开发DISP裂解缺陷小鼠模型并表征表型
确定DISP裂解对神经发育的必要性。
利用CRISPR-Cas9生成Disp1CS和Disp1INDEL等位基因,观察胚胎和出生后小鼠的生长、存活、脑部形态和运动行为。
Cytoneme signaling provides essential contributions to mammalian tissue patterning.
包含体外细胞实验、类器官球体、小鼠遗传模型和体内影像学等多层级验证,并明确功能与机制验证。
小鼠神经管 DispKO小鼠胚胎成纤维细胞 IMCD3多细胞球体 MDCK细胞单层
Disp1CS/INDEL小鼠的生存率和神经管模式 SHH-LightII报告基因实验验证SHH信号活性 Ca2+通量实验验证细胞丝足介导的信号传递 体内细胞丝足成像(SHH-Cre;mT/mG和ShhGFP) Myo10m1J/m1J小鼠的细胞丝足长度和密度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定DISP裂解对神经发育的必要性。
利用CRISPR-Cas9生成Disp1CS和Disp1INDEL等位基因,观察胚胎和出生后小鼠的生长、存活、脑部形态和运动行为。
探究DISP裂解是否影响SHH刺激的内吞循环。
在DispKO MEF和IMCD3球体细胞中表达DISPWT或DISPCS,并使用共定位分析、生物素化实验和Dronpa3标记追踪内化动力学。
验证DISP裂解是否促进SHH进入细胞丝足并增强信号传递。
在DispKO MEF中表达DISPWT或DISPCS,测量细胞丝足中SHH和DISP的荧光强度比,并通过SHH LightII报告基因和钙通量实验评估信号活性。
证明细胞丝足携带SHH并在体内存在于神经管中。
开发组织固定和染色方案,使用SHH-Cre;mT/mG小鼠标记SHH表达细胞,通过共聚焦、SEM和SBF-SEM观察细胞丝足并检测SHH定位。
确定MYO10是否调控细胞丝足形成并在体内影响SHH和WNT信号。
使用Myo10m1J/m1J小鼠,通过SBF-SEM定量细胞丝足长度和密度,通过免疫染色和RNAseq分析信号通路变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫染色 | 抗GFP抗体 | Aves | GFP-1020 |
| 抗Pax6抗体 | DSHB | pax6 | |
| 抗Olig2抗体 | Millipore | AB9610 | |
| 抗FOXA2抗体 | Abcam | ab108422 | |
| 抗Nkx2.2抗体 | Novus | NBP1-82554 | |
| 抗SHH抗体(上清) | DSHB | 5E1 | |
| 抗ARL13B抗体 | Proteintech | 17711-1-AP | |
| 抗SHH抗体(H160) | Santa Cruz Biotechnology | sc-9024 | |
| 抗HA抗体(克隆3F10) | Roche | 11867423001 | |
| 抗磷酸化Smad1/5/9抗体(D5B10) | Cell Signaling Technology | 13820 | |
| 抗OLIG3抗体(JE56-40) | Thermo Fisher Scientific | MA5-44904 | |
| 抗V5标签抗体(SV5-Pk1) | Thermo Fisher Scientific | R960-25 | |
| 抗Rab5抗体(E6N8S) | Cell Signaling Technology | 46449 | |
| 抗Rab7抗体(D95F2) | Cell Signaling Technology | 9367 | |
| 抗Rab11抗体(D4F5) | Cell Signaling Technology | 5589 | |
| 抗Rab4抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA3-912 | |
| 抗Caveolin-1抗体(D46G3) | Cell Signaling Technology | 3267 | |
| 抗网格蛋白重链抗体(D3C6) | Cell Signaling Technology | 4796 | |
| 抗α-衔接蛋白抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA3-061 | |
| 抗SHH抗体(C9C5) | Cell Signaling Technology | 2207 | |
| 抗KIF5B抗体 | Abcam | ab167429 | |
| 抗α-微管蛋白抗体(DM1A) | Cell Signaling Technology | 3873 | |
| 抗β2-衔接蛋白抗体 | Bethyl | A304-718A | |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | |
| ActinRed 555 ReadyProbes试剂 | Thermo Fisher Scientific | R37112 | |
| 细胞培养 | 多西环素盐酸盐 | Millipore Sigma | D5207 |
| 细胞表面生物素化 | EZ-Link Sulfo-NHS-生物素 | Thermo Fisher Scientific | 21217 |
| RNAscope | RNAscope探针-Mm-Gli1 | ACD | 311001 |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G PLUS-琼脂糖 | Santa Cruz | sc-2003 |
| 原位杂交 | DIG RNA标记试剂盒(SP6/T7) | Roche | 11175025910 |
| Western blot | ECL Prime Western印迹系统 | Millipore Sigma | GERPN2232 |
| RNAscope | RNAscope多重荧光试剂盒v2 | ACD | 323100 |
| RNA提取 | RNeasy Micro试剂盒 | Qiagen | 74004 |
| RNA测序 | TruSeq RNA文库制备试剂盒v2 | Illumina | RS-122-2001 |
| 荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1960 |
| 细胞培养 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000001 |
| Pitstop 2 | Abcam | ab120687 | |
| 免疫沉淀 | EZview红色抗HA亲和凝胶 | Millipore Sigma | E6779 |
| 组织处理 | Tissue-Plus O.C.T.化合物 | Thermo Fisher Scientific | 23730571 |
| UltraPure低熔点琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | 16520050 | |
| 免疫染色 | ProLong Diamond抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | P36961 |
| ProLong Glass抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | P36980 | |
| ProLong Gold抗淬灭封片剂(含DAPI) | Thermo Fisher Scientific | P36941 | |
| Fluoromount-G封片剂 | Thermo Fisher Scientific | 00-4958-02 | |
| 正常山羊血清 | Jackson ImmunoResearch Labs | 005-000-121 | |
| 细胞培养 | HBSS,含钙、镁,无酚红 | Thermo Fisher Scientific | 14025076 |
| Dulbecco磷酸盐缓冲液,10X,含钙和镁 | Corning | 20-030-CV | |
| mIMCD3细胞 | ATCC | CRL-2123 | |
| MDCK细胞 | ATCC | CCL-34 | |
| NIH3T3细胞 | ATCC | CRL-1658 | |
| Light II细胞 | ATCC | CVCL_2721 | |
| DispKO小鼠胚胎成纤维细胞 | -- | -- | |
| Myo10敲除小鼠胚胎成纤维细胞 | -- | -- | |
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | JAX | 000664 |
| B6.129(Cg)-Gt(ROSA)26Sortm4(ACTB-tdTomato,-EGFP)Luo/J (mT/mG)小鼠 | JAX | 007676 | |
| B6.Cg-Shhtm1(EGFP/cre)Cjt/J小鼠 | JAX | 005622 | |
| B6.129X1(Cg)-Shhtm6Amc/J小鼠 | JAX | 008466 | |
| B6.Cg-Myo10m1J/GrsrJ小鼠 | JAX | 024583 | |
| C57BL/6-Disp1INDEL/+小鼠 | -- | -- | |
| C57BL/6-Disp1CS/+小鼠 | -- | -- | |
| 分子克隆 | pcDNA3.1(+) | Thermo Fisher Scientific | V79020 |
| pCDNA3-EGFP | Addgene | 13031 | |
| pCMV-mCherry-Membrane | Addgene | 55779 | |
| pCMV-R-GECO1 | Addgene | 32444 | |
| pCMV-mCherry2 | Addgene | 54517 | |
| pCDNA3.1-mSHH-FL | Stewart et al. | -- | |
| pCDNA3.1-mSHH-FL-EGFP | Hall et al. | -- | |
| pCDNA3.1-V5-DISPWT-HA | Addgene | 126410 | |
| pCDNA3.1-V5-DISPCS-HA | Stewart et al. | -- | |
| pCDNA3.1-V5-DISPΔC-HA | This paper | -- | |
| pCDNA3.1-V5-DISP4xAA-HA | This paper | -- | |
| pCDNA3.1-V5-DISPWT-Dronpa3-HA | This paper | -- | |
| pCDNA3.1-V5-DISPCS-Dronpa3-HA | This paper | -- | |
| pCDNA3.1-DISP ΔC-Dronpa3-HA | This paper | -- | |
| Dronpa3-N1 | Addgene | 54682 | |
| 细胞培养 | pLVX-Tet-On 3G | Takara | 631187 |
| 分子克隆 | pCMV3-hBMP2-GFPSpark | Sino Biological | HG10426-ACG |
| pCMV3-hBMP4-OFPSpark | Sino Biological | HG10609-ACR | |
| pCMV3-hBMP7-GFPSpark | Sino Biological | HG10083-ACG | |
| pCMV3-hWNT1-GFPSpark | Sino Biological | HG10721-ACG | |
| 成像 | TCS SP8 STED 3X共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| A1R共聚焦显微镜 | Nikon | -- | |
| Teneo扫描电子显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Teneo VolumeScope扫描电子显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Bruker Clinscan 7T磁共振成像系统 | Bruker | -- | |
| Siemens Inveon PET/CT系统 | Siemens | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | Disp1CS/INDEL和Myo10m1J/m1J小鼠的遗传背景、基因型鉴定方法及胚胎分期 阅读提示:Methods: Disp mice generation, Mice |
| 细胞培养 | 细胞系(IMCD3、MDCK、DispKO MEF等)的来源、培养条件、转染试剂及筛选方法 阅读提示:Methods: Cell lines and culture conditions |
| 体内细胞丝足成像 | 胚胎固定方案、抗体浓度、孵育时间、成像参数(如共聚焦显微镜型号、扫描模式) 阅读提示:Methods: Cytoneme preservation and imaging in mouse embryos |
| 细胞丝足定量分析 | 细胞丝足定义(直径<200nm,长度≥10μm)、计数方法、荧光强度比计算 阅读提示:Methods: Cytoneme preservation and analysis in cell culture |
| 信号活性检测 | SHH Light II报告基因实验中的共培养方式、细胞密度、处理时间;钙通量实验中R-GECO细胞比例、成像时间 阅读提示:Methods: Cytoneme-based SHH signal activation, Luciferase reporter assays |
| 统计学分析 | 统计检验方法、样本量、重复数、显著性阈值 阅读提示:Methods: QUANTIFICATION AND STATISTICAL ANALYSIS |