 and 8 |