评估ART对黑色素瘤细胞增殖和铁死亡的影响
确定ART是否抑制黑色素瘤细胞增殖并诱导铁死亡
用不同浓度ART处理B16F10和SK-MEL-28细胞,检测细胞活力、形态变化、克隆形成、细胞周期、ROS、脂质过氧化和MDA水平,并用RNA-seq和GSEA分析转录组变化。
Artesunate induces melanoma cell ferroptosis and augments antitumor immunity through targeting Ido1.
包含体外细胞实验、体内小鼠模型、分子机制验证(如SPR、CETSA、CHIP)及功能验证(如基因敲除/过表达、T细胞杀伤实验)。
B16F10细胞 SK-MEL-28细胞 B16F10移植瘤小鼠模型
ART浓度范围0-160 µM处理黑色素瘤细胞24小时 C57小鼠皮下注射1×10^5 B16F10细胞,肿瘤体积达到100 mm3时分为对照组和ART处理组(100或200 mg/kg/天) 使用CRISPR/Cas9敲除Hmox1、Hic1、Ido1 CD8+ T细胞用抗CD3/CD28和IL-2激活 CD8+ T细胞耗竭实验中,抗CD8抗体在ART前13天和6天腹腔注射
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定ART是否抑制黑色素瘤细胞增殖并诱导铁死亡
用不同浓度ART处理B16F10和SK-MEL-28细胞,检测细胞活力、形态变化、克隆形成、细胞周期、ROS、脂质过氧化和MDA水平,并用RNA-seq和GSEA分析转录组变化。
验证Hmox1是否为ART诱导铁死亡的关键调控因子
通过RNA-seq和FerrDb数据库分析筛选Hmox1,并用CRISPR/Cas9敲除和过表达Hmox1,检测铁死亡指标变化。
揭示ART如何调控Hmox1转录并直接结合Ido1
预测和验证Ido1为ART的直接靶点,通过分子对接、SPR、CETSA验证结合,并检测ART对Ido1、Hic1和Hmox1表达的影响,用敲除/过表达Ido1和Hic1验证调控关系及Hmox1启动子活性。
确定ART是否增强CD8+ T细胞效应功能及其机制
分离小鼠脾脏CD8+ T细胞,用ART处理后检测激活标志物、细胞因子、PD1和NFATc1表达,并通过RNA-seq分析转录组变化,用共培养实验评估其对肿瘤细胞杀伤的影响。
验证ART在体内是否抑制肿瘤生长并诱导肿瘤细胞铁死亡
建立B16F10皮下移植瘤模型,给予不同剂量ART,测量肿瘤体积和体重,肿瘤组织进行HE、免疫组化和BODIPY染色。
验证ART在体内是否增强CD8+ T细胞免疫应答并发挥协同抗肿瘤作用
分析肿瘤浸润CD8+ T细胞的功能标志物,通过CD8+ T细胞耗竭实验验证其在ART抗肿瘤效果中的作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 青蒿琥酯 | MedChemExpress | HY-N0193 |
| 铁死亡抑制剂处理 | Ferrostatin-1 | Selleck | S7243 |
| 铁死亡诱导剂处理 | Erastin | Selleck | S7242 |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11 | Thermo Fisher Scientific | D3861 |
| 铁离子检测 | FerroOrange | DOJINDO | F374 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0039 |
| 细胞裂解 | 细胞裂解液 | Beyotime | P0013 |
| Western blot | Clarity Western ECL底物 | Bio-Rad | 1705061 |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Takara | 9109 |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime | S0033M |
| MDA检测 | 丙二醛检测试剂盒 | Beyotime | S0131M |
| 实时荧光定量PCR | SYBR Premix Taq | Applied Biosystems | -- |
| CRISPR/Cas9基因敲除 | Lenti-V2 CRISPR/Cas9载体 | Addgene | 52961 |
| 转染 | Lipo8000转染试剂 | Beyotime | C0533 |
| 双荧光素酶报告基因 | pGL6-TA载体 | Beyotime | D2105 |
| 双荧光素酶检测系统 | Beyotime | RG017 | |
| 海肾荧光素酶报告质粒 | -- | RG010M | |
| CHIP | CHIP试剂盒 | Beyotime | P2083S |
| SPR | CM5传感芯片 | Cytiva | -- |
| 小鼠Ido1蛋白 | Sino Biological | 57213-M08E | |
| CD8+ T细胞耗竭 | InVivoMab抗小鼠CD8α抗体 | BioXCell | BE0117 |
| 淋巴细胞分离 | Percoll分离液 | Cytiva | 17089109 |
| 红细胞裂解 | 红细胞裂解液 | Beyotime | C3702 |
| 细胞因子分泌抑制 | 布雷菲德菌素A | Invitrogen | 00-4506-51 |
| 莫能菌素 | Invitrogen | 00-4505-51 | |
| CD8+ T细胞分选 | EasySep小鼠CD8+ T细胞分选试剂盒 | Stemcell | 19853 |
| T细胞激活 | 抗CD3单克隆抗体 | eBioscience | 16-0032-86 |
| 抗CD28单克隆抗体 | eBioscience | 16-0281-86 | |
| 小鼠白细胞介素2 | PEPROTech | 212-12 | |
| ELISA | 色氨酸ELISA试剂盒 | Meimian | MM-0756M1 |
| 犬尿氨酸ELISA试剂盒 | FineTest | EM1862 | |
| TNFα ELISA试剂盒 | Boster | EK0527 | |
| IFNγ ELISA试剂盒 | Boster | EK0375 | |
| 流式细胞术 | BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(ATCC),培养基(DMEM+10%FBS+双抗),培养条件(37°C、5% CO2) 阅读提示:Methods: Cell culture |
| 药物处理 | ART浓度(0-160 µM),处理时间(24小时) 阅读提示:Methods: Cell viability assay; Figure 1B |
| 铁死亡检测 | FerroOrange浓度(1 µM),孵育时间(30分钟),DCFH-DA浓度(10 µM),孵育时间(30分钟),C11-BODIPY染色时间(30分钟),MDA检测试剂盒 阅读提示:Methods: Detection of intracellular ferrous iron content, ROS assay, Determination of lipid peroxidation, Measurement of MDA |
| 基因编辑 | sgRNA序列(补充表2),转染试剂Lipo8000,筛选单克隆,验证敲除效率(Western blot) 阅读提示:Methods: CRISPR/Cas9 mediated gene knockout |
| 分子互作 | SPR:Ido1蛋白浓度(20 µg/mL),ART浓度梯度(50, 25, 12.5, 6.25, 3.125 µM),CETSA温度梯度(40-56°C),分子对接软件(AutoDock Vina) 阅读提示:Methods: Surface plasmon resonance assay, Cellular thermal shift assay, Molecular docking |
| 小鼠肿瘤模型 | 小鼠品系和性别(6周龄雌性C57),皮下注射细胞数(1×10^5),给药剂量(100和200 mg/kg/day),给药方式(腹腔注射),肿瘤体积计算方法(length×width^2/2),处理时间(9天) 阅读提示:Methods: Mouse tumor models; Figure 5A-E |
| CD8+ T细胞实验 | CD8+ T细胞分离试剂盒,激活条件(抗CD3 2.5 µg/mL,抗CD28 1 µg/mL,IL-2 200 U/mL),ART浓度(0-20 µM),处理时间(3天) 阅读提示:Methods: Isolation and activation of splenic CD8+ T cells |
| CD8+ T细胞耗竭 | 抗CD8抗体(200 µg/只),给药时间(ART前13天和6天),给药途径(腹腔注射) 阅读提示:Methods: Mouse tumor models; Figure 6G |