BRCA1缺陷细胞铁死亡抵抗机制探究
检验BRCA1是否调节铁死亡敏感性,并筛选关键调控因子。
通过定量蛋白质组学比较UWB1.289与UWB-BRCA1细胞,发现GPX4升高;用RSL3和Erastin处理检测细胞死亡、脂质过氧化,并在BRCA1突变组织样本中检测4-HNE水平。
Targeting GPX4-mediated ferroptosis protection sensitizes BRCA1-deficient cancer cells to PARP inhibitors.
包含定量蛋白质组学、体外细胞实验(脂质过氧化、细胞死亡、克隆形成)、体内异种移植瘤模型、患者来源类器官及临床样本IHC验证,机制上采用IP、PLA、体外泛素化及质谱鉴定。
卵巢癌细胞系UWB1.289、A2780、SKOV3、OVCAR3、HCC1937 BRCA1缺陷卵巢癌细胞系UWB1.289 BRCA1敲除A2780细胞系 BRCA1突变卵巢癌类器官(PDO) A2780异种移植瘤裸鼠模型
BRCA1表达状态(野生型/缺陷型/敲除) GPX4蛋白水平及泛素化状态 脂质过氧化水平(BODIPY 581/591 C11染色) 细胞死亡(PI染色)及克隆形成能力 体内肿瘤生长曲线(肿瘤体积和重量)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检验BRCA1是否调节铁死亡敏感性,并筛选关键调控因子。
通过定量蛋白质组学比较UWB1.289与UWB-BRCA1细胞,发现GPX4升高;用RSL3和Erastin处理检测细胞死亡、脂质过氧化,并在BRCA1突变组织样本中检测4-HNE水平。
验证BRCA1是否通过泛素-蛋白酶体途径降解GPX4。
通过Western blot检测GPX4蛋白水平,CHX追踪实验分析GPX4降解速率,MG132抑制蛋白酶体后观察GPX4积累,并在患者卵巢癌组织中分析GPX4与BRCA1的相关性。
确认BRCA1与GPX4的直接结合并定位结合区域。
采用免疫共沉淀(IP)、邻近连接分析(PLA)和体外结合实验,检测BRCA1/BARD1与GPX4的相互作用;利用BRCA1截短突变体定位GPX4结合域。
确定BRCA1是否作为E3连接酶催化GPX4多聚泛素化及具体泛素化位点。
在体内外泛素化实验中,检测BRCA1对GPX4多聚泛素化的影响;通过质谱鉴定GPX4的泛素化位点,并用突变体验证K47和K58的关键作用。
评估GPX4在BRCA1缺陷卵巢癌发生发展中的作用。
在BRCA1-KO A2780异种移植瘤模型中,使用胆固醇修饰的GPX4 siRNA进行瘤内注射,检测肿瘤生长和铁死亡标志物。
验证抑制GPX4是否能增强BRCA1缺陷细胞对PARP抑制剂的敏感性。
在BRCA1缺陷细胞中沉默GPX4,检测PARP抑制剂奥拉帕利诱导的脂质过氧化、细胞死亡和克隆形成。
评估PARP抑制剂与GPX4抑制剂联合在BRCA1缺陷癌症中的协同抗肿瘤效果。
在细胞、患者来源类器官和异种移植瘤中,使用奥拉帕利和ML210联合处理,评估肿瘤生长抑制、细胞死亡和脂质过氧化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 乳腺上皮细胞生长培养基 | Lonza | #CC-3150 | |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| MycoBlue支原体检测试剂 | Vazyme | D101-01 | |
| 细胞转染 | ExFect转染试剂 | Vazyme | -- |
| 类器官培养 | 卵巢癌类器官培养基 | K2 Oncology | #K2O-M-OA |
| 类器官活力检测 | Cell Titer-Glo活力检测试剂 | Promega | #G9683 |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11荧光探针 | Invitrogen | D3861 |
| 流式细胞术 | Accuri C6流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 邻近连接分析 | Duolink In Situ Red Starter Kit(小鼠/兔) | MilliporeSigma | DUO92101 |
| 免疫荧光显微镜 | Leica SP8共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- |
| 免疫沉淀 | anti-Flag M2亲和凝胶 | Sigma-Aldrich | A2220 |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | sc-2003 | |
| Western blot | 抗BRCA1抗体(sc-6954) | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 抗GPX4抗体(67763-1-Ig) | Proteintech | -- | |
| 抗SLC7A11抗体(26864-1-AP) | Proteintech | -- | |
| 抗泛素抗体(#3936) | Cell Signaling Technology | -- | |
| 免疫组织化学 | VECTASTAIN通用快速试剂盒 | Vector Laboratories | PK-8800 |
| 基因敲除 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| G418 | -- | -- | |
| 细胞凋亡检测 | FITC-Annexin V细胞凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | 556547 |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Dojindo | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Solarbio | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green预混液 | Vazyme | -- |
| 亚细胞分离 | 细胞质提取试剂盒 | Beyotime | P0028 |
| 体内siRNA递送 | 体内胆固醇修饰的GPX4 siRNA | Ribobio | -- |
| 质谱分析 | Q-Exactive plus质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Easy nLC液相色谱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Q Exactive质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| Proteome Discoverer 2.4软件 | -- | -- | |
| MaxQuant 1.6.14软件 | -- | -- | |
| 体外泛素化 | 重组GPX4蛋白 | Cayman Chemical | #26906 |
| 泛素激活酶E1/UBA1 | Sino Biological | 11990-H20B-50 | |
| 人重组泛素结合酶E2 UBCH5C | Solarbio | P00347 | |
| 重组泛素 | Cayman Chemical | 20487 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件(如UWB1.289培养基配比)、FBS浓度、支原体检测 阅读提示:Materials and methods 2.3 Cell culture and transfection |
| 脂质过氧化检测 | 细胞密度、RSL3浓度、BODIPY 581/591 C11浓度、处理时间 阅读提示:Materials and methods 2.9 Lipid peroxidation assay |
| 细胞死亡检测 | PI浓度、处理时间 阅读提示:Materials and methods 2.14 Cell death and viability assay |
| 泛素化检测 | MG132处理时间和浓度、转染质粒组合 阅读提示:Materials and methods 2.11 Ubiquitination assay |
| 异种移植瘤实验 | 小鼠品系、周龄、接种细胞数和体积、药物剂量和给药方式 阅读提示:Materials and methods 2.5 Ovarian cancer xenograft |