评估抗体结合特异性
验证三种抗体与对应受体结合的特异性
在阳性BXPC3细胞和阴性对照细胞(HEK293T和JIMT-1)上进行SPRM结合实验,并通过荧光显微镜进行正交验证。
Surface plasmon resonance microscopy reveals N-glycosylation driven modulation of affinity and avidity of ErbB receptors in whole single pancreatic cancer cells.
本研究包含体外细胞模型(BXPC3、阴性对照)上的SPRM和荧光显微镜验证,结合去糖基化处理及机制分析,属于多层级功能验证。
BXPC3胰腺癌细胞 HEK293T细胞(HER1和HER3阴性对照) JIMT-1细胞(HER2阴性对照)
抗体浓度梯度:HER1和HER3为10 nM,HER2为25 nM,7次注射,每次暴露4.5分钟 去糖基化处理:PNGase F 2000 U/mL处理固定细胞24小时 受体表达水平:荧光显微镜定量HER1约为HER2和HER3的2.4倍 SPRM数据拟合:1:2异质动力学模型,2400个ROI
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证三种抗体与对应受体结合的特异性
在阳性BXPC3细胞和阴性对照细胞(HEK293T和JIMT-1)上进行SPRM结合实验,并通过荧光显微镜进行正交验证。
量化三种抗体在天然BXPC3细胞上的结合动力学参数
对BXPC3细胞进行抗体浓度梯度注射,使用SPRM记录结合响应,并拟合1:2模型,生成等亲和力图和KD直方图。
去除BXPC3细胞表面N-糖基化,以研究其对结合的影响
固定细胞后用PNGase F处理,并通过Con A染色验证去糖基化效率。
比较去糖基化后三种抗体结合动力学的变化
对去糖基化的BXPC3细胞进行相同的SPRM测量,并分析动力学参数及亲合力/亲和力分布。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| SPRM测量 | 金膜传感器上的BI细胞室套件 | Biosensing Instrument Inc. | 104-00228 |
| SPRm200表面等离子体共振显微镜 | Biosensing Instrument Inc. | -- | |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶-EDTA溶液,1X | ATCC | 30-2101 |
| 去糖基化处理 | PNGase F酶 | New England Biolabs (NEB) | P0709S |
| 荧光分析 | 人ErbB3/Her3 Alexa Fluor® 488偶联抗体 | R&D Systems | FAB3481G-100 |
| 人EGFR(研究级西妥昔单抗生物类似物)Alexa Fluor® 488偶联抗体 | R&D Systems | FAB9577G-100 | |
| 抗HER2/ERBB2抗体(FITC) | Sino Biological US Inc. | 10004-MM07T-F | |
| 细胞培养 | Eagle's最低必需培养基 | ATCC | 30-2003 |
| 细胞活力检测 | BioRad TC20细胞计数器 | BioRad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与固定 | 细胞系BXPC3;接种密度约15K细胞;培养时间72小时;固定液4%多聚甲醛,处理10分钟 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and cell seeding |
| SPRM动力学测量 | 抗体浓度梯度:抗HER1和抗HER3最高10 nM,抗HER2最高25 nM;7次注射,暴露4.5分钟,冲洗3.5分钟 阅读提示:Materials and methods: Experimental method and data analysis |
| 去糖基化处理 | PNGase F浓度2000 U/mL,处理时间24小时,温度37°C 阅读提示:Materials and methods: Deglycosylation |
| 数据拟合与统计分析 | SPRM数据拟合模型1:2异质动力学模型;ROI数量2400;统计方法One-way ANOVA 阅读提示:Materials and methods: Experimental method and data analysis, Statistical analysis |