评估ACE2对TMPRSS2酶活性的影响
确定ACE2是否能改变TMPRSS2的蛋白水解活性。
使用重组人TMPRSS2和ACE2蛋白,在荧光底物存在下进行活性测定,并在不同温度(RT和37°C)及有无DX600(ACE2抑制剂)条件下监测荧光变化。
ACE2 acts as a novel regulator of TMPRSS2-catalyzed proteolytic activation of influenza A virus in airway cells.
包含蛋白酶活性动力学测定、PPMO敲低实验、病毒复制动力学、蛋白切割分析、免疫共沉淀及ACE2缺失细胞回补实验,涵盖体外酶活和细胞模型,并有机制验证。
Calu-3人气道上皮细胞 Caco-2人结直肠腺癌细胞 HEK293人胚肾细胞 表达TMPRSS2和ACE2的重组蛋白体系
ACE2敲低PPMO的种类和浓度(25 µM,处理24小时) 感染病毒株(H1N1pdm、H3N2、H7N7、MERS-CoV)及MOI(低MOI 0.001和MOI 1) TMPRSS2和ACE2重组蛋白浓度(TMPRSS2 0.12 nM,ACE2 0.8 µU) ACE2抑制剂DX600使用浓度(10 µM) 病毒滴度检测方法(空斑法和TCID50)及时间点(24、48、72小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定ACE2是否能改变TMPRSS2的蛋白水解活性。
使用重组人TMPRSS2和ACE2蛋白,在荧光底物存在下进行活性测定,并在不同温度(RT和37°C)及有无DX600(ACE2抑制剂)条件下监测荧光变化。
验证在细胞水平ACE2是否参与TMPRSS2介导的IAV激活。
使用PPMO特异性敲低Calu-3细胞中ACE2表达,感染H1N1pdm或H3N2(低MOI用于生长动力学,MOI 1用于HA切割)后,通过空斑实验分析病毒滴度,并通过western blot检测HA切割水平。同时使用H7N7(多碱性切割位点)作为对照。
验证ACE2缺乏时,补充ACE2是否能增强病毒复制。
在Caco-2细胞(不表达ACE2)中瞬时转染ACE2质粒或空载体,感染H1N1pdm(MOI 0.001)后,通过空斑实验测定病毒滴度,并通过western blot检测HA切割。
确定ACE2和TMPRSS2中哪些结构域介导其相互作用。
在HEK293细胞中共表达野生型或突变型ACE2(缺失PD、CD、CD+TM等)和野生型或酶活性缺失型TMPRSS2(S441A、R255Q),通过免疫共沉淀和western blot分析相互作用和切割。
探讨ACE2是否也参与其他TMPRSS2底物(如MERS-CoV S)的激活。
在Calu-3细胞中用PPMO敲低ACE2,感染MERS-CoV(MOI 0.001),通过TCID50测定病毒滴度,并通过western blot检测S蛋白切割情况。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F-12 Ham (1:1)培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 病毒扩增 | TPCK处理的胰蛋白酶 | Sigma | -- |
| 质粒构建 | Q5定点突变试剂盒 | New England Biolabs | -- |
| 基因敲低 | PPMO ACE2-AUG | Gene Tools, LLC | -- |
| PPMO ACE2-UTR | Gene Tools, LLC | -- | |
| PPMO ACE2-e5i5 | Gene Tools, LLC | -- | |
| Scramble PPMO | Gene Tools, LLC | -- | |
| 蛋白酶活性测定 | 重组人TMPRSS2 | -- | -- |
| 重组人ACE2 | Abcam | ab273297 | |
| Boc-Gln-Ala-Arg-AMC | -- | -- | |
| DX600 | Cayman Chemical | -- | |
| 血管紧张素II转换酶2活性检测试剂盒 | Abcam | ab273297 | |
| 免疫印迹 | 抗ACE2抗体 | Abcam | ab108252 |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab6276 | |
| 抗H1N1pdm抗体 | Sino Biological | 11085-T62 | |
| 抗H7抗体 | Sino Biological | 40103-RP01 | |
| 抗H3抗体 | GeneTex | GTX | |
| 抗HA标签抗体 | Sigma Aldrich | H6908 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma Aldrich | F7425 | |
| CellLytic M细胞裂解试剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| PVDF膜 | GE Healthcare | -- | |
| ChemiDoc XRS+系统 | Bio-Rad | -- | |
| Image Lab软件 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | ThermoFisher | -- |
| 免疫共沉淀 | NP40缓冲液 | -- | -- |
| Protein-A-Sepharose树脂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | ThermoFisher | -- | |
| 抗HA标签琼脂糖珠 | Sigma-Aldrich | -- | |
| ANTI-FLAG M2亲和凝胶 | Sigma Aldrich | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo试剂盒 | -- | -- |
| 蛋白表达 | ExpiSf9细胞 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 镍亲和树脂 | -- | -- | |
| 蛋白纯化 | Hiload 26/600 Superdex 75凝胶过滤柱 | Cytiva | -- |
| 蛋白表达 | 肠激酶 | New England Biolabs | -- |
| DH10 Bac细胞 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ACE2对TMPRSS2酶活性测定 | 重组TMPRSS2和ACE2的浓度及活性单位;底物浓度;DX600浓度;反应温度和时长 阅读提示:参见“Measurement of protease activities”部分,以及图2的图注 |
| 细胞培养和病毒感染 | 细胞系(Calu-3、Caco-2、HEK293)及培养条件;病毒株(H1N1pdm、H3N2、H7N7、MERS-CoV)及MOI;感染时间和孵育时间 阅读提示:参见“Cells and viruses”及“IAV infection of cells for multicycle viral replication and HA cleavage analysis”部分 |
| PPMO敲低ACE2 | PPMO序列和浓度;处理时间;敲低效率的验证方法(Western blot) 阅读提示:参见“PPMO”和“Knockdown of ACE2 expression in Calu-3 cells using PPMO”部分,以及图3A-B |
| 病毒滴度检测 | 蚀斑实验或TCID50的详细步骤;取样时间点 阅读提示:参见“IAV infection of cells for multicycle viral replication and HA cleavage analysis”及“TCID50 titration”部分 |
| 蛋白切割分析 | 细胞裂解和蛋白提取方法;使用的抗体及稀释度;SDS-PAGE和转膜的具体条件 阅读提示:参见“SDS-PAGE and western blot analysis”部分及相应图注 |
| 免疫共沉淀 | 质粒共转染比例;裂解缓冲液成分;免疫沉淀所用琼脂糖种类;洗涤和洗脱条件 阅读提示:参见“Co-immunoprecipitation assay”部分及图5 |