动物分组与TFQA给药
评估TFQA在衰老模型小鼠中的抗衰老效果。
6月龄雄性SAMP8小鼠(n=9)和SAMR1小鼠(n=9)分为三组:SAMR1水对照组、SAMP8水对照组、SAMP8 TFQA组(1 mg/kg,口服灌胃,每日一次,持续37天)。
A novel synthetic 3,4,5-tri-feruloylquinic acid enhances learning and memory via neurotrophin signaling in an aging model senescence-accelerated prone 8 mice.
研究包含体内动物模型(SAMP8小鼠、BDNF-AkaLuc小鼠)、体外细胞模型(SH-SY5Y)、行为学测试、转录组分析、蛋白质检测及结合实验等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
SAMP8小鼠衰老模型 SAMR1小鼠正常衰老对照 BDNF-AkaLuc报告基因小鼠 SH-SY5Y人神经母细胞瘤细胞系
TFQA给药剂量为1 mg/kg,口服灌胃,持续37天 BDNF-AkaLuc小鼠使用更高剂量10 mg/kg TFQA以提高检测灵敏度 MWM实验各组样本量n=6,ELISA实验样本量n=4,PCR实验n=3 使用10 µM ANA-12作为TrkB拮抗剂处理SH-SY5Y细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估TFQA在衰老模型小鼠中的抗衰老效果。
6月龄雄性SAMP8小鼠(n=9)和SAMR1小鼠(n=9)分为三组:SAMR1水对照组、SAMP8水对照组、SAMP8 TFQA组(1 mg/kg,口服灌胃,每日一次,持续37天)。
评估TFQA对SAMP8小鼠空间学习和记忆能力的影响。
进行为期7天的定位航行试验和探针试验,记录逃逸潜伏期、目标象限停留时间、穿越平台次数、游泳距离和速度。
探究TFQA影响衰老小鼠认知的分子机制。
提取海马RNA,进行DNA微阵列分析,鉴定差异表达基因,并进行GO、KEGG和PPI分析。
验证TFQA对神经递质分泌和BDNF表达的影响。
利用ELISA检测大脑皮层中血清素、去甲肾上腺素、多巴胺和BDNF水平,利用qPCR检测皮层和海马中Bdnf mRNA表达。
在活体水平验证TFQA对BDNF表达的促进作用。
给BDNF-AkaLuc小鼠单次口服TFQA(10 mg/kg),通过AkaLumine-AkaLuc生物发光成像监测大脑中BDNF表达。
验证TFQA与BDNF受体TrkB的结合亲和力。
使用Biacore X100系统,将人重组TrkB蛋白固定在传感器芯片上,注入不同浓度TFQA(31.25-500 µM),测定结合动力学常数。
在体外验证TFQA对BDNF表达的影响及TrkB在其中的作用。
用10-40 µM TFQA处理SH-SY5Y细胞24或48小时,检测细胞活性;用10 µM TFQA和/或10 µM ANA-12(TrkB拮抗剂)处理24小时,检测BDNF mRNA表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物给药 | 3,4,5-三阿魏酰奎尼酸 | -- | -- |
| RNA提取 | ISOGEN试剂盒 | Nippon Gene | -- |
| RNA质量检测 | NanoDrop One/OneC微量分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解缓冲液 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| DNA微阵列分析 | GeneChip Whole Transcript (WT) PLUS微阵列试剂和试剂盒 | ThermoFisher Scientific | -- |
| GeneChip Clariom S阵列(小鼠) | ThermoFisher Scientific | -- | |
| GeneAtlas成像系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 转录组分析控制台(TAC)软件,版本4.0.2 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| ELISA | 多巴胺ELISA试剂盒 | ImmuSmol | BA-E-5300R |
| 血清素ELISA试剂盒 | ImmuSmol | BA-E-5900R | |
| BDNF ELISA试剂盒 | Proteintech Group Inc. | KE00096 | |
| Biacore结合实验 | 人重组TrkB蛋白 | Sino Biological Inc. | 10,047-H02H |
| 胺偶联试剂盒 | Cytiva | -- | |
| Biacore X100系统 | Cytiva | -- | |
| 动物实验 | AkaLumine底物 | Fujifilm Wako | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| Ham's F-12培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | FUJIFILM Wako | -- | |
| MEM非必需氨基酸 | FUJIFILM Wako | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞处理 | OPTI-MEM培养基 | Gibco | -- |
| ANA-12(TrkB拮抗剂) | Selleck Biotech | -- | |
| MTT实验 | MTT溶液 | DOJINDO | -- |
| 磷酸盐缓冲液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 十二烷基硫酸钠 | Nippon Gene | -- | |
| 酶标仪 | Dainippon Sumitomo Pharma | -- | |
| RT-qPCR | SuperScript III逆转录试剂盒 | Invitrogen | -- |
| Gapdh TaqMan探针 | Applied Biosystems | Mm99999915_g1 | |
| Tnf TaqMan探针 | Applied Biosystems | Mm00443258_m1 | |
| Bdnf TaqMan探针 | Applied Biosystems | Mm04230607_s1 | |
| GAPDH TaqMan探针 | Applied Biosystems | Hs02786624_g1 | |
| BDNF TaqMan探针 | Applied Biosystems | Hs02718934_s1 | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 6软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物分组与给药 | 小鼠品系、性别、年龄、样本量、分组方式、TFQA剂量、给药途径、给药周期 阅读提示:Methods - Animal grouping and treatment |
| Morris水迷宫测试 | 水池尺寸、水温、平台位置和大小、训练天数、每天试验次数、探针试验持续时间、各组样本量 阅读提示:Methods - Morris water maze (MWM) test; Figure 2 legend |
| 海马转录组分析 | 样本量、RNA起始量、微阵列芯片型号、差异表达基因筛选阈值、分析软件和算法 阅读提示:Methods - DNA microarray analysis; Figure 3 legend |
| 神经递质和BDNF检测 | 检测组织(皮层、海马、血清)、ELISA试剂盒货号、qPCR探针货号、样本量 阅读提示:Methods - ELISA; Quantitative real-time PCR analysis; Figures 6, 8 legends |
| BDNF-AkaLuc小鼠成像 | 小鼠品系、TFQA剂量、给药方式、成像时间点、样本量 阅读提示:Methods - BDNF-AkaLuc mice; AkaLumine-AkaLuc bioluminescence imaging; Figure 8G legend |
| TrkB结合实验 | TrkB蛋白来源和浓度、TFQA浓度范围、运行缓冲液、流速、接触和解离时间 阅读提示:Methods - Biacore assay; Table 1 |
| SH-SY5Y细胞实验 | 细胞系来源、培养条件、TFQA浓度和处理时间、ANA-12浓度、MTT实验细节、PCR内参基因 阅读提示:Methods - SH-SY5Y cell culture; SH-SY5Y cell treatment; MTT assay; Quantitative real-time PCR analysis |