临床样本分析
检测AIM2在OSCC中的表达及其预后价值。
使用TCGA和GEO数据库及RT-PCR分析AIM2表达,并进行Kaplan-Meier生存分析。
AIM2 promotes irradiation resistance, migration ability and PD-L1 expression through STAT1/NF-κB activation in oral squamous cell carcinoma.
包含临床样本分析、细胞功能实验、机制验证和体内外模型,涉及细胞系、患者样本和数据库分析。
SAS细胞系 HSC4细胞系
AIM2表达水平 放射剂量4Gy IL-1β浓度10μg/ml NF-κB抑制剂SN50浓度 PD-L1启动子突变位点
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测AIM2在OSCC中的表达及其预后价值。
使用TCGA和GEO数据库及RT-PCR分析AIM2表达,并进行Kaplan-Meier生存分析。
评估AIM2对放射抗性和迁移能力的影响。
通过集落形成实验和trans-well迁移实验检测AIM2敲低和过表达的效果。
验证AIM2通过STAT1/NF-κB调控PD-L1表达。
Western blot和报告基因实验检测STAT1/NF-κB活性和PD-L1启动子活性。
未明确说明。
未明确说明。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Eagle's最小必需培养基 | Gibco | -- |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 放射处理 | Digital M Mevatron加速器 | Siemens Medical Systems | -- |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| 迁移实验 | Boyden小室实验 | NeuroProbe | -- |
| 抗体处理 | 抗IL-1β抗体 | SAB | 41,059 |
| 非免疫对照抗体 | Sino Biological | CR1 | |
| 质粒构建 | AIM2 cDNA克隆 | Sino Biological | HG11654-UT |
| pLAS3w/puro载体 | -- | -- | |
| pLKO.1/puro载体 | -- | -- | |
| 病毒感染 | 聚凝胺 | Santa Cruz | -- |
| RT-PCR | TRIzol提取试剂盒 | Invitrogen | -- |
| M-MLV逆转录酶 | Invitrogen | -- | |
| Taq聚合酶 | Protech | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 抗PD-L1抗体 | GeneTex | GTX635975 | |
| 抗磷酸化NF-κB抗体 | Cell Signaling | 3033 | |
| 抗NF-κB抗体 | Cell Signaling | 6956 | |
| 抗磷酸化STAT1抗体 | Cell Signaling | 9167 | |
| 抗STAT1抗体 | Cell Signaling | 9172 | |
| 抗GAPDH抗体 | AbFrontier | PA0212 | |
| ELISA | Quantikine ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| 报告基因实验 | pGL4[Luc2P/GAS-RE/Hygro]载体 | Promega | -- |
| pGL4.32[luc2P/NF-kB-RE/Hygro]载体 | Promega | -- | |
| p4.74-RLuc载体 | Promega | -- | |
| Dual-Glo荧光素酶检测试剂盒 | Promega | -- | |
| pfu DNA聚合酶试剂盒 | Stratagene | -- | |
| Dpn1内切酶 | New England BioLabs | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 流式细胞术 | Brilliant Violet 605抗人CD274抗体 | Biolegend | 329,706 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、抗生素浓度、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods, Cell culture |
| 放射处理 | 辐照剂量、剂量率、辐照设备、细胞融合度 阅读提示:Materials and Methods, Irradiation exposure |
| 集落形成实验 | 细胞接种数量、辐照剂量、培养时间、染色方法 阅读提示:Materials and Methods, Colony formation assay |
| 迁移实验 | 细胞数量、处理条件、迁移时间 阅读提示:Materials and Methods, Cell migration assay |
| 蛋白表达检测 | 抗体及稀释度、细胞裂解量、封闭条件 阅读提示:Materials and Methods, Western blot and dot blot assays |